SAMN02086268
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-04-30T11:29:08.563Z
INSDC first public
2013-04-30T21:27:20.220Z
INSDC last update
SRS417487
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS417487
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,PI601301;TGCA,B73;ACTA,Ames26758;CAGA,NSL117226;AACT,Ames26788;GCGT,Ames2332;TGCGA,PI641242;CGAT,Ames29021;CGCTT,NSL30898;TCACC,PI550497;CTAGC,PI340857;ACAAA,PI186215;TTCTC,PI542959;AGCCC,Ames19000;GTATT,Ames24590;CTGTA,PI596505;ACCGT,PI553061;GTAA,NSL30073;GGTTGT,Ames19006;CCAGCT,Ames22015;TTCAGA,SA24;TAGGAA,Ames22046;GCTCTA,Ames19016;CCACAA,PI601612;GCTTA,PI596499;CTTCCA,NSL65871;GAGATA,Ames26786;ATGCCT,NSL30905;TATTTTT,blank;CTTGCTT,Ames28998;ATGAAAC,NSL30064;AAAAGTT,PI186226;GAATTCA,Ames22028;GAACTTC,PI553064;GGACCTA,PI648427;GTCGATT,PI601565;AACGCCT,PI601583;AATATGC,PI553063;ACGACTAC,Ames19309;GGTGT,PI550440;TAGCATGC,PI358539;AGTGGA,PI601786;TAGGCCAT,PI601561;TGCAAGGA,Ames26744;TGGTACGT,PI601209;TCTCAGTC,PI221790;CCGGATAT,PI587128;CGCCTTAT,PI539921;AGGC,PI600958;GATC,PI459080;TCAC,PI538011;AGGAT,Ames2341;ATTGA,PI600955;CATCT,Ames19309;CCTAC,PI558532;GAGGA,Ames22044;GGAAC,Ames26751;GTCAA,Ames29002;TAATA,PI406126;TACAT,PI221788;TCGTT,PI583350;ACCTAA,CML375;ATATGT,Ames14112;ATCGTA,NSL30878;CATCGT,PI601685;CGCGGT,Ames27444;CTATTA,PI539922;GCCAGT,NSL15405;GGAAGA,PI358530;GTACTT,Ames19011;GTTGAA,PI539927;TAACGA,Ames22049;TGGCTA,Ames19318;ACGTGTT,Ames26796;ATTAATT,PI340856;ATTGGAT,PI601779;CATAAGT,PI601360;CGCTGAT,PI537099;CGGTAGA,Ames29028;CTACGGA,Ames27164;GCGGAAT,Ames19321;TAGCGGA,PI547088;TCGAAGA,NSL30894;TCTGTGA,Ames27174;TGCTGGA,Ames29019;AACCGAGA,Ames29001;ACAGGGAA,PI601686;ACGTGGTA,PI340836;CCATGGGT,PI601567;CGCGGAGA,PI186221;CGTGTGGT,NSL30055;GCTGTGGA,PI391678;GGATTGGT,PI601079;GTGAGGGT,PI406106;TATCGGGA,PI600729;TTCCTGGA,Ames26767;CTCC,PI601301;TGCA,B73;ACTA,Ames26758;CAGA,NSL117226;AACT,Ames26788;GCGT,Ames2332;TGCGA,PI641242;CGAT,Ames29021;CGCTT,NSL30898;TCACC,PI550497;CTAGC,PI340857;ACAAA,PI186215;TTCTC,PI542959;AGCCC,Ames19000;GTATT,Ames24590;CTGTA,PI596505;ACCGT,PI553061;GTAA,NSL30073;GGTTGT,Ames19006;CCAGCT,Ames22015;TTCAGA,SA24;TAGGAA,Ames22046;GCTCTA,Ames19016;CCACAA,PI601612;GCTTA,PI596499;CTTCCA,NSL65871;GAGATA,Ames26786;ATGCCT,NSL30905;TATTTTT,blank;CTTGCTT,Ames28998;ATGAAAC,NSL30064;AAAAGTT,PI186226;GAATTCA,Ames22028;GAACTTC,PI553064;GGACCTA,PI648427;GTCGATT,PI601565;AACGCCT,PI601583;AATATGC,PI553063;ACGACTAC,Ames19309;GGTGT,PI550440;TAGCATGC,PI358539;AGTGGA,PI601786;TAGGCCAT,PI601561;TGCAAGGA,Ames26744;TGGTACGT,PI601209;TCTCAGTC,PI221790;CCGGATAT,PI587128;CGCCTTAT,PI539921;AGGC,PI600958;GATC,PI459080;TCAC,PI538011;AGGAT,Ames2341;ATTGA,PI600955;CATCT,Ames19