title: Transcriptomic correlates of organ failure extent in sepsis.
abstract: OBJECTIVE
  Sepsis is characterised by the frequent presence of organ failure and marked immunologic alterations. We studied the association between the extent of organ failure and the transcriptomic response of septic patients.
  
  
  METHODS
  Gene expression profiles in the blood of 74 surgical patients with sepsis were compared with those of 30 surgical patients with no sepsis. Differentially expressed genes were assessed for their correlation with the sequential organ failure (SOFA) score.
  
  
  RESULTS
  The expression levels of a group of genes participating in the cell cycle (HIST1H1C, CKS2, CCNA2, CDK1, CCNB2, CIT, CCNB1, AURKA, RAD51), neutrophil protease activity (ELANE, ADORA3, MPO, MMP8, CTSG), IL-1R and IL-18R response correlated directly with SOFA and mortality. Genes involved in T cell (LCK, CD3G, CD3D, ZAP70, ICOS, CD3E, CD28, IL2RB, CD8B, CD8A, CD40LG, IL23A, CCL5, SH2D1A, ITK, CD247, TBX21, GATA3, CCR7, LEF1, STAT4) and NK cell immunity (CD244, KLRK1, KLRD1) were inversely associated with SOFA and mortality.
  
  
  CONCLUSIONS
  The extent of organ failure in sepsis correlates directly with the existence of imbalanced innate and adaptive responses at the transcriptomic level. Quantification of the expression levels of the genes identified here could contribute to the simultaneous assessment of disease severity and immunological alterations in sepsis.
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Unidad Apoyo a la Investigación, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: ralmansa@saludcastillayleon.es.
authors.forename: Raquel
authors.initials: R
authors.lastname: Almansa
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Servicio de Anestesiología, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: maria_her_05@hotmail.com.
authors.forename: María
authors.initials: M
authors.lastname: Heredia-Rodríguez
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Servicio de Anestesiología, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: esthergzam@hotmail.com.
authors.forename: Esther
authors.initials: E
authors.lastname: Gomez-Sanchez
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Servicio de Medicina Intensiva, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: davidandaluz78@yahoo.es.
authors.forename: David
authors.initials: D
authors.lastname: Andaluz-Ojeda
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Unidad Apoyo a la Investigación, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: viglesiasl@saludcastillayleon.es.
authors.forename: Verónica
authors.initials: V
authors.lastname: Iglesias
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Unidad Apoyo a la Investigación, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: lrico@saludcastillayleon.es.
authors.forename: Lucia
authors.initials: L
authors.lastname: Rico
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Unidad Apoyo a la Investigación, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: aortegaa@saludcastillayleon.es.
authors.forename: Alicia
authors.initials: A
authors.lastname: Ortega
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Servicio de Anestesiología, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: egp29@hotmail.com.
authors.forename: Estefanía
authors.initials: E
authors.lastname: Gomez-Pesquera
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Servicio de Anestesiología, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: liupili@hotmail.com.
authors.forename: Pilar
authors.initials: P
authors.lastname: Liu
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Servicio de Anestesiología, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: mrt.aragon@gmail.com.
authors.forename: Marta
authors.initials: M
authors.lastname: Aragón
authors.affiliation: Dpto de Microbiología, Universidad de Valladolid, Avenida Ramón y Cajal, 7, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: jmeirosbouza@gmail.com.
authors.forename: Jose Maria
authors.initials: JM
authors.lastname: Eiros
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología - Instituto de Salud Carlos III, Carretera Majadahonda- Pozuelo km. 2, Majadahonda, 28220 Madrid, Spain. Electronic address: jimenezsousa@yahoo.es.
authors.forename: Maria Ángeles
authors.initials: MÁ
authors.lastname: Jiménez-Sousa
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología - Instituto de Salud Carlos III, Carretera Majadahonda- Pozuelo km. 2, Majadahonda, 28220 Madrid, Spain. Electronic address: salvador.resino@gmail.com.
authors.forename: Salvador
authors.initials: S
authors.lastname: Resino
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Servicio de Anestesiología, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: jgomez012001@yahoo.es.
authors.forename: Ignacio
authors.initials: I
authors.lastname: Gómez-Herreras
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Unidad Apoyo a la Investigación, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: jfbermejo@saludcastillayleon.es.
authors.forename: Jesús F
authors.initials: JF
authors.lastname: Bermejo-Martín
authors.affiliation: Grupo de Investigación Biomédica en Cuidados Críticos (BioCritic), Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL/IECSYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain; Servicio de Anestesiología, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, SACYL, Avenida Ramón y Cajal, 3, 47005 Valladolid, Spain. Electronic address: tamayo@med.uva.es.
authors.forename: Eduardo
authors.initials: E
authors.lastname: Tamayo
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keywords: Immune response; Immunosupression; Microarrays; Organ failure extent; SOFA; Sepsis; Transcriptomics