SAMN02086280
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-04-30T11:29:02.950Z
INSDC first public
2013-04-30T21:49:13.563Z
INSDC last update
SRS417499
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS417499
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,NSL30909;TGCA,PI531085;ACTA,Ames2340;CAGA,NSL29285;AACT,PI511311;GCGT,NSL30903;TGCGA,Ames29004;CGAT,Ames26775;CGCTT,PI340830;TCACC,PI596357;CTAGC,Ames23442;ACAAA,Ames24710;TTCTC,Ames19286;AGCCC,SA24;GTATT,PI596503;CTGTA,NSL30883;ACCGT,PI601689;GTAA,PI405711;GGTTGT,PI634206;CCAGCT,PI221794;TTCAGA,Ames24715;TAGGAA,Ames24714;GCTCTA,PI524969;CCACAA,PI531081;GCTTA,PI186192;CTTCCA,Ames28977;GAGATA,NSL65868;ATGCCT,PI358529;TATTTTT,PI601322;CTTGCTT,PI648433;ATGAAAC,PI221789;AAAAGTT,PI567793;GAATTCA,PI601683;GAACTTC,PI233315;GGACCTA,Ames23486;GTCGATT,Ames24734;AACGCCT,PI648432;AATATGC,PI200188;ACGACTAC,PI459078;GGTGT,Ames29008;TAGCATGC,PI583351;AGTGGA,PI358534;TAGGCCAT,NSL30864;TGCAAGGA,PI596504;TGGTACGT,PI601468;TCTCAGTC,Ames28364;CCGGATAT,NSL30835;CGCCTTAT,PI405705;AGGC,NSL197105;GATC,Ames29027;TCAC,Ames28980;AGGAT,PI607512;ATTGA,PI600755;CATCT,Ames26794;CCTAC,PI358537;GAGGA,Ames22041;GGAAC,Ames23398;GTCAA,NSL8585;TAATA,PI524969;TACAT,Ames26021;TCGTT,PI542956;ACCTAA,PI186199;ATATGT,PI405713;ATCGTA,PI553054;CATCGT,Ames23460;CGCGGT,PI391667;CTATTA,PI200181;GCCAGT,PI539930;GGAAGA,PI587129;GTACTT,PI561695;GTTGAA,Ames23415;TAACGA,NSL81598;TGGCTA,Ames23473;ACGTGTT,PI539923;ATTAATT,blank;ATTGGAT,Ames25219;CATAAGT,NSL30901;CGCTGAT,PI303943;CGGTAGA,NSL30865;CTACGGA,Ames19330;GCGGAAT,Ames23391;TAGCGGA,Ames22794;TCGAAGA,PI601724;TCTGTGA,Ames27024;TGCTGGA,NSL75979;AACCGAGA,PI200182;ACAGGGAA,B73;ACGTGGTA,NSL30873;CCATGGGT,Ames14115;CGCGGAGA,NSL75977;CGTGTGGT,NSL30907;GCTGTGGA,NSL8583;GGATTGGT,Ames24707;GTGAGGGT,PI594045;TATCGGGA,Ames24718;TTCCTGGA,Ames24704;CTCC,NSL30909;TGCA,PI531085;ACTA,Ames2340;CAGA,NSL29285;AACT,PI511311;GCGT,NSL30903;TGCGA,Ames29004;CGAT,Ames26775;CGCTT,PI340830;TCACC,PI596357;CTAGC,Ames23442;ACAAA,Ames24710;TTCTC,Ames19286;AGCCC,SA24;GTATT,PI596503;CTGTA,NSL30883;ACCGT,PI601689;GTAA,PI405711;GGTTGT,PI634206;CCAGCT,PI221794;TTCAGA,Ames24715;TAGGAA,Ames24714;GCTCTA,PI524969;CCACAA,PI531081;GCTTA,PI186192;CTTCCA,Ames28977;GAGATA,NSL65868;ATGCCT,PI358529;TATTTTT,PI601322;CTTGCTT,PI648433;ATGAAAC,PI221789;AAAAGTT,PI567793;GAATTCA,PI601683;GAACTTC,PI233315;GGACCTA,Ames23486;GTCGATT,Ames24734;AACGCCT,PI648432;AATATGC,PI200188;ACGACTAC,PI459078;GGTGT,Ames29008;TAGCATGC,PI583351;AGTGGA,PI358534;TAGGCCAT,NSL30864;TGCAAGGA,PI596504;TGGTACGT,PI601468;TCTCAGTC,Ames28364;CCGGATAT,NSL30835;CGCCTTAT,PI405705;AGGC,NSL197105;GATC,Ames29027;TCAC,Ames28980;AGGAT,PI607512;ATTGA,PI600755;CATCT