309;CCTAC,PI558532;GAGGA,Ames22044;GGAAC,Ames26751;GTCAA,Ames29002;TAATA,PI406126;TACAT,PI221788;TCGTT,PI583350;ACCTAA,CML375;ATATGT,Ames14112;ATCGTA,NSL30878;CATCGT,PI601685;CGCGGT,Ames27444;CTATTA,PI539922;GCCAGT,NSL15405;GGAAGA,PI358530;GTACTT,Ames19011;GTTGAA,PI539927;TAACGA,Ames22049;TGGCTA,Ames19318;ACGTGTT,Ames26796;ATTAATT,PI340856;ATTGGAT,PI601779;CATAAGT,PI601360;CGCTGAT,PI537099;CGGTAGA,Ames29028;CTACGGA,Ames27164;GCGGAAT,Ames19321;TAGCGGA,PI547088;TCGAAGA,NSL30894;TCTGTGA,Ames27174;TGCTGGA,Ames29019;AACCGAGA,Ames29001;ACAGGGAA,PI601686;ACGTGGTA,PI340836;CCATGGGT,PI601567;CGCGGAGA,PI186221;CGTGTGGT,NSL30055;GCTGTGGA,PI391678;GGATTGGT,PI601079;GTGAGGGT,PI406106;TATCGGGA,PI600729;TTCCTGGA,Ames26767;CTCC,PI601301;TGCA,B73;ACTA,Ames26758;CAGA,NSL117226;AACT,Ames26788;GCGT,Ames2332;TGCGA,PI641242;CGAT,Ames29021;CGCTT,NSL30898;TCACC,PI550497;CTAGC,PI340857;ACAAA,PI186215;TTCTC,PI542959;AGCCC,Ames19000;GTATT,Ames24590;CTGTA,PI596505;ACCGT,PI553061;GTAA,NSL30073;GGTTGT,Ames19006;CCAGCT,Ames22015;TTCAGA,SA24;TAGGAA,Ames22046;GCTCTA,Ames19016;CCACAA,PI601612;GCTTA,PI596499;CTTCCA,NSL65871;GAGATA,Ames26786;ATGCCT,NSL30905;TATTTTT,blank;CTTGCTT,Ames28998;ATGAAAC,NSL30064;AAAAGTT,PI186226;GAATTCA,Ames22028;GAACTTC,PI553064;GGACCTA,PI648427;GTCGATT,PI601565;AACGCCT,PI601583;AATATGC,PI553063;ACGACTAC,Ames19309;GGTGT,PI550440;TAGCATGC,PI358539;AGTGGA,PI601786;TAGGCCAT,PI601561;TGCAAGGA,Ames26744;TGGTACGT,PI601209;TCTCAGTC,PI221790;CCGGATAT,PI587128;CGCCTTAT,PI539921;AGGC,PI600958;GATC,PI459080;TCAC,PI538011;AGGAT,Ames2341;ATTGA,PI600955;CATCT,Ames19309;CCTAC,PI558532;GAGGA,Ames22044;GGAAC,Ames26751;GTCAA,Ames29002;TAATA,PI406126;TACAT,PI221788;TCGTT,PI583350;ACCTAA,CML375;ATATGT,Ames14112;ATCGTA,NSL30878;CATCGT,PI601685;CGCGGT,Ames27444;CTATTA,PI539922;GCCAGT,NSL15405;GGAAGA,PI358530;GTACTT,Ames19011;GTTGAA,PI539927;TAACGA,Ames22049;TGGCTA,Ames19318;ACGTGTT,Ames26796;ATTAATT,PI340856;ATTGGAT,PI601779;CATAAGT,PI601360;CGCTGAT,PI537099;CGGTAGA,Ames29028;CTACGGA,Ames27164;GCGGAAT,Ames19321;TAGCGGA,PI547088;TCGAAGA,NSL30894;TCTGTGA,Ames27174;TGCTGGA,Ames29019;AACCGAGA,Ames29001;ACAGGGAA,PI601686;ACGTGGTA,PI340836;CCATGGGT,PI601567;CGCGGAGA,PI186221;CGTGTGGT,NSL30055;GCTGTGGA,PI391678;GGATTGGT,PI601079;GTGAGGGT,PI406106;TATCGGGA,PI600729;TTCCTGGA,Ames26767;CTCC,PI601301;TGCA,B73;ACTA,Ames26758;CAGA,NSL117226;AACT,Ames26788;GCGT,Ames2332;TGCGA,PI641242;CGAT,Ames29021;CGCTT,NSL30898;TCACC,PI550497;CTAGC,PI340857;ACAAA,PI186215;TTCTC,PI542959;AGCCC,Ames19000;GTATT,Ames24590;CTGTA,PI596505;ACCGT,PI553061;GTAA,NSL30073;GGTTGT,Ames19006;CCAGCT,Am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Zea mays
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