Hsa-miR-31-3p expression is linked to progression-free survival in patients with KRAS wild-type metastatic colorectal cancer treated with anti-EGFR therapy.
OBJECTIVE
To identify microRNAs (miRNA) that predict response to anti-EGFR antibodies in patients with wild-type KRAS metastatic colorectal cancer (mCRC).


METHODS
miRNA profiling was performed in a training set of 87 patients with mCRC refractory to chemotherapy treated with anti-EGFR antibodies. This included 33 fresh-frozen (FF) and 35 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples retrospectively collected and 19 prospectively collected FF samples. An independent validation cohort consisting of 19 FF and 26 FFPE prospectively collected samples from patients with mCRC treated with anti-EGFR antibodies was used to confirm our findings.


RESULTS
After screening the expression of 1,145 miRNAs in FF samples from the training set, we identified that hsa-miR-31-3p expression level was significantly associated with progression-free survival (PFS). Statistical models based on miRNA expression discriminated between high and low risk of progression for both FF and FFPE samples. These models were confirmed in the validation cohort for both FF [HR, 4.1; 95% confidence interval (CI), 1.1-15.3; P < 0.04] and FFPE samples (HR, 2.44; 95% CI, 1.1-5.4; P = 0.028). The percentage of variation of RECIST criteria in the validation series was significantly associated with the expression level of hsa-miR-31-3p (r(2) = 0.49; P = 0.0035) and risk status determined by hsa-miR-31-3p expression level (P = 0.02, Kruskal-Wallis rank test). Nomograms were built and validated to predict PFS-depending on hsa-miR-31-3p expression level. Following in vitro studies, we identified 47 genes regulated by hsa-miR-31-3p.


CONCLUSIONS
Hsa-miR-31-3p seems to be a new mCRC biomarker whose expression level allows for the identification of patients with wild-type KRAS mCRC who are more likely to respond to anti-EGFR therapy.
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, FinlandAuthors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpit
Gilles
G
Manceau
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Sandrine
S
Imbeaud
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Raphaële
R
Thiébaut
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
François
F
Liébaert
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Karine
K
Fontaine
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Francis
F
Rousseau
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Bérengère
B
Génin
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Delphine
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Le Corre
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Audrey
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Didelot
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Marc
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Vincent
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Jean-Baptiste
JB
Bachet
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Benoist
B
Chibaudel
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Olivier
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Bouché
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Bruno
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Landi
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Frédéric
F
Bibeau
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Karen
K
Leroy
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Frédérique
F
Penault-Llorca
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Jean-Luc
JL
Van Laethem
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Pieter
P
Demetter
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Sabine
S
Tejpar
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Simona
S
Rossi
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Neda
N
Mosakhani
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Pia
P
Osterlund
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Raija
R
Ristamäki
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Virinder
V
Sarhadi
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, FinlandAuthors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpit
Sakari
S
Knuutila
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, FinlandAuthors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpit
Valérie
V
Boige
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland.
Thierry
T
André
Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, FinlandAuthors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpit
Pierre
P
Laurent-Puig
D000328:Adult; D000368:Aged; D000369:Aged, 80 and over; D000971:Antineoplastic Combined Chemotherapy Protocols / Q000627:therapeutic use*; D014408:Biomarkers, Tumor / Q000235:genetics*; D015179:Colorectal Neoplasms / Q000188:drug therapy / Q000235:genetics / Q000401:mortality* / Q000473:pathology; D066246:ErbB Receptors / Q000037:antagonists & inhibitors*; D005260:Female; D005500:Follow-Up Studies; D006801:Humans; D008113:Liver Neoplasms / Q000188:drug therapy / Q000235:genetics / Q000401:mortality* / Q000556:secondary; D008297:Male; D035683:MicroRNAs / Q000235:genetics*; D008875:Middle Aged; D009154:Mutation / Q000235:genetics*; D009367:Neoplasm Staging; D016612:Paraffin Embedding; D011379:Prognosis; D011446:Prospective Studies; D011518:Proto-Oncogene Proteins / Q000235:genetics*; D016283:Proto-Oncogene Proteins p21(ras); D012189:Retrospective Studies; D015996:Survival Rate; D055815:Young Adult; D018631:ras Proteins / Q000235:genetics*
D014408:Biomarkers, Tumor; C117307:KRAS protein, human; C534612:MIRN31 microRNA, human; D035683:MicroRNAs; D011518:Proto-Oncogene Proteins; C512478:EGFR protein, human; D066246:ErbB Receptors; D016283:Proto-Oncogene Proteins p21(ras); D018631:ras Proteins