,Ames26794;CCTAC,PI358537;GAGGA,Ames22041;GGAAC,Ames23398;GTCAA,NSL8585;TAATA,PI524969;TACAT,Ames26021;TCGTT,PI542956;ACCTAA,PI186199;ATATGT,PI405713;ATCGTA,PI553054;CATCGT,Ames23460;CGCGGT,PI391667;CTATTA,PI200181;GCCAGT,PI539930;GGAAGA,PI587129;GTACTT,PI561695;GTTGAA,Ames23415;TAACGA,NSL81598;TGGCTA,Ames23473;ACGTGTT,PI539923;ATTAATT,blank;ATTGGAT,Ames25219;CATAAGT,NSL30901;CGCTGAT,PI303943;CGGTAGA,NSL30865;CTACGGA,Ames19330;GCGGAAT,Ames23391;TAGCGGA,Ames22794;TCGAAGA,PI601724;TCTGTGA,Ames27024;TGCTGGA,NSL75979;AACCGAGA,PI200182;ACAGGGAA,B73;ACGTGGTA,NSL30873;CCATGGGT,Ames14115;CGCGGAGA,NSL75977;CGTGTGGT,NSL30907;GCTGTGGA,NSL8583;GGATTGGT,Ames24707;GTGAGGGT,PI594045;TATCGGGA,Ames24718;TTCCTGGA,Ames24704;CTCC,NSL30909;TGCA,PI531085;ACTA,Ames2340;CAGA,NSL29285;AACT,PI511311;GCGT,NSL30903;TGCGA,Ames29004;CGAT,Ames26775;CGCTT,PI340830;TCACC,PI596357;CTAGC,Ames23442;ACAAA,Ames24710;TTCTC,Ames19286;AGCCC,SA24;GTATT,PI596503;CTGTA,NSL30883;ACCGT,PI601689;GTAA,PI405711;GGTTGT,PI634206;CCAGCT,PI221794;TTCAGA,Ames24715;TAGGAA,Ames24714;GCTCTA,PI524969;CCACAA,PI531081;GCTTA,PI186192;CTTCCA,Ames28977;GAGATA,NSL65868;ATGCCT,PI358529;TATTTTT,PI601322;CTTGCTT,PI648433;ATGAAAC,PI221789;AAAAGTT,PI567793;GAATTCA,PI601683;GAACTTC,PI233315;GGACCTA,Ames23486;GTCGATT,Ames24734;AACGCCT,PI648432;AATATGC,PI200188;ACGACTAC,PI459078;GGTGT,Ames29008;TAGCATGC,PI583351;AGTGGA,PI358534;TAGGCCAT,NSL30864;TGCAAGGA,PI596504;TGGTACGT,PI601468;TCTCAGTC,Ames28364;CCGGATAT,NSL30835;CGCCTTAT,PI405705;AGGC,NSL197105;GATC,Ames29027;TCAC,Ames28980;AGGAT,PI607512;ATTGA,PI600755;CATCT,Ames26794;CCTAC,PI358537;GAGGA,Ames22041;GGAAC,Ames23398;GTCAA,NSL8585;TAATA,PI524969;TACAT,Ames26021;TCGTT,PI542956;ACCTAA,PI186199;ATATGT,PI405713;ATCGTA,PI553054;CATCGT,Ames23460;CGCGGT,PI391667;CTATTA,PI200181;GCCAGT,PI539930;GGAAGA,PI587129;GTACTT,PI561695;GTTGAA,Ames23415;TAACGA,NSL81598;TGGCTA,Ames23473;ACGTGTT,PI539923;ATTAATT,blank;ATTGGAT,Ames25219;CATAAGT,NSL30901;CGCTGAT,PI303943;CGGTAGA,NSL30865;CTACGGA,Ames19330;GCGGAAT,Ames23391;TAGCGGA,Ames22794;TCGAAGA,PI601724;TCTGTGA,Ames27024;TGCTGGA,NSL75979;AACCGAGA,PI200182;ACAGGGAA,B73;ACGTGGTA,NSL30873;CCATGGGT,Ames14115;CGCGGAGA,NSL75977;CGTGTGGT,NSL30907;GCTGTGGA,NSL8583;GGATTGGT,Ames24707;GTGAGGGT,PI594045;TATCGGGA,Ames24718;TTCCTGGA,Ames24704;CTCC,NSL30909;TGCA,PI531085;ACTA,Ames2340;CAGA,NSL29285;AACT,PI511311;GCGT,NSL30903;TGCGA,Ames29004;CGAT,Ames26775;CGCTT,PI340830;TCACC,PI596357;CTAGC,Ames23442;ACAAA,Ames24710;TTCTC,Ames19286;AGCCC,SA24;GTATT,PI596503;CTGTA,NSL30883;ACCGT,PI601689;GTAA,PI405711;GGTTGT,PI634206;CCAGCT,PI2217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Zea mays
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