SAMN02086267
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-04-30T11:29:08.970Z
INSDC first public
2013-04-30T21:27:19.787Z
INSDC last update
SRS417486
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS417486
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,PI406118;TGCA,CML338;ACTA,NSL437940;CAGA,PI527699;AACT,NSL438010;GCGT,NSL438043;TGCGA,PI340868;CGAT,NSL29282;CGCTT,SA24;TCACC,Ames26764;CTAGC,NSL30902;ACAAA,B73;TTCTC,NSL437980;AGCCC,CML235;GTATT,PI601576;CTGTA,blank;ACCGT,PI561527;GTAA,PI303940;GGTTGT,PI358527;CCAGCT,NSL30065;TTCAGA,PI186229;TAGGAA,Ames26750;GCTCTA,Ames29025;CCACAA,PI603939;GCTTA,Ames27167;CTTCCA,Ames25374;GAGATA,PI608777;ATGCCT,Ames28360;TATTTTT,NSL437890;CTTGCTT,Ames10264;ATGAAAC,Ames19000;AAAAGTT,NSL29284;GAATTCA,PI601566;GAACTTC,PI596501;GGACCTA,PI358533;GTCGATT,PI601159;AACGCCT,PI607381;AATATGC,Ames28984;ACGACTAC,PI303927;GGTGT,Ames28420;TAGCATGC,NSL67792;AGTGGA,PI406123;TAGGCCAT,PI511310;TGCAAGGA,PI340854;TGGTACGT,PI601501;TCTCAGTC,Ames27445;CCGGATAT,PI592733;CGCCTTAT,Ames27160;AGGC,PI601362;GATC,Ames28362;TCAC,Ames28954;AGGAT,NSL437964;ATTGA,CIze28;CATCT,Ames19007;CCTAC,Ames2327;GAGGA,NSL30869;GGAAC,PI550466;GTCAA,PI542955;TAATA,Ames29020;TACAT,PI634212;TCGTT,NSL438031;ACCTAA,Ames28995;ATATGT,NSL67797;ATCGTA,Ames28944;CATCGT,CIze89;CGCGGT,PI601610;CTATTA,Ames27161;GCCAGT,NSL30906;GGAAGA,Ames19016;GTACTT,Ames22748;GTTGAA,Ames26806;TAACGA,NSL30060;TGGCTA,NSL437972;ACGTGTT,NSL437891;ATTAATT,Ames26114;ATTGGAT,PI303936;CATAAGT,PI340863;CGCTGAT,CML325;CGGTAGA,Ames26749;CTACGGA,Ames22032;GCGGAAT,SC212M;TAGCGGA,PI601402;TCGAAGA,PI303930;TCTGTGA,PI607383;TGCTGGA,CIze7;AACCGAGA,NSL437973;ACAGGGAA,NSL8581;ACGTGGTA,PI340870;CCATGGGT,PI597925;CGCGGAGA,Ames26798;CGTGTGGT,Ames26772;GCTGTGGA,NSL42808;GGATTGGT,PI553056;GTGAGGGT,Ames19008;TATCGGGA,Ames27141;TTCCTGGA,PI406108;CTCC,PI406118;TGCA,CML338;ACTA,NSL437940;CAGA,PI527699;AACT,NSL438010;GCGT,NSL438043;TGCGA,PI340868;CGAT,NSL29282;CGCTT,SA24;TCACC,Ames26764;CTAGC,NSL30902;ACAAA,B73;TTCTC,NSL437980;AGCCC,CML235;GTATT,PI601576;CTGTA,blank;ACCGT,PI561527;GTAA,PI303940;GGTTGT,PI358527;CCAGCT,NSL30065;TTCAGA,PI186229;TAGGAA,Ames26750;GCTCTA,Ames29025;CCACAA,PI603939;GCTTA,Ames27167;CTTCCA,Ames25374;GAGATA,PI608777;ATGCCT,Ames28360;TATTTTT,NSL437890;CTTGCTT,Ames10264;ATGAAAC,Ames19000;AAAAGTT,NSL29284;GAATTCA,PI601566;GAACTTC,PI596501;GGACCTA,PI358533;GTCGATT,PI601159;AACGCCT,PI607381;AATATGC,Ames28984;ACGACTAC,PI303927;GGTGT,Ames28420;TAGCATGC,NSL67792;AGTGGA,PI406123;TAGGCCAT,PI511310;TGCAAGGA,PI340854;TGGTACGT,PI601501;TCTCAGTC,Ames27445;CCGGATAT,PI592733;CGCCTTAT,Ames27160;AGGC,PI601362;GATC,Ames28362;TCAC,Ames28954;AGGAT,NSL437964;ATTGA,CIze28;CATCT,Ames19007;CCTAC,Ames2327;GAGGA,NSL30869;GGAAC,PI550466;GTCAA,PI542955;TAATA,Ames29020;TACAT,PI634212;TCGTT,NSL438031;ACCTAA,Ames28995;ATATGT,NSL67797;ATCGTA,Ames28944;CATCGT,CIze89;CGCGGT,PI601610;CTATTA,Ames27161;GCCAGT,NSL30906;GGAAGA,Ames19016;GTACTT,Ames22748;GTTGAA,Ames26806;TAACGA,NSL30060;TGGCTA,NSL437972;ACGTGTT,NSL437891;ATTAATT,Ames26114;ATTGGAT,PI303936;CATAAGT,PI340863;CGCTGAT,CML325;CGGTAGA,Ames26749;CTACGGA,Ames22032;GCGGAAT,SC212M;TAGCGGA,PI601402;TCGAAGA,PI303930;TCTGTGA,PI607383;TGCTGGA,CIze7;AACCGAGA,NSL437973;ACAGGGAA,NSL8581;ACGTGGTA,PI340870;CCATGGGT,PI597925;CGCGGAGA,Ames26798;CGTGTGGT,Ames26772;GCTGTGGA,NSL42808;GGATTGGT,PI553056;GTGAGGGT,Ames19008;TATCGGGA,Ames27141;TTCCTGGA,PI406108;CTCC,PI406118;TGCA,CML338;ACTA,NSL437940;CAGA,PI527699;AACT,NSL438010;GCGT,NSL438043;TGCGA,PI340868;CGAT,NSL29282;CGCTT,SA24;TCACC,Ames26764;CTAGC,NSL30902;ACAAA,B73;TTCTC,NSL437980;AGCCC,CML235;GTATT,PI601576;CTGTA,blank;ACCGT,PI561527;GTAA,PI303940;GGTTGT,PI358527;CCAGCT,NSL30065;TTCAGA,PI186229;TAGGAA,Ames26750;GCTCTA,Ames29025;CCACAA,PI603939;GCTTA,Ames27167;CTTCCA,Ames25374;GAGATA,PI608777;ATGCCT,Ames28360;TATTTTT,NSL437890;CTTGCTT,Ames10264;ATGAAAC,Ames19000;AAAAGTT,NSL29284;GAATTCA,PI601566;GAACTTC,PI596501;GGACCTA,PI358533;GTCGATT,PI601159;AACGCCT,PI607381;AATATGC,Ames28984;ACGACTAC,PI303927;GGTGT,Ames28420;TAGCATGC,NSL67792;AGTGGA,PI406123;TAGGCCAT,PI511310;TGCAAGGA,PI340854;TGGTACGT,PI601501;TCTCAGTC,Ames27445;CCGGATAT,PI592733;CGCCTTAT,Ames27160;AGGC,PI601362;GATC,Ames28362;TCAC,Ames28954;AGGAT,NSL437964;ATTGA,CIze28;CATCT,Ames19007;CCTAC,Ames2327;GAGGA,NSL30869;GGAAC,PI550466;GTCAA,PI542955;TAATA,Ames29020;TACAT,PI634212;TCGTT,NSL438031;ACCTAA,Ames28995;ATATGT,NSL67797;ATCGTA,Ames28944;CATCGT,CIze89;CGCGGT,PI601610;CTATTA,Ames27161;GCCAGT,NSL30906;GGAAGA,Ames19016;GTACTT,Ames22748;GTTGAA,Ames26806;TAACGA,NSL30060;TGGCTA,NSL437972;ACGTGTT,NSL437891;ATTAATT,Ames26114;ATTGGAT,PI303936;CATAAGT,PI340863;CGCTGAT,CML325;CGGTAGA,Ames26749;CTACGGA,Ames22032;GCGGAAT,SC212M;TAGCGGA,PI601402;TCGAAGA,PI303930;TCTGTGA,PI607383;TGCTGGA,CIze7;AACCGAGA,NSL437973;ACAGGGAA,NSL8581;ACGTGGTA,PI340870;CCATGGGT,PI597925;CGCGGAGA,Ames26798;CGTGTGGT,Ames26772;GCTGTGGA,NSL42808;GGATTGGT,PI553056;GTGAGGGT,Ames19008;TATCGGGA,Ames27141;TTCCTGGA,PI406108;CTCC,PI406118;TGCA,CML338;ACTA,NSL437940;CAGA,PI527699;AACT,NSL438010;GCGT,NSL438043;TGCGA,PI340868;CGAT,NSL29282;CGCTT,SA24;TCACC,Ames26764;CTAGC,NSL30902;ACAAA,B73;TTCTC,NSL437980;AGCCC,CML235;GTATT,PI601576;CTGTA,blank;ACCGT,PI561527;GTAA,PI303940;GGTTGT,PI358527;CCAGCT,NSL30065;TTCAGA,PI186229;TAGGAA,Ames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Zea mays
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