title: Association of group A streptococcal emm types with virulence traits and macrolide-resistance genes is independent of the source of isolation.
abstract: Streptococcus pyogenes (group A streptococci; GAS) recovered from paediatric pharyngitis (101 isolates) and asymptomatic children (79 isolates) in the same geographical area and period, as well as isolates collected during an enhanced national surveillance programme for GAS invasive diseases (79 isolates), were screened for the incidence of the streptococcal pyrogenic exotoxin (spe) genes speA and speC, as well as the macrolide-resistance genes erm(B), erm(A) subclass erm(TR) and mef(A), and typed by emm sequencing. The speA gene was detected with comparable incidence among throat isolates (13.9 % of asymptomatic children and 16.8 % of pharyngitis isolates) and in 25 % of invasive cases; in contrast, speC incidence was, surprisingly, higher in paediatric populations (55.4 % in pharyngitis isolates and 65.8 % in asymptomatic children) than in invasive isolates (30 %; P < 0.0001). Macrolide resistance was detected in 26.6, 38.0 and 37.6 % of strains belonging to invasive, asymptomatic and pharyngitis populations, respectively. The different incidences of exotoxin and antibiotic-resistance genes among populations did not appear to have an intrinsic clinical significance, but may reflect the propensity of these traits to be associated with certain emm types independent of the source from which the strains were isolated. Further investigations with larger emm-type populations are warranted to confirm this.
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Roberta
authors.initials: R
authors.lastname: Creti
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Giovanni
authors.initials: G
authors.lastname: Gherardi
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Monica
authors.initials: M
authors.lastname: Imperi
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Christina
authors.initials: C
authors.lastname: von Hunolstein
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Lucilla
authors.initials: L
authors.lastname: Baldassarri
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Marco
authors.initials: M
authors.lastname: Pataracchia
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Giovanna
authors.initials: G
authors.lastname: Alfarone
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Francesco
authors.initials: F
authors.lastname: Cardona
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Giordano
authors.initials: G
authors.lastname: Dicuonzo
authors.affiliation: Dipartimento di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, Italy 2Dipartimento di Medicina di Laboratorio e Microbiologia, Università Campus Biomedico, Via Emilio Longoni 83, 00155 Rome, Italy 3Dipartimento di Scienze Neurologiche, Psichiatriche e Riabilitative dell'Età Evolutiva, Università 'La Sapienza', Via dei Sabelli 108, 00185 Rome, Italy.
authors.forename: Graziella
authors.initials: G
authors.lastname: Orefici
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