title: Molecular Detection of Fastidious and Common Bacteria as Well as Plasmodium spp. in Febrile and Afebrile Children in Franceville, Gabon.
abstract: Malaria was considered as the main cause of fever in Africa. However, with the roll back malaria initiative, the causes of fever in Africa may change. This study aimed to evaluate the prevalence of bacteria and Plasmodium spp. in febrile and afebrile (controls) children from Franceville, Gabon. About 793 blood samples from febrile children and 100 from controls were analyzed using polymerase chain reaction (PCR) coupled with sequencing. Plasmodium spp. was the microorganism most detected in febrile (74.5%, 591/793) and controls (13%, 13/100), P < 0.0001. Its coinfection with bacteria was found only in febrile children (P = 0.0001). Staphylococcus aureus was the most prevalent bacterium in febrile children (2.8%, 22/793) and controls (3%, 3/100). Eight cases of Salmonella spp. (including two Salmonella enterica serovar Paratyphi) and two of Streptococcus pneumoniae were found only among febrile children. Borrelia spp. was found in 2 controls while Rickettsia felis was detected in 10 children (in 8 febriles and 2 afebriles). No DNA of other targeted microorganisms was detected. Plasmodium spp. remains prevalent while Salmonella spp., Staphylococcus aureus, and Streptococcus pneumoniae were common bacteria in Gabon. Two fastidious bacteria, Rickettsia felis and Borrelia spp., were found. Inclusion of controls should improve the understanding of the causes of fever in sub-Saharan Africa.
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Gaël
authors: G
authors: Mourembou
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Florence
authors: F
authors: Fenollar
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Cristina
authors: C
authors: Socolovschi
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Guy Joseph
authors: GJ
authors: Lemamy
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Hermann
authors: H
authors: Nzoughe
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Lady Charlene
authors: LC
authors: Kouna
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Fousseyni
authors: F
authors: Toure-Ndouo
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Matthieu
authors: M
authors: Million
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Angelique Ndjoyi
authors: AN
authors: Mbiguino
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon.
authors: Jean Bernard
authors: JB
authors: Lekana-Douki
authors: URMITE, Aix Marseille Université, Marseille, France; Unité de Parasitologie Médicale (UPARAM) CIRMF, Franceville, Gabon; Ecole Doctorale Régionale d'Afrique Centrale, Franceville, Gabon; Département de Biologie Cellulaire et Génétique, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Parasitologie Mycologie et de Médecine Tropicale, Université des Science de la Santé, Libreville, Gabon; Département de Microbiologie, Laboratoire National de Référence IST/sida, Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, Libreville, Gabon didier.raoult@gmail.com.
authors: Didier
authors: D
authors: Raoult
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