title: CHC1975T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status


title: R2_C92

status: Public on Apr 05 2019

type: SRA

city: Oklahoma City

first: Kurt

last: Zimmerman

state: Oklahoma

address: 940 Stanton L Young Blvd

department: Internal Medicine

country: USA

institute: University of Oklahoma Health Sciences Center

description:
processed data file:
mouse_rsem-TPM-genes_annotated.xlsx
single cell

library_source: transcriptomic

data_processing:
Illumina bcl2fastq version 2.18.0.12 software was used for basecalling.
Fastq files were trimmed using TrimGalore! version 0.5.0 with parameters: --paired, --trim1
Trimmed fastq files were aligned using RSEM version 1.2.31 with parameters: --star, --star-gzipped-read-file --paired-end
Count files were loaded into the Fluidigm Singular version 3.6.1 for identification of clusters and genes.
Genome_build: mm10 or GRch38
Supplementary_files_format_and_content: tab-delimited Excel file containing gene symbols with their respective TPM expression for each cell/barcode.

molecule: total RNA

organism: Mus musculus

source_name: kidney

extract_protocol:
Immune cell populations were sorted using a BD FACS Aria II. Single cells were loaded into the C1 machine to prepare cDNA libraries as described below
Fluidigm single cell cDNA libraries were prepared according to standard procedures outlined in “Using C1 to Generate Single-Cell cDNA Libraries for mRNA Sequencing”. Briefly, sorted macrophages were resuspended into a final concentration of 300~350 cells/ul in D-PBS and mixed with Fluidigm suspension reagent to reach 55% final buoyancy as determined by pre-testing. Six ul of mixed cells were loaded into the Fluidigm C1 IFC plate for mRNA seq (10–17 μm capture site) (Fluidigm PN 100-5760). Captured single cells were confirmed via bright field microscopy. Next, lysis mix, transverse transcription mix and pre-amplification mix were loaded into the C1 plate as instructed and single cell pre-amplified cDNA libraries were generated by the C1 machine using the program “mRNA Seq: RT & Amp (1771x/1772x/ 1773x) script”. Illumina Sequencing Libraries were prepared from pre-amplified single cell cDNA with Nextera XT DNA Sample Preparation Kit (Illumina PN FC-131-1096), following sequential steps of tagmentation, PCR amplification and pooling, and cleaning of the libraries.

tag: tissue

value: kidney

tag: cell type

value: macrophages

tag: strain

tag: age

value: 8 weeks old

tag: Sex

value: Male


title: L7CN85_E1

city: Cambridge

first: Sanja

last: Vickovic

address: 415 Main Street

institute: Broad Institute of MIT and Harvard

data_processing:
ST Pipeline v0.8.5
Image alignment in ImageJ
ST aligner v0.1
ST Annotator v0.2
Genome_build: GRCm38.v79
Supplementary_files_format_and_content: counts: tab-delimited text files include raw UMI filtered counts for each ST spot; processed using ST Pipeline v0.8.5
Tissue jpg image: Aligned and processed HE stainesd image in a coordinate system; colnames in the counts files; processed using ST aligner v0.1
Annotation file: columns for the counts file are associate with an anatomical region tab used ST Annotator v0.2
Barcode file: Barcode file needed for spatial demultiplexing of each sample; used in ST Pipeline v0.8.5. Column1 corresponds to the first 18 bp in the R1.fastq.gz; Column2 corresponds to x and Columns3 to y in a (x.y) Cartesian system on an ST array. In processed files 1, 2 and 4 the x_y values can be rouned and will correspond to Columns 2 and 3 (x,y) in the respective barcode files.

molecule: polyA RNA

source_name: RNA-Seq of Mus musculus: p120 female spinal cord

extract_protocol:
Spatial Transcriptomics
RNA libraries were prepared for sequencing using standard Illumina protocols

value: spinal cord

tag: mouse id

tag: genotype

value: female


title: R2_C93


title: L7CN85_D2


title: R2_C91


title: CHC1973T

type: RNA

city: Paris

first: Sandrine

last: Imbeaud

address: 15 rue de l'Ecole de Médecine

department: INSERM UMRS1138-EQUIPE 28, Sorbonne Université-Inserm-Université de Paris

country: France

institute: Centre de Recherche des Cordeliers

description:
MUTHEC
test

data_processing: Expression level (Ct values) was assessed using the Fluidigm Real-Time PCR Analysis software (4.1.3). Gene expression data were expressed using the 2-DDCt method relative to ribosomal 18S (R18S) and the expression level of the corresponding gene in normal liver samples. Final results were reported in 2- delta delta CT representing fold change compared to normal livers

label: taqman assay

organism: Homo sapiens

source_name: liver tumor

label_protocol: We performed reverse transcription of 500 ng of total RNA using the High-Capacity Transcription Kit (Life Technologies) and assess gene expression using TaqMan predesigned assays (Life Technologies) on Fluidigm 96 dynamic arrays with the Bio-Mark Real-Time PCR system.

