Evaluation of the capability of the PCV2 genome to encode miRNAs: lack of viral miRNA expression in an experimental infection.
Porcine circovirus type 2 (PCV2) is a ssDNA virus causing PCV2-systemic disease (PCV2-SD), one of the most important diseases in swine. MicroRNAs (miRNAs) are a new class of small non-coding RNAs that regulate gene expression post-transcriptionally. Viral miRNAs have recently been described and the number of viral miRNAs has been increasing in the past few years. In this study, small RNA libraries were constructed from two tissues of subclinically PCV2 infected pigs to explore if PCV2 can encode viral miRNAs. The deep sequencing data revealed that PCV2 does not express miRNAs in an in vivo subclinical infection.
Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), UAB-IRTA, Campus de la Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Cerdanyola del Vallès, Spain. fernando.nunez@cresa.uab.cat.
Fernando
F
Núñez-Hernández
Centro Nacional de Sanidad Agropecuaria (CENSA), La Habana, Cuba. lesterjosue@gmail.com.
Lester J
LJ
Pérez
Departament de Genètica Animal, Centre de Recerca en AgriGenòmica (CRAG), CSIC-IRTA-UAB-UB, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Bellaterra, Spain. gonzalo.vera@cragenomica.es.
Gonzalo
G
Vera
Departament de Genètica Animal, Centre de Recerca en AgriGenòmica (CRAG), CSIC-IRTA-UAB-UB, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Bellaterra, Spain. Sarai.Cordoba@cragenomica.es.
Sarai
S
Córdoba
Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), UAB-IRTA, Campus de la Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Cerdanyola del Vallès, Spain. Joaquim.Segales@cresa.uab.cat.|Departament de Sanitat i Anatomia Animals, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Bellaterra, Spain. Joaquim.Segales@cresa.uab.cat.
Joaquim
J
Segalés
Departament de Genètica Animal, Centre de Recerca en AgriGenòmica (CRAG), CSIC-IRTA-UAB-UB, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Bellaterra, Spain. armand.sanchez@cragenomica.es.|Departament de Ciència Animal i dels Aliments, Universitat Autònoma de Barcelona (UAB), Barcelona, Bellaterra, Spain. armand.sanchez@cragenomica.es.
Armand
A
Sánchez
Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), UAB-IRTA, Campus de la Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Cerdanyola del Vallès, Spain. ignacio.nunez@cresa.uab.es.
José I
JI
Núñez
D000818:Animals; D058345:Asymptomatic Infections; D018173:Circoviridae Infections / Q000662:veterinary* / Q000821:virology; D017925:Circovirus / Q000235:genetics* / Q000378:metabolism; D016679:Genome, Viral; D035683:MicroRNAs / Q000235:genetics*; D016133:Polymerase Chain Reaction / Q000662:veterinary; D012367:RNA, Viral / Q000235:genetics*; D013552:Swine; D013553:Swine Diseases / Q000821:virology*
D035683:MicroRNAs; D012367:RNA, Viral