SAMN02116451
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-05-03T12:29:30.597Z
INSDC first public
2013-05-06T13:47:14.813Z
INSDC last update
SRS418801
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS418801
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,CKDHL0526;TGCA,CKDHL0537;ACTA,CKDHL0545;CAGA,CKDHL0554;AACT,CKDHL0568;GCGT,CKDHL0576;TGCGA,CKDHL0584;CGAT,CKDHL0592;CGCTT,CKDHL0600;TCACC,CKDHL0608;CTAGC,CKDHL0616;ACAAA,CKDHL0626;TTCTC,CKDHL0527;AGCCC,CKDHL0538;GTATT,CKDHL0546;CTGTA,CKDHL0555;ACCGT,CKDHL0569;GTAA,CKDHL0577;GGTTGT,CKDHL0585;CCAGCT,CKDHL0593;TTCAGA,CKDHL0601;TAGGAA,CKDHL0609;GCTCTA,CKDHL0617;CCACAA,CKDHL0627;GCTTA,CKDHL0529;CTTCCA,CKDHL0539;GAGATA,CKDHL0548;ATGCCT,CKDHL0558;TATTTTT,CKDHL0570;CTTGCTT,CKDHL0578;ATGAAAC,CKDHL0586;AAAAGTT,CKDHL0594;GAATTCA,CKDHL0602;GAACTTC,CKDHL0610;GGACCTA,CKDHL0618;GTCGATT,CKDHL0628;AACGCCT,CKDHL0531;AATATGC,CKDHL0540;ACGACTAC,CKDHL0549;GGTGT,CKDHL0559;TAGCATGC,CKDHL0571;AGTGGA,CKDHL0579;TAGGCCAT,CKDHL0587;TGCAAGGA,CKDHL0595;TGGTACGT,CKDHL0603;TCTCAGTC,CKDHL0611;CCGGATAT,CKDHL0619;CGCCTTAT,CKDHL0629;AGGC,CKDHL0533;GATC,CKDHL0541;TCAC,CKDHL0550;AGGAT,CKDHL0562;ATTGA,CKDHL0572;CATCT,CKDHL0580;CCTAC,CKDHL0588;GAGGA,CKDHL0596;GGAAC,CKDHL0604;GTCAA,CKDHL0612;TAATA,CKDHL0620;TACAT,CKDHL0631;TCGTT,CKDHL0534;ACCTAA,CKDHL0542;ATATGT,CKDHL0551;ATCGTA,CKDHL0564;CATCGT,CKDHL0573;CGCGGT,CKDHL0581;CTATTA,CKDHL0589;GCCAGT,CKDHL0597;GGAAGA,CKDHL0605;GTACTT,CKDHL0613;GTTGAA,CKDHL0621;TAACGA,CKDHL0634;TGGCTA,CKDHL0535;ACGTGTT,CKDHL0543;ATTAATT,CKDHL0552;ATTGGAT,CKDHL0566;CATAAGT,CKDHL0574;CGCTGAT,CKDHL0582;CGGTAGA,CKDHL0590;CTACGGA,CKDHL0598;GCGGAAT,CKDHL0606;TAGCGGA,CKDHL0614;TCGAAGA,CKDHL0623;TCTGTGA,CKDHL0635;TGCTGGA,CKDHL0536;AACCGAGA,CKDHL0544;ACAGGGAA,CKDHL0553;ACGTGGTA,CKDHL0567;CCATGGGT,CKDHL0575;CGCGGAGA,CKDHL0583;CGTGTGGT,CKDHL0591;GCTGTGGA,CKDHL0599;GGATTGGT,CKDHL0607;GTGAGGGT,CKDHL0615;TATCGGGA,CKDHL0624;TTCCTGGA,CKDHL0638;)
description
Zea mays
http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_4577
organism
pooled
http://www.ebi.ac.uk/efo/EFO_0000663
strain
Generic sample from Zea mays
title