SAMN02116455
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-05-03T12:29:29.400Z
INSDC first public
2013-05-06T13:47:30.597Z
INSDC last update
SRS418805
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS418805
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,KE_Maize389;TGCA,KE_Maize398;ACTA,KE_Maize408;CAGA,KE_Maize540;AACT,KE_Maize573;GCGT,KE_Maize584;TGCGA,KE_Maize593;CGAT,KE_Maize605;CGCTT,KE_Maize622;TCACC,KE_Maize633;CTAGC,KE_Maize646;ACAAA,KE_Maize681;TTCTC,KE_Maize390;AGCCC,KE_Maize399;GTATT,KE_Maize409;CTGTA,KE_Maize541;ACCGT,KE_Maize575;GTAA,KE_Maize585;GGTTGT,KE_Maize596;CCAGCT,KE_Maize606;TTCAGA,KE_Maize623;TAGGAA,KE_Maize634;GCTCTA,KE_Maize653;CCACAA,KE_Maize682;GCTTA,KE_Maize391;CTTCCA,KE_Maize400;GAGATA,KE_Maize411;ATGCCT,KE_Maize566;TATTTTT,KE_Maize576;CTTGCTT,KE_Maize586;ATGAAAC,KE_Maize597;AAAAGTT,KE_Maize613;GAATTCA,KE_Maize624;GAACTTC,KE_Maize635;GGACCTA,KE_Maize654;GTCGATT,KE_Maize683;AACGCCT,KE_Maize392;AATATGC,KE_Maize401;ACGACTAC,KE_Maize412;GGTGT,KE_Maize567;TAGCATGC,KE_Maize577;AGTGGA,KE_Maize587;TAGGCCAT,KE_Maize599;TGCAAGGA,KE_Maize615;TGGTACGT,KE_Maize626;TCTCAGTC,KE_Maize636;CCGGATAT,KE_Maize655;CGCCTTAT,KE_Maize685;AGGC,KE_Maize394;GATC,KE_Maize402;TCAC,KE_Maize424;AGGAT,KE_Maize568;ATTGA,KE_Maize578;CATCT,KE_Maize589;CCTAC,KE_Maize601;GAGGA,KE_Maize617;GGAAC,KE_Maize627;GTCAA,KE_Maize638;TAATA,KE_Maize677;TACAT,KE_Maize693;TCGTT,KE_Maize395;ACCTAA,KE_Maize403;ATATGT,KE_Maize425;ATCGTA,KE_Maize569;CATCGT,KE_Maize580;CGCGGT,KE_Maize590;CTATTA,KE_Maize602;GCCAGT,KE_Maize618;GGAAGA,KE_Maize628;GTACTT,KE_Maize639;GTTGAA,KE_Maize678;TAACGA,KE_Maize694;TGGCTA,KE_Maize396;ACGTGTT,KE_Maize404;ATTAATT,KE_Maize434;ATTGGAT,KE_Maize571;CATAAGT,KE_Maize582;CGCTGAT,KE_Maize591;CGGTAGA,KE_Maize1120;CTACGGA,KE_Maize619;GCGGAAT,KE_Maize629;TAGCGGA,KE_Maize641;TCGAAGA,KE_Maize679;TCTGTGA,KE_Maize695;TGCTGGA,KE_Maize397;AACCGAGA,KE_Maize406;ACAGGGAA,KE_Maize536;ACGTGGTA,KE_Maize572;CCATGGGT,KE_Maize583;CGCGGAGA,KE_Maize592;CGTGTGGT,KE_Maize1121;GCTGTGGA,KE_Maize621;GGATTGGT,KE_Maize630;GTGAGGGT,KE_Maize642;TATCGGGA,KE_Maize680;TTCCTGGA,KE_Maize696;)
description
Zea mays
http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_4577
organism
pooled
http://www.ebi.ac.uk/efo/EFO_0000663
strain
Generic sample from Zea mays
title