SAMN02086292
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-04-30T11:27:50.690Z
INSDC first public
2013-04-30T22:10:19.133Z
INSDC last update
SRS417511
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS417511
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,PI531085;TGCA,PI601211;ACTA,Ames26752;CAGA,PI358538;AACT,PI200185;GCGT,PI531509;TGCGA,PI596506;CGAT,PI601416;CGCTT,Ames27135;TCACC,NSL30889;CTAGC,PI550473;ACAAA,Ames28981;TTCTC,Ames27108;AGCCC,PI539924;GTATT,Ames27182;CTGTA,PI553055;ACCGT,Ames27142;GTAA,Ames23459;GGTTGT,Ames22748;CCAGCT,Ames2338;TTCAGA,Ames27161;TAGGAA,PI608765;GCTCTA,NSL42806;CCACAA,Ames27137;GCTTA,Ames24989;CTTCCA,PI601318;GAGATA,PI560075;ATGCCT,NSL30885;TATTTTT,PI221813;CTTGCTT,PI600751;ATGAAAC,Ames22749;AAAAGTT,PI553060;GAATTCA,PI648428;GAACTTC,PI583352;GGACCTA,Ames27143;GTCGATT,PI200179;AACGCCT,NSL30890;AATATGC,PI340851;ACGACTAC,PI550566;GGTGT,Ames27178;TAGCATGC,PI539920;AGTGGA,PI553059;TAGGCCAT,Ames19313;TGCAAGGA,Ames25221;TGGTACGT,NSL30908;TCTCAGTC,Ames22031;CCGGATAT,PI340844;CGCCTTAT,PI459082;AGGC,Ames29007;GATC,PI340860;TCAC,NSL30071;AGGAT,Ames28982;ATTGA,Ames19014;CATCT,PI391680;CCTAC,Ames28973;GAGGA,PI601171;GGAAC,PI601729;GTCAA,Ames29030;TAATA,Ames2326;TACAT,Ames23507;TCGTT,blank;ACCTAA,Ames27178;ATATGT,PI186217;ATCGTA,PI303937;CATCGT,SA24;CGCGGT,Ames29016;CTATTA,Ames23404;GCCAGT,PI200194;GGAAGA,PI601269;GTACTT,B73;GTTGAA,Ames23493;TAACGA,Ames26748;TGGCTA,PI592734;ACGTGTT,PI583352;ATTAATT,Ames26803;ATTGGAT,Ames26757;CATAAGT,Ames29000;CGCTGAT,Ames19319;CGGTAGA,PI405714;CTACGGA,NSL29286;GCGGAAT,Ames27446;TAGCGGA,PI601405;TCGAAGA,NSL42804;TCTGTGA,Ames26742;TGCTGGA,Ames26783;AACCGAGA,Ames19294;ACAGGGAA,PI587152;ACGTGGTA,Ames22047;CCATGGGT,PI634211;CGCGGAGA,Ames22751;CGTGTGGT,PI186185;GCTGTGGA,PI568158;GGATTGGT,Ames19017;GTGAGGGT,PI531510;TATCGGGA,Ames28972;TTCCTGGA,Ames24589;CTCC,PI531085;TGCA,PI601211;ACTA,Ames26752;CAGA,PI358538;AACT,PI200185;GCGT,PI531509;TGCGA,PI596506;CGAT,PI601416;CGCTT,Ames27135;TCACC,NSL30889;CTAGC,PI550473;ACAAA,Ames28981;TTCTC,Ames27108;AGCCC,PI539924;GTATT,Ames27182;CTGTA,PI553055;ACCGT,Ames27142;GTAA,Ames23459;GGTTGT,Ames22748;CCAGCT,Ames2338;TTCAGA,Ames27161;TAGGAA,PI608765;GCTCTA,NSL42806;CCACAA,Ames27137;GCTTA,Ames24989;CTTCCA,PI601318;GAGATA,PI560075;ATGCCT,NSL30885;TATTTTT,PI221813;CTTGCTT,PI600751;ATGAAAC,Ames22749;AAAAGTT,PI553060;GAATTCA,PI648428;GAACTTC,PI583352;GGACCTA,Ames27143;GTCGATT,PI200179;AACGCCT,NSL30890;AATATGC,PI340851;ACGACTAC,PI550566;GGTGT,Ames27178;TAGCATGC,PI539920;AGTGGA,PI553059;TAGGCCAT,Ames19313;TGCAAGGA,Ames25221;TGGTACGT,NSL30908;TCTCAGTC,Ames22031;CCGGATAT,PI340844;CGCCTTAT,PI459082;AGGC,Ames29007;GATC,PI340860;TCAC,NSL30071;AGGAT,Ames28982;