SAMN02116449
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-05-03T12:29:31.177Z
INSDC first public
2013-05-06T13:47:12.387Z
INSDC last update
SRS418799
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS418799
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,CKDHL0306;TGCA,CKDHL0314;ACTA,CKDHL0322;CAGA,CKDHL0330;AACT,CKDHL0339;GCGT,CKDHL0347;TGCGA,CKDHL0357;CGAT,CKDHL0366;CGCTT,CKDHL0375;TCACC,CKDHL0383;CTAGC,CKDHL0392;ACAAA,CKDHL0403;TTCTC,CKDHL0307;AGCCC,CKDHL0315;GTATT,CKDHL0323;CTGTA,CKDHL0331;ACCGT,CKDHL0340;GTAA,CKDHL0348;GGTTGT,CKDHL0359;CCAGCT,CKDHL0368;TTCAGA,CKDHL0376;TAGGAA,CKDHL0384;GCTCTA,CKDHL0393;CCACAA,CKDHL0404;GCTTA,CKDHL0308;CTTCCA,CKDHL0316;GAGATA,CKDHL0324;ATGCCT,CKDHL0332;TATTTTT,CKDHL0341;CTTGCTT,CKDHL0349;ATGAAAC,CKDHL0360;AAAAGTT,CKDHL0369;GAATTCA,CKDHL0377;GAACTTC,CKDHL0385;GGACCTA,CKDHL0394;GTCGATT,CKDHL0405;AACGCCT,CKDHL0309;AATATGC,CKDHL0317;ACGACTAC,CKDHL0325;GGTGT,CKDHL0333;TAGCATGC,CKDHL0342;AGTGGA,CKDHL0351;TAGGCCAT,CKDHL0361;TGCAAGGA,CKDHL0370;TGGTACGT,CKDHL0378;TCTCAGTC,CKDHL0386;CCGGATAT,CKDHL0396;CGCCTTAT,CKDHL0406;AGGC,CKDHL0310;GATC,CKDHL0318;TCAC,CKDHL0326;AGGAT,CKDHL0334;ATTGA,CKDHL0343;CATCT,CKDHL0352;CCTAC,CKDHL0362;GAGGA,CKDHL0371;GGAAC,CKDHL0379;GTCAA,CKDHL0387;TAATA,CKDHL0397;TACAT,CKDHL0407;TCGTT,CKDHL0311;ACCTAA,CKDHL0319;ATATGT,CKDHL0327;ATCGTA,CKDHL0335;CATCGT,CKDHL0344;CGCGGT,CKDHL0354;CTATTA,CKDHL0363;GCCAGT,CKDHL0372;GGAAGA,CKDHL0380;GTACTT,CKDHL0389;GTTGAA,CKDHL0398;TAACGA,CKDHL0408;TGGCTA,CKDHL0312;ACGTGTT,CKDHL0320;ATTAATT,CKDHL0328;ATTGGAT,CKDHL0336;CATAAGT,CKDHL0345;CGCTGAT,CKDHL0355;CGGTAGA,CKDHL0364;CTACGGA,CKDHL0373;GCGGAAT,CKDHL0381;TAGCGGA,CKDHL0390;TCGAAGA,CKDHL0400;TCTGTGA,CKDHL0416;TGCTGGA,CKDHL0313;AACCGAGA,CKDHL0321;ACAGGGAA,CKDHL0329;ACGTGGTA,CKDHL0338;CCATGGGT,CKDHL0346;CGCGGAGA,CKDHL0356;CGTGTGGT,CKDHL0365;GCTGTGGA,CKDHL0374;GGATTGGT,CKDHL0382;GTGAGGGT,CKDHL0391;TATCGGGA,CKDHL0401;TTCCTGGA,CKDHL0417;)
description
Zea mays
http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_4577
organism
pooled
http://www.ebi.ac.uk/efo/EFO_0000663
strain
Generic sample from Zea mays
title