extract_protocol: Total RNA from frozen surgical samples was extracted using Maxwell 16 LEV simplyRNA Tissue kit (Promega, cat#AS1280) and from frozen biopsies using AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit (QIAGEN, cat #80224) according to the manufacturer’s instructions. DNAs were quantified using a Qubit 2.0 fluorometer (Qubit dsDNA BR assay kit, LifeTechnologies – ThermoFisher Scientifics) and quality was assessed as previously described. RNA was quantified using a spectrophotometer at 260nm (Nanodrop) and quality of RNA was controlled by Qiaxcell gel electrophoresis (Qiagen).

tag: gender

value: M

tag: diagnosis

value: HCC

tag: type

value: TRANSPLANT

value: no

tag: alcohol

value: yes

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: A

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

value: NM

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: CHC1969T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: B

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status


title: CHC1987T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

value: RESECTION

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation

tag: tsc1 status

tag: tsc1 mutation

tag: tsc2 status

tag: tsc2 mutation


title: CHC1968T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status


title: R2_C90

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: L7CN85_D1

tag: mouse id

tag: genotype


title: CHC197T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation


title: L7CN85_C2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: R2_C84

tag: cell type

tag: strain


title: CHC1967T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: CHC1966T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: setd2 mutation


title: R2_C82

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: L7CN85_C1

tag: mouse id

tag: genotype


title: CHC1965T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: CHC1963T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation


title: L7CN86_E2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: CHC1959T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation


title: CHC195T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation


title: CHC1972T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation


title: CHC1960T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation


title: R2_C81

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: R2_C80


title: L7CN86_D2

tag: mouse id

tag: genotype


title: CHC1958T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation


title: L7CN86_C2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: CHC1954T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: R2_C78

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: L7CN87_E2

source_name: RNA-Seq of Mus musculus: p100 male spinal cord

tag: mouse id

tag: genotype

value: male


title: L7CN86_C1


title: R2_C74


title: CHC1953T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: CHC191T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: C

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: L7CN87_E1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: CHC189T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation


title: CHC190T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1961T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation


title: CHC1764T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1776T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation

tag: tsc1 status

tag: tsc1 mutation

tag: tsc2 status

tag: tsc2 mutation


title: CHC188T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: F

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: R2_C73

tag: tissue

value: kidney

tag: cell type

value: macrophages

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: L7CN89_E1

source_name: RNA-Seq of Mus musculus: p70 female spinal cord

tag: mouse id

tag: genotype


title: R2_C64

value: 8 weeks old

value: Male


title: R2_C61


title: CHC1763T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1757T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation


title: L7CN89_D2

tag: tissue

value: spinal cord

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex

value: female


title: R2_C79

tag: cell type

tag: strain


title: CHC1754T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: M

tag: diagnosis

value: HCC

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

value: p.A45dup In_Frame_Ins

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: R2_C60

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1756T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

value: no

tag: alcohol

value: yes

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1753T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: A

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

value: NM

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: L7CN89_D1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: CHC1952T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

value: TRANSPLANT

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: L7CN90A_D1

source_name: RNA-Seq of Mus musculus: p70 male spinal cord

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex

value: male


title: CHC1749T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

value: RESECTION

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: L7CN90A_E1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: R2_C56

tag: cell type

tag: strain


title: CHC1747T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: C

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: L7CN90A_C2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: L7CN90A_C1


title: CHC1751T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1746T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

value: Splice_Site p.E224

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1745T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: F

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: R2_C47

tag: tissue

value: kidney

tag: cell type

value: macrophages

tag: strain

tag: age

value: 8 weeks old

tag: Sex


title: R2_C53

value: Male


title: L7CN90_E1

source_name: RNA-Seq of Mus musculus: p100 female spinal cord

value: spinal cord

tag: mouse id

tag: genotype

value: female


title: R2_C46


title: L7CN90_C2


title: CHC1742T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: M

tag: diagnosis

value: HCC

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1743T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

value: no

tag: alcohol

value: yes

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1738T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

value: NM

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation


title: R2_C42

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1956T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

value: TRANSPLANT

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: A

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: CHC1739T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

value: RESECTION

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: R2_C39

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1737T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: L7CN91_E2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex

value: male


title: CHC1734T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation


title: R2_C55

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: L7CN91_E1

tag: mouse id

tag: genotype


title: L7CN91_D2


title: R2_C36


title: CHC1732T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1741T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1744T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation


title: R2_C34

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1720T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: B

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

value: Splice_Site p.A307

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1731T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: F

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: jak1 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1719T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation


title: CHC1715T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: jak1 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1717T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: R2_C32

tag: tissue

value: kidney

tag: cell type

value: macrophages

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1714T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: jak1 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: L7CN91_C2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: CHC1712T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: L7CN92_E2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: R2_C30

tag: cell type

tag: strain

value: 8 weeks old

value: Male


title: R2_C28


title: R2_C23


title: CHC1725T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: L7CN92_D2

tag: tissue

value: spinal cord

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex

value: female


title: CHC170T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: M

tag: diagnosis

value: HCC

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: jak1 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation

tag: tsc1 status

tag: tsc1 mutation

tag: tsc2 status

tag: tsc2 mutation


title: R2_C21

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1706T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

value: no

tag: alcohol

value: yes

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status


title: CHC1704T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

value: NM

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status


title: L7CN91_D1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: CHC168T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: A

