SAMN02086269
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-04-30T11:29:08.110Z
INSDC first public
2013-04-30T21:27:20.657Z
INSDC last update
SRS417488
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS417488
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,NSL30067;TGCA,PI560074;ACTA,PI596502;CAGA,NSL30056;AACT,Ames25559;GCGT,Ames26791;TGCGA,Ames22753;CGAT,Ames26804;CGCTT,Ames19293;TCACC,NSL29305;CTAGC,PI558532;ACAAA,PI340871;TTCTC,CML340;AGCCC,Ames27135;GTATT,PI587150;CTGTA,Ames28976;ACCGT,Ames2336;GTAA,CML211;GGTTGT,PI550462;CCAGCT,Ames22029;TTCAGA,PI186224;TAGGAA,Ames27138;GCTCTA,Ames29011;CCACAA,PI601417;GCTTA,NSL30913;CTTCCA,PI601773;GAGATA,blank;ATGCCT,Ames29005;TATTTTT,Ames26797;CTTGCTT,Ames27184;ATGAAAC,PI550470;AAAAGTT,Ames28978;GAATTCA,Ames27114;GAACTTC,PI601006;GGACCTA,Ames14211;GTCGATT,SA24;AACGCCT,NSL30875;AATATGC,Ames27193;ACGACTAC,Ames28971;GGTGT,Ames21095;TAGCATGC,PI559918;AGTGGA,B73;TAGGCCAT,PI648431;TGCAAGGA,PI550558;TGGTACGT,NSL68252;TCTCAGTC,PI553057;CCGGATAT,Ames2328;CGCCTTAT,Ames29014;AGGC,Ames28975;GATC,NSL22633;TCAC,Ames19287;AGGAT,NSL30912;ATTGA,Ames29018;CATCT,PI550483;CCTAC,PI340865;GAGGA,Ames28974;GGAAC,Ames19328;GTCAA,PI600956;TAATA,Ames26799;TACAT,Ames29023;TCGTT,PI634207;ACCTAA,NSL28965;ATATGT,PI406112;ATCGTA,Ames2337;CATCGT,NSL437903;CGCGGT,NSL30894;CTATTA,Ames26800;GCCAGT,Ames19015;GGAAGA,PI391660;GTACTT,PI583351;GTTGAA,Ames29017;TAACGA,Ames27143;TGGCTA,PI221821;ACGTGTT,PI601229;ATTAATT,Ames22754;ATTGGAT,PI601378;CATAAGT,PI427111;CGCTGAT,Ames8397;CGGTAGA,PI553058;CTACGGA,Ames27182;GCGGAAT,Ames27185;TAGCGGA,NSL30888;TCGAAGA,Ames27065;TCTGTGA,PI587127;TGCTGGA,PI634213;AACCGAGA,NSL75970;ACAGGGAA,Ames28939;ACGTGGTA,NSL65866;CCATGGGT,NSL30877;CGCGGAGA,Ames26755;CGTGTGGT,PI550496;GCTGTGGA,Ames26746;GGATTGGT,NSL197104;GTGAGGGT,PI550461;TATCGGGA,Ames26805;TTCCTGGA,NSL30910;CTCC,NSL30067;TGCA,PI560074;ACTA,PI596502;CAGA,NSL30056;AACT,Ames25559;GCGT,Ames26791;TGCGA,Ames22753;CGAT,Ames26804;CGCTT,Ames19293;TCACC,NSL29305;CTAGC,PI558532;ACAAA,PI340871;TTCTC,CML340;AGCCC,Ames27135;GTATT,PI587150;CTGTA,Ames28976;ACCGT,Ames2336;GTAA,CML211;GGTTGT,PI550462;CCAGCT,Ames22029;TTCAGA,PI186224;TAGGAA,Ames27138;GCTCTA,Ames29011;CCACAA,PI601417;GCTTA,NSL30913;CTTCCA,PI601773;GAGATA,blank;ATGCCT,Ames29005;TATTTTT,Ames26797;CTTGCTT,Ames27184;ATGAAAC,PI550470;AAAAGTT,Ames28978;GAATTCA,Ames27114;GAACTTC,PI601006;GGACCTA,Ames14211;GTCGATT,SA24;AACGCCT,NSL30875;AATATGC,Ames27193;ACGACTAC,Ames28971;GGTGT,Ames21095;TAGCATGC,PI559918;AGTGGA,B73;TAGGCCAT,PI648431;TGCAAGGA,PI550558;TGGTACGT,NSL68252;TCTCAGTC,PI553057;CCGGATAT,Ames2328;CGCCTTAT,Ames29014;AGGC,Ames28975;GATC,NSL22633;TCAC,Ames19287;AGGAT,NSL30912;ATTGA,Ames29018;CATCT,PI550483;CCTAC,PI340865;GAGGA,Ames28974;GGAAC,Ames19328;GTCAA,PI600956;TAATA,Ames26799;TACAT,Ames29023;TCGTT,PI634207;ACCTAA,NSL28965;ATATGT,PI406112;ATCGTA,Ames2337;CATCGT,NSL437903;CGCGGT,NSL30894;CTATTA,Ames26800;GCCAGT,Ames19015;GGAAGA,PI391660;GTACTT,PI583351;GTTGAA,Ames29017;TAACGA,Ames27143;TGGCTA,PI221821;ACGTGTT,PI601229;ATTAATT,Ames22754;ATTGGAT,PI601378;CATAAGT,PI427111;CGCTGAT,Ames8397;CGGTAGA,PI553058;CTACGGA,Ames27182;GCGGAAT,Ames27185;TAGCGGA,NSL30888;TCGAAGA,Ames27065;TCTGTGA,PI587127;TGCTGGA,PI634213;AACCGAGA,NSL75970;ACAGGGAA,Ames28939;ACGTGGTA,NSL65866;CCATGGGT,NSL30877;CGCGGAGA,Ames26755;CGTGTGGT,PI550496;GCTGTGGA,Ames26746;GGATTGGT,NSL197104;GTGAGGGT,PI550461;TATCGGGA,Ames26805;TTCCTGGA,NSL30910;CTCC,NSL30067;TGCA,PI560074;ACTA,PI596502;CAGA,NSL30056;AACT,Ames25559;GCGT,Ames26791;TGCGA,Ames22753;CGAT,Ames26804;CGCTT,Ames19293;TCACC,NSL29305;CTAGC,PI558532;ACAAA,PI340871;TTCTC,CML340;AGCCC,Ames27135;GTATT,PI587150;CTGTA,Ames28976;ACCGT,Ames2336;GTAA,CML211;GGTTGT,PI550462;CCAGCT,Ames22029;TTCAGA,PI186224;TAGGAA,Ames27138;GCTCTA,Ames29011;CCACAA,PI601417;GCTTA,NSL30913;CTTCCA,PI601773;GAGATA,blank;ATGCCT,Ames29005;TATTTTT,Ames26797;CTTGCTT,Ames27184;ATGAAAC,PI550470;AAAAGTT,Ames28978;GAATTCA,Ames27114;GAACTTC,PI601006;GGACCTA,Ames14211;GTCGATT,SA24;AACGCCT,NSL30875;AATATGC,Ames27193;ACGACTAC,Ames28971;GGTGT,Ames21095;TAGCATGC,PI559918;AGTGGA,B73;TAGGCCAT,PI648431;TGCAAGGA,PI550558;TGGTACGT,NSL68252;TCTCAGTC,PI553057;CCGGATAT,Ames2328;CGCCTTAT,Ames29014;AGGC,Ames28975;GATC,NSL22633;TCAC,Ames19287;AGGAT,NSL30912;ATTGA,Ames29018;CATCT,PI550483;CCTAC,PI340865;GAGGA,Ames28974;GGAAC,Ames19328;GTCAA,PI600956;TAATA,Ames26799;TACAT,Ames29023;TCGTT,PI634207;ACCTAA,NSL28965;ATATGT,PI406112;ATCGTA,Ames2337;CATCGT,NSL437903;CGCGGT,NSL30894;CTATTA,Ames26800;GCCAGT,Ames19015;GGAAGA,PI391660;GTACTT,PI583351;GTTGAA,Ames29017;TAACGA,Ames27143;TGGCTA,PI221821;ACGTGTT,PI601229;ATTAATT,Ames22754;ATTGGAT,PI601378;CATAAGT,PI427111;CGCTGAT,Ames8397;CGGTAGA,PI553058;CTACGGA,Ames27182;GCGGAAT,Ames27185;TAGCGGA,NSL30888;TCGAAGA,Ames27065;TCTGTGA,PI587127;TGCTGGA,PI634213;AACCGAGA,NSL75970;ACAGGGAA,Ames28939;ACGTGGTA,NSL65866;CCATGGGT,NSL30877;CGCGGAGA,Ames26755;CGTGTGGT,PI550496;GCTGTGGA,Ames26746;GGATTGGT,NSL197104;GTGAGGGT,PI550461;TATCGGGA,Ames26805;TTCCTGGA,NSL30910;CTCC,NSL30067;TGCA,PI560074;ACTA,PI596502;CAGA,NSL30056;AACT,Ames25559;GCGT,Ames26791;TGCGA,Ames22753;CGAT,Ames26804;CGCTT,Ames19293;TCACC,NSL29305;CTAGC,PI558532;ACAAA,PI340871;TTCTC,CML340;AGCCC,Ames27135;GTATT,PI587150;CTGTA,Ames28976;ACCGT,Ames2336;GTAA,CML211;GGT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Zea mays
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