SAMN02086276
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-04-30T11:29:04.903Z
INSDC first public
2013-04-30T21:38:21.590Z
INSDC last update
SRS417495
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS417495
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,Ames24740;TGCA,Ames23476;ACTA,Ames19292;CAGA,PI601150;AACT,Ames23485;GCGT,PI601564;TGCGA,Ames23417;CGAT,PI520770;CGCTT,PI233320;TCACC,Ames23403;CTAGC,SA24;ACAAA,Ames23455;TTCTC,Ames24716;AGCCC,Ames19288;GTATT,B73;CTGTA,Ames23396;ACCGT,Ames23479;GTAA,PI415086;GGTTGT,NSL42877;CCAGCT,PI587141;TTCAGA,Ames23392;TAGGAA,Ames28170;GCTCTA,PI200191;CCACAA,PI596356;GCTTA,Ames27069;CTTCCA,PI601321;GAGATA,Ames22443;ATGCCT,Ames23426;TATTTTT,PI601374;CTTGCTT,Ames23438;ATGAAAC,Ames24727;AAAAGTT,Ames23448;GAATTCA,PI604605;GAACTTC,PI303924;GGACCTA,PI568159;GTCGATT,PI606769;AACGCCT,Ames24705;AATATGC,Ames24741;ACGACTAC,Ames23422;GGTGT,Ames23474;TAGCATGC,Ames22065;AGTGGA,PI601190;TAGGCCAT,Ames23406;TGCAAGGA,Ames23490;TGGTACGT,PI596355;TCTCAGTC,Ames22067;CCGGATAT,PI587155;CGCCTTAT,PI415087;AGGC,Ames23509;GATC,PI601208;TCAC,PI406122;AGGAT,PI303939;ATTGA,Ames24751;CATCT,Ames24732;CCTAC,Ames27451;GAGGA,PI587124;GGAAC,Ames23463;GTCAA,Ames23446;TAATA,Ames27019;TACAT,Ames24745;TCGTT,Ames23423;ACCTAA,NSL30074;ATATGT,PI601319;ATCGTA,PI587134;CATCGT,Ames22037;CGCGGT,Ames24737;CTATTA,PI638550;GCCAGT,Ames24742;GGAAGA,PI567792;GTACTT,Ames22038;GTTGAA,PI600957;TAACGA,Ames24706;TGGCTA,Ames23480;ACGTGTT,Ames23435;ATTAATT,NSL30066;ATTGGAT,PI524970;CATAAGT,Ames23421;CGCTGAT,Ames23500;CGGTAGA,Ames23401;CTACGGA,NSL30880;GCGGAAT,PI601492;TAGCGGA,Ames22064;TCGAAGA,PI586935;TCTGTGA,Ames27021;TGCTGGA,Ames23424;AACCGAGA,Ames23431;ACAGGGAA,Ames23497;ACGTGGTA,PI601376;CCATGGGT,PI601570;CGCGGAGA,PI538244;CGTGTGGT,PI198894;GCTGTGGA,Ames23510;GGATTGGT,Ames23407;GTGAGGGT,Ames23471;TATCGGGA,PI405712;TTCCTGGA,blank;CTCC,Ames24740;TGCA,Ames23476;ACTA,Ames19292;CAGA,PI601150;AACT,Ames23485;GCGT,PI601564;TGCGA,Ames23417;CGAT,PI520770;CGCTT,PI233320;TCACC,Ames23403;CTAGC,SA24;ACAAA,Ames23455;TTCTC,Ames24716;AGCCC,Ames19288;GTATT,B73;CTGTA,Ames23396;ACCGT,Ames23479;GTAA,PI415086;GGTTGT,NSL42877;CCAGCT,PI587141;TTCAGA,Ames23392;TAGGAA,Ames28170;GCTCTA,PI200191;CCACAA,PI596356;GCTTA,Ames27069;CTTCCA,PI601321;GAGATA,Ames22443;ATGCCT,Ames23426;TATTTTT,PI601374;CTTGCTT,Ames23438;ATGAAAC,Ames24727;AAAAGTT,Ames23448;GAATTCA,PI604605;GAACTTC,PI303924;GGACCTA,PI568159;GTCGATT,PI606769;AACGCCT,Ames24705;AATATGC,Ames24741;ACGACTAC,Ames23422;GGTGT,Ames23474;TAGCATGC,Ames22065;AGTGGA,PI601190;TAGGCCAT,Ames23406;TGCAAGGA,Ames23490;TGGTACGT,PI596355;TCTCAGTC,Ames22067;CCGGATAT,PI587155;CGCCTTAT,PI415087;AGGC,Ames23509;GATC,PI601208;TCAC,PI406122;AGGAT,PI303939;ATTGA,Ames24751;CATCT,Ames24732;CCTAC,Ames27451;GAGGA,PI587124;GGAAC,Ames23463;GTCAA,Ames23446;TAATA,Ames27019;TACAT,Ames24745;TCGTT,Ames23423;ACCTAA,NSL30074;ATATGT,PI601319;ATCGTA,PI587134;CATCGT,Ames22037;CGCGGT,Ames24737;CTATTA,PI638550;GCCAGT,Ames24742;GGAAGA,PI567792;GTACTT,Ames22038;GTTGAA,PI600957;TAACGA,Ames24706;TGGCTA,Ames23480;ACGTGTT,Ames23435;ATTAATT,NSL30066;ATTGGAT,PI524970;CATAAGT,Ames23421;CGCTGAT,Ames23500;CGGTAGA,Ames23401;CTACGGA,NSL30880;GCGGAAT,PI601492;TAGCGGA,Ames22064;TCGAAGA,PI586935;TCTGTGA,Ames27021;TGCTGGA,Ames23424;AACCGAGA,Ames23431;ACAGGGAA,Ames23497;ACGTGGTA,PI601376;CCATGGGT,PI601570;CGCGGAGA,PI538244;CGTGTGGT,PI198894;GCTGTGGA,Ames23510;GGATTGGT,Ames23407;GTGAGGGT,Ames23471;TATCGGGA,PI405712;TTCCTGGA,blank;CTCC,Ames24740;TGCA,Ames23476;ACTA,Ames19292;CAGA,PI601150;AACT,Ames23485;GCGT,PI601564;TGCGA,Ames23417;CGAT,PI520770;CGCTT,PI233320;TCACC,Ames23403;CTAGC,SA24;ACAAA,Ames23455;TTCTC,Ames24716;AGCCC,Ames19288;GTATT,B73;CTGTA,Ames23396;ACCGT,Ames23479;GTAA,PI415086;GGTTGT,NSL42877;CCAGCT,PI587141;TTCAGA,Ames23392;TAGGAA,Ames28170;GCTCTA,PI200191;CCACAA,PI596356;GCTTA,Ames27069;CTTCCA,PI601321;GAGATA,Ames22443;ATGCCT,Ames23426;TATTTTT,PI601374;CTTGCTT,Ames23438;ATGAAAC,Ames24727;AAAAGTT,Ames23448;GAATTCA,PI604605;GAACTTC,PI303924;GGACCTA,PI568159;GTCGATT,PI606769;AACGCCT,Ames24705;AATATGC,Ames24741;ACGACTAC,Ames23422;GGTGT,Ames23474;TAGCATGC,Ames22065;AGTGGA,PI601190;TAGGCCAT,Ames23406;TGCAAGGA,Ames23490;TGGTACGT,PI596355;TCTCAGTC,Ames22067;CCGGATAT,PI587155;CGCCTTAT,PI415087;AGGC,Ames23509;GATC,PI601208;TCAC,PI406122;AGGAT,PI303939;ATTGA,Ames24751;CATCT,Ames24732;CCTAC,Ames27451;GAGGA,PI587124;GGAAC,Ames23463;GTCAA,Ames23446;TAATA,Ames27019;TACAT,Ames24745;TCGTT,Ames23423;ACCTAA,NSL30074;ATATGT,PI601319;ATCGTA,PI587134;CATCGT,Ames22037;CGCGGT,Ames24737;CTATTA,PI638550;GCCAGT,Ames24742;GGAAGA,PI567792;GTACTT,Ames22038;GTTGAA,PI600957;TAACGA,Ames24706;TGGCTA,Ames23480;ACGTGTT,Ames23435;ATTAATT,NSL30066;ATTGGAT,PI524970;CATAAGT,Ames23421;CGCTGAT,Ames23500;CGGTAGA,Ames23401;CTACGGA,NSL30880;GCGGAAT,PI601492;TAGCGGA,Ames22064;TCGAAGA,PI586935;TCTGTGA,Ames27021;TGCTGGA,Ames23424;AACCGAGA,Ames23431;ACAGGGAA,Ames23497;ACGTGGTA,PI601376;CCATGGGT,PI601570;CGCGGAGA,PI538244;CGTGTGGT,PI198894;GCTGTGGA,Ames23510;GGATTGGT,Ames23407;GTGAGGGT,Ames23471;TATCGGGA,PI405712;TTCCTGGA,blank;CTCC,Ames24740;TGCA,Ames23476;ACTA,Ames19292;CAGA,PI601150;AACT,Ames23485;GCGT,PI601564;TGCGA,Ames23417;CGAT,PI520770;CGCTT,PI233320;TCACC,Ames23403;CTAGC,SA24;ACAAA,Ames23455;TTCTC,Ames24716;AGCCC,Ames19288;GTATT,B73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Zea mays
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