title: Comparison of a semiautomated commercial repetitive-sequence-based PCR method with spoligotyping, 24-locus mycobacterial interspersed repetitive-unit-variable-number tandem-repeat typing, and restriction fragment length polymorphism-based analysis of IS6110 for Mycobacterium tuberculosis typing.
abstract: Fifty-two multidrug-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis representative of the currently predominant lineages in France were analyzed using repetitive-sequence-based PCR (rep-PCR) DiversiLab (DL), spoligotyping, 24-locus mycobacterial interspersed repetitive-unit-variable-number tandem-repeat typing (MIRU-VNTR), and restriction fragment length polymorphism of IS6110 (IS6110-RFLP). DL, as opposed to MIRU-VNTR and IS6110-RFLP analysis, did not allow discrimination among half of the isolates, an indication of comparatively lower resolving power.
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Paris, France Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CR7, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France INSERM U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France florence.brossier@psl.aphp.fr.
authors.forename: F
authors.initials: F
authors.lastname: Brossier
authors.affiliation: Institut de Génétique et Microbiologie, UMR8621 CNRS-Université Paris-Sud 11, UniverSud, Infection Genetics Emerging Pathogens Evolution (IGEPE) Team, Orsay-Cedex, France.
authors.forename: C
authors.initials: C
authors.lastname: Sola
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Paris, France.
authors.forename: G
authors.initials: G
authors.lastname: Millot
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Paris, France Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CR7, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France INSERM U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France.
authors.forename: V
authors.initials: V
authors.lastname: Jarlier
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Paris, France Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CR7, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France INSERM U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France.
authors.forename: N
authors.initials: N
authors.lastname: Veziris
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Paris, France Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CR7, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France INSERM U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, CIMI-Paris, Team 13 (Bacteriology), Paris, France.
authors.forename: W
authors.initials: W
authors.lastname: Sougakoff
mesh_terms: D057205:Automation, Laboratory / Q000379:methods*; D024901:Drug Resistance, Multiple, Bacterial; D005602:France; D006801:Humans; D058889:Molecular Typing / Q000379:methods*; D009169:Mycobacterium tuberculosis / Q000145:classification* / Q000235:genetics*; D018088:Tuberculosis, Multidrug-Resistant / Q000382:microbiology