SAMN02116472
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-05-03T12:29:23.953Z
INSDC first public
2013-05-06T14:21:12.253Z
INSDC last update
SRS418830
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS418830
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (AGGC,MARS-WEMA_270699;TCAAGTT,MARS-WEMA_270795;ATGACGC,MARS-WEMA_271652;CGCTTGAA,MARS-WEMA_271747;GATT,MARS-WEMA_270707;GATCATA,MARS-WEMA_270803;TATTGCA,MARS-WEMA_271660;ATCGGTGT,MARS-WEMA_271754;CGAA,MARS-WEMA_270715;GCATTGA,MARS-WEMA_270811;GGATATC,MARS-WEMA_271668;CCTACCGA,MARS-WEMA_271762;GTCC,MARS-WEMA_270723;CAGGTAT,MARS-WEMA_270819;CCGAGCT,MARS-WEMA_271676;GGACAATA,MARS-WEMA_271770;ACAT,MARS-WEMA_270731;TGCAATA,MARS-WEMA_270827;TTGATAC,Blank;AACGGAAT,MARS-WEMA_271778;GCGA,MARS-WEMA_270739;ATATCGT,MARS-WEMA_270835;CACGACT,MARS-WEMA_271691;TCGATGGT,MARS-WEMA_271786;TGCT,MARS-WEMA_270747;AGTCTAT,MARS-WEMA_270843;ATCTAGC,MARS-WEMA_271699;GTTCATTA,MARS-WEMA_271794;CCTC,MARS-WEMA_270755;GTCTGAA,MARS-WEMA_270851;TGAATTC,MARS-WEMA_271707;GAATCGAA,MARS-WEMA_271802;AACA,MARS-WEMA_270763;ATCAGTT,MARS-WEMA_270859;CGGCTCA,MARS-WEMA_271715;CATGGTGT,MARS-WEMA_271810;CTGT,MARS-WEMA_270771;CAGTTGA,MARS-WEMA_270867;GGTACAC,MARS-WEMA_271723;TGGCTATT,MARS-WEMA_271818;TAAC,MARS-WEMA_270779;TGTGCAA,MARS-WEMA_270875;AATGTCT,MARS-WEMA_271731;ACCACCGT,MARS-WEMA_271826;CTCGA,MARS-WEMA_270787;CGACAGT,MARS-WEMA_270883;TCATGAC,MARS-WEMA_271739;CTATGTAA,MARS-WEMA_271834;ACCGT,MARS-WEMA_270700;ACGTGTA,MARS-WEMA_270796;TTCGGAC,MARS-WEMA_271653;AACGAGTA,MARS-WEMA_271748;CGTCA,MARS-WEMA_270708;GATGCAT,MARS-WEMA_270804;GCTTAGC,MARS-WEMA_271661;CCGACCAT,MARS-WEMA_271755;TCGCA,MARS-WEMA_270716;CTAATGT,MARS-WEMA_270812;ACTGCCA,MARS-WEMA_271669;TGTCTTAA,MARS-WEMA_271763;CGCAT,MARS-WEMA_270724;GTCGATA,MARS-WEMA_270820;TAGTACT,MARS-WEMA_271677;GTATACTA,MARS-WEMA_271771;GCACT,MARS-WEMA_270732;TATACGT,MARS-WEMA_270828;GACACTC,MARS-WEMA_271684;TGTGCAGT,MARS-WEMA_271779;AGCTA,MARS-WEMA_270740;GCGTAAT,MARS-WEMA_270836;CGAGTAC,MARS-WEMA_271692;ATGCTGGT,MARS-WEMA_271787;CAGCT,MARS-WEMA_270748;AGCGTTA,MARS-WEMA_270844;ATATGTC,MARS-WEMA_271700;GCAAGTAA,MARS-WEMA_271795;TCAGC,MARS-WEMA_270756;ATCCGGA,MARS-WEMA_270852;TGGACCT,MARS-WEMA_271708;CAGGAATA,MARS-WEMA_271803;CATGC,MARS-WEMA_270764;TCAGTAT,MARS-WEMA_270860;CATATGC,MARS-WEMA_271716;GTCTGGAT,MARS-WEMA_271811;GCTAC,MARS-WEMA_270772;CAATGTT,MARS-WEMA_270868;TTCGCCA,MARS-WEMA_271724;CACCACGT,MARS-WEMA_271819;CTGAC,MARS-WEMA_270780;GTTACGA,MARS-WEMA_270876;AGTTACT,MARS-WEMA_271732;TCATTGTA,MARS-WEMA_271827;GACTC,MARS-WEMA_270788;TGCATAT,MARS-WEMA_270884;GTGCCAC,MARS-WEMA_271740;GGTTCATT,MARS-WEMA_271835;ACGTC,MARS-WEMA_270701;CAGCGTA,MARS-WEMA_270797;ACCGGTC,MARS-WEMA_271654;AAGATCGA,MARS-WEMA_271749;CGATC,MARS-WEMA_270709;AGTTCGA,MARS-WEMA_270805;CGGTAGC,MARS-WEMA_271662;CGAAGAAT,MARS-WEMA_271756;ATGCGT,MARS-WEMA_270717;GCTAATT,MARS-WEMA_270813;GCAGTTC,MARS-WEMA_271670;TCTGATTA,MARS-WEMA_271764;TCCAGT,MARS-WEMA_270725;ACGCTGA,MARS-WEMA_270821;TATAGTC,MARS-WEMA_271678;ATCTCTGA,MARS-WEMA_271772;GCTTGA,MARS-WEMA_270733;TAAGCTT,MARS-WEMA_270829;ACTCCGC,MARS-WEMA_271685;AAGCAGAT,MARS-WEMA_271780;TCCGTA,MARS-WEMA_270741;CTTAGAT,MARS-WEMA_270837;GTATTAC,MARS-WEMA_271693;TGCGGATT,MARS-WEMA_271788;TCGGAT,MARS-WEMA_270749;TGATACA,MARS-WEMA_270845;TGAGCGC,MARS-WEMA_271701;CTCCTCGA,MARS-WEMA_271796;GTCTTA,MARS-WEMA_270757;ACCGAGT,MARS-WEMA_270853;GAGTCGC,MARS-WEMA_271709;GGTACTAT,MARS-WEMA_271804;CGGAGT,MARS-WEMA_270765;GTACTTA,MARS-WEMA_270861;ATTGATC,MARS-WEMA_271717;ACAGGATA,MARS-WEMA_271812;CGTCTA,MARS-WEMA_270773;ATGTCAA,MARS-WEMA_270869;TCCACGC,MARS-WEMA_271725;GATCTGGT,MARS-WEMA_271820;CACGTT,MARS-WEMA_270781;CACAGGT,MARS-WEMA_270877;GTTATTC,MARS-WEMA_271733;CTGAAGAA,MARS-WEMA_271828;GTTAGC,MARS-WEMA_270789;GGTGGCA,MARS-WEMA_270885;ATGCACC,MARS-WEMA_271741;TCCGCCAA,MARS-WEMA_271836;AGCATT,MARS-WEMA_270702;CTGAATT,MARS-WEMA_270798;TATGTAC,MARS-WEMA_271655;ATATTCGT,MARS-WEMA_271750;CTCCGA,MARS-WEMA_270710;TCGTTAA,MARS-WEMA_270806;AGACAAGT,MARS-WEMA_271663;CGGTGATT,MARS-WEMA_271757;TTGGCA,MARS-WEMA_270718;TGATCAT,MARS-WEMA_270814;GGCCGAGT,MARS-WEMA_271671;TATGCTGA,MARS-WEMA_271765;CCACGT,MARS-WEMA_270726;CGTCGGA,MARS-WEMA_270822;AACAAGGT,MARS-WEMA_271679;GAACAGTT,MARS-WEMA_271773;GATGTC,MARS-WEMA_270734;GACTATT,MARS-WEMA_270830;TAACGAGA,MARS-WEMA_271686;ACGATTAA,MARS-WEMA_271781;TGTTAC,MARS-WEMA_270742;TAGGTCA,MARS-WEMA_270838;ATACAGGA,MARS-WEMA_271694;GGTTACGT,MARS-WEMA_271789;CAGTTA,MARS-WEMA_270750;GCAACGT,MARS-WEMA_270846;CACAGAGT,MARS-WEMA_271702;TTACGGTA,MARS-WEMA_271797;GCCTAT,MARS-WEMA_270758;ACTTGAT,MARS-WEMA_270854;CGGCAGGT,MARS-WEMA_271710;CACGCCAT,MARS-WEMA_271805;AGTGGC,MARS-WEMA_270766;TCTGATA,MARS-WEMA_270862;GCGCGTGA,MARS-WEMA_271718;TCGAGATA,MARS-WEMA_271813;TGACCT,MARS-WEMA_270774;ATAGTCA,MARS-WEMA_270870;ACAATGGA,MARS-WEMA_271726;AGAACTGA,MARS-WEMA_271821;TTGCAC,MARS-WEMA_270782;TAGCCAT,MARS-WEMA_270878;ACAAGAGT,MARS-WEMA_271734;GTTCTAAT,MARS-WEMA_271829;CTAGCT,MARS-WEMA_270790;AGGAGTC,MARS-WEMA_270886;GAACATGA,MARS-WEMA_271742;CCTTAGAA,MARS-WEMA_271837;TAGTGC,MARS-WEMA_270703;GTAGAGC,MARS-WEMA_270799;CAAGAAGT,MARS-WEMA_271656;GACTGTGT,MARS-WEMA_271751;GTTCCA,MARS-WEMA_270711;GACCTAT,MARS-WEMA_270807;GTCATGGT,MARS-WEMA_271664;CGCGCCTA,MARS-WEMA_271758;TGAATC,MARS-WEMA_270719;CATTAGT,MARS-WEMA_270815;AACAGTGA,MARS-WEMA_271672;TTGCATAT,MARS-WEMA_271766;CGCCAT,MARS-WEMA_270727;ATTAGCA,MARS-WEMA_270823;GTGCAAGA,MARS-WEMA_271680;GCTATAGA,MARS-WEMA_271774;ATCGTC,MARS-WEMA_270735;GAATCTA,MARS-WEMA_270831;CAATAGGA,MARS-WEMA_271687;ACAGCCTT,MARS-WEMA_271782;GTCACT,MARS-WEMA_270743;TGTCATT,MARS-WEMA_270839;TGCAGTGT,MARS-WEMA_271695;CTGTGGTA,MARS-WEMA_271790;CATCGC,MARS-WEMA_270751;GCCAGAT,MARS-WEMA_270847;AGGCTAGA,MARS-WEMA_271703;TGCTTAAT,MARS-WEMA_271798;AGGTCT,MARS-WEMA_270759;CCAGGTA,MARS-WEMA_270855;CTAGTGGT,MARS-WEMA_271711;AATGACGA,MARS-WEMA_271806;CCTGCA,MARS-WEMA_270767;TGGCAAC,MARS-WEMA_270863;GCTAGTGT,MARS-WEMA_271719;AGAACGAT,MARS-WEMA_271814;GTACTC,MARS-WEMA_270775;ATGATCT,MARS-WEMA_270871;GCTGCGGA,MARS-WEMA_271727;GTGCGATT,MARS-WEMA_271822;ACCTGC,MARS-WEMA_270783;CATGTTA,MARS-WEMA_270879;TCGCAAGT,MARS-WEMA_271735;CTAATTGA,MARS-WEMA_271830;CTTGAC,MARS-WEMA_270791;TGTAAGC,MARS-WEMA_270887;CGATGTGT,MARS-WEMA_271743;TAGCAGTA,MARS-WEMA_271838;ACCGCT,MARS-WEMA_270704;ACGGCAT,MARS-WEMA_270800;AACGTAGA,MARS-WEMA_271657;TCCGATAT,MARS-WEMA_271752;GCTCAC,MARS-WEMA_270712;TTCTTGA,MARS-WEMA_270808;CTCACGGA,MARS-WEMA_271665;GCCTCCGA,MARS-WEMA_271759;CTATGC,MARS-WEMA_270720;GGACCTT,MARS-WEMA_270816;TAGCGTGT,MARS-WEMA_271673;AGTCGTGT,MARS-WEMA_271767;CAGCCT,MARS-WEMA_270728;GTGTACA,MARS-WEMA_270824;ACGTAAGA,MARS-WEMA_271681;CATGTATT,MARS-WEMA_271775;GCCATC,MARS-WEMA_270736;TAGCGGC,MARS-WEMA_270832;CGTATGGT,MARS-WEMA_271688;TGAAGCAA,MARS-WEMA_271783;CGCTCA,MARS-WEMA_270744;CGCTTAA,MARS-WEMA_270840;GTACGTGT,MARS-WEMA_271696;GCATTGGT,MARS-WEMA_271791;ACGCTC,MARS-WEMA_270752;GATAGCT,MARS-WEMA_270848;TTCGAAGA,MARS-WEMA_271704;AAGCGATA,MARS-WEMA_271799;CTGATC,MARS-WEMA_270760;AGAGCCT,MARS-WEMA_270856;AATACGGA,MARS-WEMA_271712;GTCAATAT,MARS-WEMA_271807;CCAGTC,MARS-WEMA_270768;TACGAGC,MARS-WEMA_270864;TGACTGGT,MARS-WEMA_271720;CGGCCGTA,MARS-WEMA_271815;TACGCC,MARS-WEMA_270776;TTGACTA,MARS-WEMA_270872;GCGGATGT,MARS-WEMA_271728;TTAGTCGA,MARS-WEMA_271823;CCGTAC,Blank;CGCCGAT,MARS-WEMA_270880;CATTGAGA,MARS-WEMA_271736;GACTCAAT,MARS-WEMA_271831;TCGACC,MARS-WEMA_270792;AATTGGC,MARS-WEMA_270888;GTAACAGA,MARS-WEMA_271744;ACTAGGAA,BREAD-0046;GCATCC,MARS-WEMA_270705;ATACTGC,MARS-WEMA_270801;AGCTTGGT,MARS-WEMA_271658;CGCAACTT