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation


title: R2_C14

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1700T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

value: RESECTION

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1710T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation

tag: tsc1 status

tag: tsc1 mutation

tag: tsc2 status

tag: tsc2 mutation


title: CHC1659T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

value: TRANSPLANT

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: L7CN92_C2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: L7CN92_D1


title: CHC164T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: B

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation


title: CHC1629T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1626T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: C

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

value: p.G914Afs + p.Q1519Pfs

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: L7CN92_C1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: L7CN93_E2

value: male


title: CHC1624T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: R2_C10

tag: tissue

value: kidney

tag: cell type

value: macrophages

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: R2_C13

value: 8 weeks old

value: Male


title: CHC1617T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: F

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: CHC1623T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: M

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: setd2 mutation

tag: tsc1 status

tag: tsc1 mutation

tag: tsc2 status

tag: tsc2 mutation


title: CHC1616T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

value: HCC

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: L7CN97_E2

source_name: RNA-Seq of Mus musculus: p30 male spinal cord

tag: tissue

value: spinal cord

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: R2_C12

tag: cell type

tag: strain


title: R2_C06


title: L7CN91_C1


title: L7CN97_E1


title: R2_C03


title: CHC1611T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

value: no

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

value: yes

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: R2_C05

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: L7CN97_D1

tag: mouse id

tag: genotype


title: CHC1609T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: A

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

value: NM

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: CHC1615T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

value: TRANSPLANT

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1602T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

value: RESECTION

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1708T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation


title: L7CN97_C2

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: CHC1603T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

value: HD

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1604T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation


title: R1_C95

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1600T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1598T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: L7CN97_C1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: L7CN97_D2


title: L7CN96_E2


title: CHC1597T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: C

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: R1_C91

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1596T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: CHC1594T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1595T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation


title: CHC1608T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: R1_C87

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: CHC1601T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: L7CN96_E1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex

value: male


title: L7CN96_D2


title: CHC1592T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation


title: L7CN96_D1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: R1_C85

value: kidney

tag: cell type

tag: strain


title: CHC1591T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status


title: R1_C83

tag: tissue

tag: cell type

value: macrophages

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: R1_C93

value: 8 weeks old


title: R1_C84

value: Male


title: CHC158T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation


title: L7CN96_C1

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: CHC1590T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: setd2 status


title: CHC1588T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 mutation

tag: tsc1 status

tag: tsc1 mutation

tag: tsc2 status

tag: tsc2 mutation


title: CHC1587T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: F

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: setd2 status


title: L7CN95_E1

source_name: RNA-Seq of Mus musculus: p30 female spinal cord

tag: tissue

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex

value: female


title: CHC1582T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

value: M

tag: diagnosis

value: HCC

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1574T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

value: no

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status


title: CHC1573T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

value: yes

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: R1_C90

tag: tissue

tag: cell type

tag: strain

tag: age

tag: Sex


title: R1_C81


title: CHC1570T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

value: A

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: atm mutation

tag: cdkn1a status

tag: cdkn1a mutation

tag: map1b status

tag: map1b mutation

tag: mll2 status

tag: mll2 mutation

tag: setd2 status

tag: setd2 mutation

tag: tsc1 status

tag: tsc1 mutation

tag: tsc2 status


title: L7CN95_D2

tag: tissue

value: spinal cord

tag: mouse id

tag: genotype

tag: age

tag: Sex


title: R1_C78

tag: cell type

tag: strain


title: CHC1569T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

value: NM

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status


title: CHC1566T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

value: RESECTION

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: arid2 mutation

tag: il6st status

tag: il6st mutation

tag: rps6ka3 status

tag: rps6ka3 mutation

tag: nfe2l2 status

tag: nfe2l2 mutation

tag: keap1 status

tag: keap1 mutation

tag: pik3ca status

tag: pik3ca mutation

tag: irf2 status

tag: irf2 mutation

tag: jak1 status

tag: jak1 mutation

tag: gnas status


title: CHC1568T

description:
MUTHEC
test

tag: gender

tag: age

tag: diagnosis

tag: type

tag: alcohol

tag: hemochromatosis

tag: metavir fibrosis

tag: bclc

tag: serumalphafoeto (ui)

tag: tert status

tag: tert mutation

tag: ctnnb1 status

tag: ctnnb1 mutation

tag: tp53 status

tag: tp53 mutation

tag: arid1a status

tag: arid1a mutation

value: p.Q372Rfs + p.P726Sfs

tag: axin1 status

tag: axin1 mutation

tag: cdkn2a status

tag: cdkn2a mutation

tag: arid2 status

tag: gnas mutation

tag: braf status

tag: braf mutation

tag: stat3 status

tag: stat3 mutation

tag: kras status

tag: kras mutation

tag: nras status

tag: hras

tag: hnf1a status

tag: hnf1a mutation

tag: alb status

tag: alb mutation

tag: apob status

tag: apob mutation

tag: atm status