title: Molecular identification of pathogenic bacteria in eschars from acute febrile patients, Senegal.
abstract: Fever caused by Rickettsia felis was recently shown to play an important role in infectious diseases morbidity in sub-Saharan Africa. We collected 68 cotton swabs from fever-associated eschars in four different regions of Senegal. In 5 of 68 eschar samples (7.4%), we have identified DNA from R. felis. In 49 of 68 eschar samples (72.1%), we have identified DNA from Staphylococcus aureus. In 35 of 68 eschar samples (51.5%), we have identified DNA from Streptococcus pyogenes, and in 4 of 68 eschar samples (5.9%), we have identified DNA from Streptococcus pneumoniae. In 34 cases, S. aureus was found together with S. pyogenes. DNA from R. felis was also found in swabs from the skin of the healthy Senegalese villagers (3 of 60; 5%) but not French urbanites. The presence of S. aureus and S. pyogenes was significantly associated with the presence of eschars in febrile patients compared with the healthy skin from the control group. Finally, we confirmed that Senegal is an endemic region for R. felis, which is found in both eschars and healthy skin swabs.
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes Institut de Recherche pour le Développement 198, Centre National de Recherche Scientifique 7278, Université de la Méditerranée, Marseille, France; Campus Commun Université Cheikh Anta Diop-Institut de Recherche pour le Développement of Hann, Dakar, Senegal.
authors.forename: Oleg
authors.initials: O
authors.lastname: Mediannikov
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes Institut de Recherche pour le Développement 198, Centre National de Recherche Scientifique 7278, Université de la Méditerranée, Marseille, France; Campus Commun Université Cheikh Anta Diop-Institut de Recherche pour le Développement of Hann, Dakar, Senegal.
authors.forename: Cristina
authors.initials: C
authors.lastname: Socolovschi
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes Institut de Recherche pour le Développement 198, Centre National de Recherche Scientifique 7278, Université de la Méditerranée, Marseille, France; Campus Commun Université Cheikh Anta Diop-Institut de Recherche pour le Développement of Hann, Dakar, Senegal.
authors.forename: Matthieu
authors.initials: M
authors.lastname: Million
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes Institut de Recherche pour le Développement 198, Centre National de Recherche Scientifique 7278, Université de la Méditerranée, Marseille, France; Campus Commun Université Cheikh Anta Diop-Institut de Recherche pour le Développement of Hann, Dakar, Senegal.
authors.forename: Cheikh
authors.initials: C
authors.lastname: Sokhna
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes Institut de Recherche pour le Développement 198, Centre National de Recherche Scientifique 7278, Université de la Méditerranée, Marseille, France; Campus Commun Université Cheikh Anta Diop-Institut de Recherche pour le Développement of Hann, Dakar, Senegal.
authors.forename: Hubert
authors.initials: H
authors.lastname: Bassene
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes Institut de Recherche pour le Développement 198, Centre National de Recherche Scientifique 7278, Université de la Méditerranée, Marseille, France; Campus Commun Université Cheikh Anta Diop-Institut de Recherche pour le Développement of Hann, Dakar, Senegal.
authors.forename: Georges
authors.initials: G
authors.lastname: Diatta
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes Institut de Recherche pour le Développement 198, Centre National de Recherche Scientifique 7278, Université de la Méditerranée, Marseille, France; Campus Commun Université Cheikh Anta Diop-Institut de Recherche pour le Développement of Hann, Dakar, Senegal.
authors.forename: Florence
authors.initials: F
authors.lastname: Fenollar
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes Institut de Recherche pour le Développement 198, Centre National de Recherche Scientifique 7278, Université de la Méditerranée, Marseille, France; Campus Commun Université Cheikh Anta Diop-Institut de Recherche pour le Développement of Hann, Dakar, Senegal didier.raoult@gmail.com.
authors.forename: Didier
authors.initials: D
authors.lastname: Raoult
mesh_terms: D000208:Acute Disease; D002648:Child; D004269:DNA, Bacterial / Q000302:isolation & purification; D005334:Fever / Q000453:epidemiology* / Q000382:microbiology; D006801:Humans; D012282:Rickettsia Infections / Q000453:epidemiology*; D041161:Rickettsia felis / Q000302:isolation & purification*; D012675:Senegal / Q000453:epidemiology; D012867:Skin / Q000382:microbiology; D012871:Skin Diseases / Q000382:microbiology; D013211:Staphylococcus aureus / Q000302:isolation & purification*; D013291:Streptococcus / Q000302:isolation & purification*
chemical_list: D004269:DNA, Bacterial