title: Complete genome sequence of the actinobacterium Amycolatopsis japonica MG417-CF17(T) (=DSM 44213T) producing (S,S)-N,N'-ethylenediaminedisuccinic acid.
abstract: We report the complete genome sequence of Amycolatopsis japonica MG417-CF17(T) (=DSM 44213(T)) which was identified as the producer of (S,S)-N,N'-ethylenediaminedisuccinic acid during a screening for phospholipase C inhibitors. The genome of A. japonica MG417-CF17(T) consists of two replicons: the chromosome (8,961,318 bp, 68.89% G+C content) and the plasmid pAmyja1 (92,539 bp, 68.23% G+C content), encoding a total of 8422 protein coding genes. Analysis of the sequence data revealed 30 clusters encoding the biosynthesis of secondary metabolites.
authors.affiliation: Mikrobiologie und Biotechnologie, Interfakultäres Institut für Mikrobiologie und Infektionsmedizin/Deutsches Zentrum für Infektionsforschung, Universität Tübingen, Auf der Morgenstelle 28, 72076 Tübingen, Germany. Electronic address: Evi.Stegmann@Biotech.Uni-Tuebingen.DE.
authors.forename: Evi
authors.initials: E
authors.lastname: Stegmann
authors.affiliation: Technology Platform Genomics, Center for Biotechnology (CeBiTec), Bielefeld University, Sequenz 1, 33615 Bielefeld, Germany.
authors.forename: Andreas
authors.initials: A
authors.lastname: Albersmeier
authors.affiliation: Mikrobiologie und Biotechnologie, Interfakultäres Institut für Mikrobiologie und Infektionsmedizin/Deutsches Zentrum für Infektionsforschung, Universität Tübingen, Auf der Morgenstelle 28, 72076 Tübingen, Germany.
authors.forename: Marius
authors.initials: M
authors.lastname: Spohn
authors.affiliation: Mikrobiologie und Biotechnologie, Interfakultäres Institut für Mikrobiologie und Infektionsmedizin/Deutsches Zentrum für Infektionsforschung, Universität Tübingen, Auf der Morgenstelle 28, 72076 Tübingen, Germany.
authors.forename: Helena
authors.initials: H
authors.lastname: Gert
authors.affiliation: Mikrobiologie und Biotechnologie, Interfakultäres Institut für Mikrobiologie und Infektionsmedizin/Deutsches Zentrum für Infektionsforschung, Universität Tübingen, Auf der Morgenstelle 28, 72076 Tübingen, Germany; The Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability, Technical University of Denmark, Kogle Alle 6, 2970 Hørsholm, Denmark.
authors.forename: Tilmann
authors.initials: T
authors.lastname: Weber
authors.affiliation: Mikrobiologie und Biotechnologie, Interfakultäres Institut für Mikrobiologie und Infektionsmedizin/Deutsches Zentrum für Infektionsforschung, Universität Tübingen, Auf der Morgenstelle 28, 72076 Tübingen, Germany.
authors.forename: Wolfgang
authors.initials: W
authors.lastname: Wohlleben
authors.affiliation: Technology Platform Genomics, Center for Biotechnology (CeBiTec), Bielefeld University, Sequenz 1, 33615 Bielefeld, Germany.
authors.forename: Jörn
authors.initials: J
authors.lastname: Kalinowski
authors.affiliation: Technology Platform Genomics, Center for Biotechnology (CeBiTec), Bielefeld University, Sequenz 1, 33615 Bielefeld, Germany. Electronic address: Christian.Rueckert@CeBiTec.Uni-Bielefeld.DE.
authors.forename: Christian
authors.initials: C
authors.lastname: Rückert
mesh_terms: D000192:Actinomycetales / Q000235:genetics*; D001482:Base Composition / Q000235:genetics; D016680:Genome, Bacterial / Q000235:genetics*; D008969:Molecular Sequence Data; D013386:Succinates / Q000378:metabolism*
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keywords: Amycolatopsis; Ethylenediaminedisuccinic acid; Genome sequence; Secondary metabolites