SAMN02116446
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-05-03T12:29:32.003Z
INSDC first public
2013-05-06T13:36:12.910Z
INSDC last update
SRS418796
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS418796
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,CKL08044;TGCA,CKL08052;ACTA,CKL08060;CAGA,CKDHL0003;AACT,CKDHL0012;GCGT,CKDHL0020;TGCGA,CKDHL0028;CGAT,CKDHL0036;CGCTT,CKDHL0044;TCACC,CKDHL0053;CTAGC,CKDHL0061;ACAAA,CKDHL0069;TTCTC,CKL08045;AGCCC,CKL08053;GTATT,CKL08061;CTGTA,CKDHL0004;ACCGT,CKDHL0013;GTAA,CKDHL0021;GGTTGT,CKDHL0029;CCAGCT,CKDHL0037;TTCAGA,CKDHL0045;TAGGAA,CKDHL0054;GCTCTA,CKDHL0062;CCACAA,CKDHL0070;GCTTA,CKL08046;CTTCCA,CKL08054;GAGATA,CKL06007;ATGCCT,CKDHL0005;TATTTTT,CKDHL0014;CTTGCTT,CKDHL0022;ATGAAAC,CKDHL0030;AAAAGTT,CKDHL0038;GAATTCA,CKDHL0046;GAACTTC,CKDHL0055;GGACCTA,CKDHL0063;GTCGATT,CKDHL0071;AACGCCT,CKL08047;AATATGC,CKL08055;ACGACTAC,CKL06008;GGTGT,CKDHL0006;TAGCATGC,CKDHL0015;AGTGGA,CKDHL0023;TAGGCCAT,CKDHL0031;TGCAAGGA,CKDHL0039;TGGTACGT,CKDHL0047;TCTCAGTC,CKDHL0056;CCGGATAT,CKDHL0064;CGCCTTAT,CKDHL0072;AGGC,CKL08048;GATC,CKL08056;TCAC,CKL06010;AGGAT,CKDHL0007;ATTGA,CKDHL0016;CATCT,CKDHL0024;CCTAC,CKDHL0032;GAGGA,CKDHL0040;GGAAC,CKDHL0049;GTCAA,CKDHL0057;TAATA,CKDHL0065;TACAT,CKDHL0073;TCGTT,CKL08049;ACCTAA,CKL08057;ATATGT,CKDHL0630;ATCGTA,CKDHL0008;CATCGT,CKDHL0017;CGCGGT,CKDHL0025;CTATTA,CKDHL0033;GCCAGT,CKDHL0041;GGAAGA,CKDHL0050;GTACTT,CKDHL0058;GTTGAA,CKDHL0066;TAACGA,CKDHL0076;TGGCTA,CKL08050;ACGTGTT,CKL08058;ATTAATT,CKDHL0001;ATTGGAT,CKDHL0009;CATAAGT,CKDHL0018;CGCTGAT,CKDHL0026;CGGTAGA,CKDHL0034;CTACGGA,CKDHL0042;GCGGAAT,CKDHL0051;TAGCGGA,CKDHL0059;TCGAAGA,CKDHL0067;TCTGTGA,CKDHL0077;TGCTGGA,CKL08051;AACCGAGA,CKL08059;ACAGGGAA,CKDHL0002;ACGTGGTA,CKDHL0011;CCATGGGT,CKDHL0019;CGCGGAGA,CKDHL0027;CGTGTGGT,CKDHL0035;GCTGTGGA,CKDHL0043;GGATTGGT,CKDHL0052;GTGAGGGT,CKDHL0060;TATCGGGA,CKDHL0068;TTCCTGGA,CKDHL0078;)
description
Zea mays
http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_4577
organism
pooled
http://www.ebi.ac.uk/efo/EFO_0000663
strain
Generic sample from Zea mays
title