SAMN02116447
External Id
Cornell University
INSDC center name
2013-05-03T12:29:31.727Z
INSDC first public
2013-05-06T13:36:13.460Z
INSDC last update
SRS418797
INSDC secondary accession
live
INSDC status
Generic
NCBI submission model
Generic.1.0
NCBI submission package
SRS418797
SRA accession
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,CKDHL0079;TGCA,CKDHL0089;ACTA,CKDHL0097;CAGA,CKDHL0105;AACT,CKDHL0114;GCGT,CKDHL0123;TGCGA,CKDHL0132;CGAT,CKDHL0141;CGCTT,CKDHL0150;TCACC,CKDHL0160;CTAGC,CKDHL0169;ACAAA,CKDHL0177;TTCTC,CKDHL0080;AGCCC,CKDHL0090;GTATT,CKDHL0098;CTGTA,CKDHL0106;ACCGT,CKDHL0115;GTAA,CKDHL0124;GGTTGT,CKDHL0133;CCAGCT,CKDHL0142;TTCAGA,CKDHL0151;TAGGAA,CKDHL0161;GCTCTA,CKDHL0170;CCACAA,CKDHL0178;GCTTA,CKDHL0081;CTTCCA,CKDHL0091;GAGATA,CKDHL0099;ATGCCT,CKDHL0107;TATTTTT,CKDHL0116;CTTGCTT,CKDHL0126;ATGAAAC,CKDHL0134;AAAAGTT,CKDHL0143;GAATTCA,CKDHL0152;GAACTTC,CKDHL0162;GGACCTA,CKDHL0171;GTCGATT,CKDHL0179;AACGCCT,CKDHL0082;AATATGC,CKDHL0092;ACGACTAC,CKDHL0100;GGTGT,CKDHL0108;TAGCATGC,CKDHL0117;AGTGGA,CKDHL0127;TAGGCCAT,CKDHL0135;TGCAAGGA,CKDHL0144;TGGTACGT,CKDHL0153;TCTCAGTC,CKDHL0163;CCGGATAT,CKDHL0172;CGCCTTAT,CKDHL0180;AGGC,CKDHL0084;GATC,CKDHL0093;TCAC,CKDHL0101;AGGAT,CKDHL0109;ATTGA,CKDHL0119;CATCT,CKDHL0128;CCTAC,CKDHL0136;GAGGA,CKDHL0146;GGAAC,CKDHL0154;GTCAA,CKDHL0164;TAATA,CKDHL0173;TACAT,CKDHL0181;TCGTT,CKDHL0085;ACCTAA,CKDHL0094;ATATGT,CKDHL0102;ATCGTA,CKDHL0110;CATCGT,CKDHL0120;CGCGGT,CKDHL0129;CTATTA,CKDHL0137;GCCAGT,CKDHL0147;GGAAGA,CKDHL0155;GTACTT,CKDHL0166;GTTGAA,CKDHL0174;TAACGA,CKDHL0182;TGGCTA,CKDHL0087;ACGTGTT,CKDHL0095;ATTAATT,CKDHL0103;ATTGGAT,CKDHL0111;CATAAGT,CKDHL0121;CGCTGAT,CKDHL0130;CGGTAGA,CKDHL0138;CTACGGA,CKDHL0148;GCGGAAT,CKDHL0157;TAGCGGA,CKDHL0167;TCGAAGA,CKDHL0175;TCTGTGA,CKDHL0183;TGCTGGA,CKDHL0088;AACCGAGA,CKDHL0096;ACAGGGAA,CKDHL0104;ACGTGGTA,CKDHL0112;CCATGGGT,CKDHL0122;CGCGGAGA,CKDHL0131;CGTGTGGT,CKDHL0140;GCTGTGGA,CKDHL0149;GGATTGGT,CKDHL0158;GTGAGGGT,CKDHL0168;TATCGGGA,CKDHL0176;TTCCTGGA,CKDHL0184;)
description
Zea mays
http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_4577
organism
pooled
http://www.ebi.ac.uk/efo/EFO_0000663
strain
Generic sample from Zea mays
title