SAMN02116450
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-05-03T12:29:30.900Z
INSDC first public
2013-05-06T13:47:12.633Z
INSDC last update
SRS418800
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS418800
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,CKDHL0418;TGCA,CKDHL0429;ACTA,CKDHL0437;CAGA,CKDHL0446;AACT,CKDHL0454;GCGT,CKDHL0464;TGCGA,CKDHL0472;CGAT,CKDHL0480;CGCTT,CKDHL0491;TCACC,PI601322-3;CTAGC,PI539927-1;ACAAA,PI538011-1;TTCTC,CKDHL0420;AGCCC,CKDHL0430;GTATT,CKDHL0438;CTGTA,CKDHL0447;ACCGT,CKDHL0457;GTAA,CKDHL0465;GGTTGT,CKDHL0473;CCAGCT,CKDHL0483;TTCAGA,CKDHL0492;TAGGAA,PI539926-1;GCTCTA,PI538009-1;CCACAA,CKDHL0140;GCTTA,CKDHL0421;CTTCCA,CKDHL0431;GAGATA,CKDHL0439;ATGCCT,CKDHL0448;TATTTTT,CKDHL0458;CTTGCTT,CKDHL0466;ATGAAAC,CKDHL0474;AAAAGTT,CKDHL0484;GAATTCA,CKDHL0493;GAACTTC,CKDHL0502;GGACCTA,PI539924-1;GTCGATT,CKDHL0149;AACGCCT,CKDHL0422;AATATGC,CKDHL0432;ACGACTAC,CKDHL0440;GGTGT,CKDHL0449;TAGCATGC,CKDHL0459;AGTGGA,CKDHL0467;TAGGCCAT,CKDHL0475;TGCAAGGA,CKDHL0485;TGGTACGT,CKDHL0494;TCTCAGTC,CKDHL0503;CCGGATAT,CKDHL0511;CGCCTTAT,Blank;AGGC,CKDHL0423;GATC,CKDHL0433;TCAC,CKDHL0441;AGGAT,CKDHL0450;ATTGA,CKDHL0460;CATCT,CKDHL0468;CCTAC,CKDHL0476;GAGGA,CKDHL0486;GGAAC,CKDHL0496;GTCAA,CKDHL0504;TAATA,CKDHL0512;TACAT,CKDHL0521;TCGTT,CKDHL0424;ACCTAA,CKDHL0434;ATATGT,CKDHL0443;ATCGTA,CKDHL0451;CATCGT,CKDHL0461;CGCGGT,CKDHL0469;CTATTA,CKDHL0477;GCCAGT,CKDHL0487;GGAAGA,CKDHL0497;GTACTT,CKDHL0505;GTTGAA,CKDHL0513;TAACGA,CKDHL0523;TGGCTA,CKDHL0427;ACGTGTT,CKDHL0435;ATTAATT,CKDHL0444;ATTGGAT,CKDHL0452;CATAAGT,CKDHL0462;CGCTGAT,CKDHL0470;CGGTAGA,CKDHL0478;CTACGGA,CKDHL0489;GCGGAAT,CKDHL0498;TAGCGGA,CKDHL0506;TCGAAGA,CKDHL0514;TCTGTGA,CKDHL0524;TGCTGGA,CKDHL0428;AACCGAGA,CKDHL0436;ACAGGGAA,CKDHL0445;ACGTGGTA,CKDHL0453;CCATGGGT,CKDHL0463;CGCGGAGA,CKDHL0471;CGTGTGGT,CKDHL0479;GCTGTGGA,CKDHL0490;GGATTGGT,CKDHL0499;GTGAGGGT,CKDHL0507;TATCGGGA,CKDHL0515;TTCCTGGA,CKDHL0525;)
description
Zea mays
http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_4577
organism
pooled
http://www.ebi.ac.uk/efo/EFO_0000663
strain
Generic sample from Zea mays
title