title: Shedding some light over the floral metabolism by arum lily (Zantedeschia aethiopica) spathe de novo transcriptome assembly.
abstract: Zantedeschia aethiopica is an evergreen perennial plant cultivated worldwide and commonly used for ornamental and medicinal purposes including the treatment of bacterial infections. However, the current understanding of molecular and physiological mechanisms in this plant is limited, in comparison to other non-model plants. In order to improve understanding of the biology of this botanical species, RNA-Seq technology was used for transcriptome assembly and characterization. Following Z. aethiopica spathe tissue RNA extraction, high-throughput RNA sequencing was performed with the aim of obtaining both abundant and rare transcript data. Functional profiling based on KEGG Orthology (KO) analysis highlighted contigs that were involved predominantly in genetic information (37%) and metabolism (34%) processes. Predicted proteins involved in the plant circadian system, hormone signal transduction, secondary metabolism and basal immunity are described here. In silico screening of the transcriptome data set for antimicrobial peptide (AMP) -encoding sequences was also carried out and three lipid transfer proteins (LTP) were identified as potential AMPs involved in plant defense. Spathe predicted protein maps were drawn, and suggested that major plant efforts are expended in guaranteeing the maintenance of cell homeostasis, characterized by high investment in carbohydrate, amino acid and energy metabolism as well as in genetic information.
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Elizabete de Souza
authors.initials: Ede S
authors.lastname: Cândido
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Gabriel da Rocha
authors.initials: Gda R
authors.lastname: Fernandes
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Sérgio Amorim
authors.initials: SA
authors.lastname: de Alencar
authors.affiliation: Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Marlon Henrique e Silva
authors.initials: MH
authors.lastname: Cardoso
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Stella Maris de Freitas
authors.initials: SM
authors.lastname: Lima
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Vívian de Jesus
authors.initials: Vde J
authors.lastname: Miranda
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: William Farias
authors.initials: WF
authors.lastname: Porto
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Curso de Física, Universidade Católica de Brasília, Brasília - DF, Brazil.
authors.forename: Diego Oliveira
authors.initials: DO
authors.lastname: Nolasco
authors.affiliation: Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, Universidade de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Nelson Gomes
authors.initials: NG
authors.lastname: de Oliveira-Júnior
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Aulus Estevão Anjos de Deus
authors.initials: AE
authors.lastname: Barbosa
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Robert Edward
authors.initials: RE
authors.lastname: Pogue
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Curso de Odontologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília - DF, Brazil.
authors.forename: Taia Maria Berto
authors.initials: TM
authors.lastname: Rezende
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Simoni Campos
authors.initials: SC
authors.lastname: Dias
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil; Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas, Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, Brasília-DF, Brazil.
authors.forename: Octávio Luiz
authors.initials: OL
authors.lastname: Franco
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