,Blank;CGTACC,MARS-WEMA_270713;GCGGCTA,MARS-WEMA_270809;ACAGATGA,MARS-WEMA_271666;TCGGTTGA,MARS-WEMA_271760;ATTCAGT,MARS-WEMA_270721;CGTTATA,MARS-WEMA_270817;CAGTTGGT,MARS-WEMA_271674;AATTCTGT,MARS-WEMA_271768;TATCTGA,MARS-WEMA_270729;TTAGACT,MARS-WEMA_270825;TGCAAGAA,MARS-WEMA_271682;CTAGAGTA,MARS-WEMA_271776;TTCAAGT,MARS-WEMA_270737;AGGTTAC,MARS-WEMA_270833;ACTCGAGA,MARS-WEMA_271689;GCGCGCAT,MARS-WEMA_271784;GAGCAGT,MARS-WEMA_270745;GGCAACT,MARS-WEMA_270841;GGAGCTGT,MARS-WEMA_271697;CGATTAGA,MARS-WEMA_271792;TCTAGGA,MARS-WEMA_270753;TCACCGA,MARS-WEMA_270849;CTGAGTGT,MARS-WEMA_271705;ATTCAGTT,MARS-WEMA_271800;ACACGGT,MARS-WEMA_270761;AAGGTTC,MARS-WEMA_270857;GATCAGAA,MARS-WEMA_271713;TTGACAAT,MARS-WEMA_271808;GACGTGA,MARS-WEMA_270769;CTAGCAT,MARS-WEMA_270865;TGCATAGA,MARS-WEMA_271721;TACGTTAA,MARS-WEMA_271816;TCATAGT,MARS-WEMA_270777;AGCTGCA,MARS-WEMA_270873;GAACGAAT,MARS-WEMA_271729;AGATACGA,MARS-WEMA_271824;TTACGAT,MARS-WEMA_270785;AGTACTT,MARS-WEMA_270881;TTGGCGGA,MARS-WEMA_271737;GCTGGATT,MARS-WEMA_271832;GGCTAGA,MARS-WEMA_270793;TAATTGC,Blank;CGCCGCAT,MARS-WEMA_271745;GACACCTT,BREAD-0048;AATCGTT,MARS-WEMA_270706;GCTGGAC,MARS-WEMA_270802;ACGTGTGT,MARS-WEMA_271659;CCGCCTAA,MARS-WEMA_271753;CTATGGA,MARS-WEMA_270714;GTCATCA,MARS-WEMA_270810;CAAGTGAA,MARS-WEMA_271667;TTCTTGGA,MARS-WEMA_271761;TACGGTA,MARS-WEMA_270722;CAGTGAC,MARS-WEMA_270818;GTTAACGA,MARS-WEMA_271675;CAACGCTT,MARS-WEMA_271769;ACTATGT,MARS-WEMA_270730;GCACACT,MARS-WEMA_270826;TCGTGGAT,MARS-WEMA_271683;AGCAGATA,MARS-WEMA_271777;CGTGAAT,MARS-WEMA_270738;AAGTCTT,MARS-WEMA_270834;AGCGATAA,MARS-WEMA_271690;TCTTAGGT,MARS-WEMA_271785;TTGCAGA,MARS-WEMA_270746;TGTATCA,MARS-WEMA_270842;CCACCAGT,MARS-WEMA_271698;GTGGCTAT,MARS-WEMA_271793;AACTTGT,MARS-WEMA_270754;CTGGAAC,MARS-WEMA_270850;GGCGTGTA,MARS-WEMA_271706;AGACTGAA,MARS-WEMA_271801;TGACGTA,MARS-WEMA_270762;ATTCGAC,MARS-WEMA_270858;AAGACAGT,MARS-WEMA_271714;CATAATGA,MARS-WEMA_271809;GCTATAA,MARS-WEMA_270770;CAAGATC,MARS-WEMA_270866;TTGTGCGA,MARS-WEMA_271722;GTGTCAGT,MARS-WEMA_271817;ATCGTAT,MARS-WEMA_270778;TCGCGCA,MARS-WEMA_270874;GAAGACAT,MARS-WEMA_271730;AGTGGCTT,MARS-WEMA_271825;TACTGAT,MARS-WEMA_270786;AGTGTGC,MARS-WEMA_270882;TGTCAAGA,MARS-WEMA_271738;CCACTGCA,MARS-WEMA_271833;CTTGAGA,MARS-WEMA_270794;GAATTCT,MARS-WEMA_270890;GCGAGGTT,MARS-WEMA_271746;TACAGGAT,BREAD-2566;)
description
Zea mays
http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_4577
organism
pooled
http://www.ebi.ac.uk/efo/EFO_0000663
strain
Generic sample from Zea mays
title