ATTGA,Ames19014;CATCT,PI391680;CCTAC,Ames28973;GAGGA,PI601171;GGAAC,PI601729;GTCAA,Ames29030;TAATA,Ames2326;TACAT,Ames23507;TCGTT,blank;ACCTAA,Ames27178;ATATGT,PI186217;ATCGTA,PI303937;CATCGT,SA24;CGCGGT,Ames29016;CTATTA,Ames23404;GCCAGT,PI200194;GGAAGA,PI601269;GTACTT,B73;GTTGAA,Ames23493;TAACGA,Ames26748;TGGCTA,PI592734;ACGTGTT,PI583352;ATTAATT,Ames26803;ATTGGAT,Ames26757;CATAAGT,Ames29000;CGCTGAT,Ames19319;CGGTAGA,PI405714;CTACGGA,NSL29286;GCGGAAT,Ames27446;TAGCGGA,PI601405;TCGAAGA,NSL42804;TCTGTGA,Ames26742;TGCTGGA,Ames26783;AACCGAGA,Ames19294;ACAGGGAA,PI587152;ACGTGGTA,Ames22047;CCATGGGT,PI634211;CGCGGAGA,Ames22751;CGTGTGGT,PI186185;GCTGTGGA,PI568158;GGATTGGT,Ames19017;GTGAGGGT,PI531510;TATCGGGA,Ames28972;TTCCTGGA,Ames24589;CTCC,PI531085;TGCA,PI601211;ACTA,Ames26752;CAGA,PI358538;AACT,PI200185;GCGT,PI531509;TGCGA,PI596506;CGAT,PI601416;CGCTT,Ames27135;TCACC,NSL30889;CTAGC,PI550473;ACAAA,Ames28981;TTCTC,Ames27108;AGCCC,PI539924;GTATT,Ames27182;CTGTA,PI553055;ACCGT,Ames27142;GTAA,Ames23459;GGTTGT,Ames22748;CCAGCT,Ames2338;TTCAGA,Ames27161;TAGGAA,PI608765;GCTCTA,NSL42806;CCACAA,Ames27137;GCTTA,Ames24989;CTTCCA,PI601318;GAGATA,PI560075;ATGCCT,NSL30885;TATTTTT,PI221813;CTTGCTT,PI600751;ATGAAAC,Ames22749;AAAAGTT,PI553060;GAATTCA,PI648428;GAACTTC,PI583352;GGACCTA,Ames27143;GTCGATT,PI200179;AACGCCT,NSL30890;AATATGC,PI340851;ACGACTAC,PI550566;GGTGT,Ames27178;TAGCATGC,PI539920;AGTGGA,PI553059;TAGGCCAT,Ames19313;TGCAAGGA,Ames25221;TGGTACGT,NSL30908;TCTCAGTC,Ames22031;CCGGATAT,PI340844;CGCCTTAT,PI459082;AGGC,Ames29007;GATC,PI340860;TCAC,NSL30071;AGGAT,Ames28982;ATTGA,Ames19014;CATCT,PI391680;CCTAC,Ames28973;GAGGA,PI601171;GGAAC,PI601729;GTCAA,Ames29030;TAATA,Ames2326;TACAT,Ames23507;TCGTT,blank;ACCTAA,Ames27178;ATATGT,PI186217;ATCGTA,PI303937;CATCGT,SA24;CGCGGT,Ames29016;CTATTA,Ames23404;GCCAGT,PI200194;GGAAGA,PI601269;GTACTT,B73;GTTGAA,Ames23493;TAACGA,Ames26748;TGGCTA,PI592734;ACGTGTT,PI583352;ATTAATT,Ames26803;ATTGGAT,Ames26757;CATAAGT,Ames29000;CGCTGAT,Ames19319;CGGTAGA,PI405714;CTACGGA,NSL29286;GCGGAAT,Ames27446;TAGCGGA,PI601405;TCGAAGA,NSL42804;TCTGTGA,Ames26742;TGCTGGA,Ames26783;AACCGAGA,Ames19294;ACAGGGAA,PI587152;ACGTGGTA,Ames22047;CCATGGGT,PI634211;CGCGGAGA,Ames22751;CGTGTGGT,PI186185;GCTGTGGA,PI568158;GGATTGGT,Ames19017;GTGAGGGT,PI531510;TATCGGGA,Ames28972;TTCCTGGA,Ames24589;CTCC,PI531085;TGCA,PI601211;ACTA,Ames26752;CAGA,PI358538;AACT,PI200185;GCGT,PI531509;TGCGA,PI596506;CGAT,PI601416;CGCTT,Ames27135;TCACC,NSL30889;CTAGC,PI550473;ACAAA,Ames28981;TTCTC,Ames27108;AGCCC,PI539924;GTATT,Ames27182;CTGTA,PI553055;ACCGT,Ames27142;GT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Zea mays
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