Tumour necrosis factor -308 and -238 promoter polymorphisms are predictors of a null virological response in the treatment of Brazilian hepatitis C patients.
Certain host single nucleotide polymorphisms (SNPs) affect the likelihood of a sustained virological response (SVR) to treatment in subjects infected with hepatitis C virus (HCV). SNPs in the promoters of interleukin (IL)-10 (-1082 A/G, rs1800896), myxovirus resistance protein 1 (-123 C/A, rs17000900 and -88 G/T, rs2071430) and tumour necrosis factor (TNF) (-308 G/A, rs1800629 and -238 G/A, rs361525) genes and the outcome of PEGylated α-interferon plus ribavirin therapy were investigated. This analysis was performed in 114 Brazilian, HCV genotype 1-infected patients who had a SVR and in 85 non-responders and 64 relapsers. A significantly increased risk of having a null virological response was observed in patients carrying at least one A allele at positions -308 [odds ratios (OR) = 2.58, 95% confidence intervals (CI) = 1.44-4.63, p = 0.001] or -238 (OR = 7.33, 95% CI = 3.59-14.93, p < 0.001) in the TNF promoter. The risk of relapsing was also elevated (-308: OR = 2.87, 95% CI = 1.51-5.44, p = 0.001; -238: OR = 4.20, 95% CI = 1.93-9.10, p < 0.001). Multiple logistic regression of TNF diplotypes showed that patients with at least two copies of the A allele had an even higher risk of having a null virological response (OR = 16.43, 95% CI = 5.70-47.34, p < 0.001) or relapsing (OR = 6.71, 95% CI = 2.18-20.66, p = 0.001). No statistically significant association was found between the other SNPs under study and anti-HCV therapy response.
Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Porto Alegre, RS, Brasil.
Tarciana
T
Grandi
Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Porto Alegre, RS, Brasil.
Cláudia Maria Dornelles da
CM
Silva
Centro de Aplicação e Monitorização de Medicamentos Injetáveis, Porto Alegre, RS, Brasil.
Karine Medeiros
KM
Amaral
Centro de Aplicação e Monitorização de Medicamentos Injetáveis, Porto Alegre, RS, Brasil.
Paulo Dornelles
PD
Picon
Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Porto Alegre, RS, Brasil.
Cintia
C
Costi
Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Porto Alegre, RS, Brasil.
Nicole Nascimento da
NN
Fré
Universidade Federal de Ciências da Saúde, Porto Alegre, RS, Brasil.
Marilu
M
Fiegenbaum
Laboratório de Vírus Respiratórios, Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Porto Alegre, RS, Brasil.
Tatiana Schäffer
TS
Gregianini
Laboratório de Virologia Molecular, Instituto Oswaldo Cruz-Fiocruz, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Christian
C
Niel
Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Porto Alegre, RS, Brasil.
Maria Lucia Rosa
ML
Rossetti
D000998:Antiviral Agents / Q000008:administration & dosage*; D004359:Drug Therapy, Combination; D005260:Female; D005838:Genotype; D016174:Hepacivirus / Q000187:drug effects*; D019698:Hepatitis C, Chronic / Q000188:drug therapy* / Q000235:genetics; D006801:Humans; D016898:Interferon-alpha / Q000008:administration & dosage*; D016753:Interleukin-10 / Q000235:genetics; D008297:Male; D008875:Middle Aged; D064547:Myxovirus Resistance Proteins / Q000235:genetics; D020641:Polymorphism, Single Nucleotide; D011401:Promoter Regions, Genetic; D012254:Ribavirin / Q000008:administration & dosage*; D017211:Treatment Failure; D014409:Tumor Necrosis Factor-alpha / Q000235:genetics*; D019562:Viral Load
D000998:Antiviral Agents; D016898:Interferon-alpha; D064547:Myxovirus Resistance Proteins; D014409:Tumor Necrosis Factor-alpha; D016753:Interleukin-10; D012254:Ribavirin