title: In silico analyses of dystrophin Dp40 cellular distribution, nuclear export signals and structure modeling.
abstract: Dystrophin Dp40 is the shortest protein encoded by the DMD (Duchenne muscular dystrophy) gene. This protein is unique since it lacks the C-terminal end of dystrophins. In this data article, we describe the subcellular localization, nuclear export signals and the three-dimensional structure modeling of putative Dp40 proteins using bioinformatics tools. The Dp40 wild type protein was predicted as a cytoplasmic protein while the Dp40n4 was predicted to be nuclear. Changes L93P and L170P are involved in the nuclear localization of Dp40n4 protein. A close analysis of Dp40 protein scored that amino acids (93)LEQEHNNLV(101) and (168)LLLHDSIQI(176) could function as NES sequences and the scores are lost in Dp40n4. In addition, the changes L93/170P modify the tertiary structure of putative Dp40 mutants. The analysis showed that changes of residues 93 and 170 from leucine to proline allow the nuclear localization of Dp40 proteins. The data described here are related to the research article entitled "EF-hand domains are involved in the differential cellular distribution of dystrophin Dp40" (J. Aragón et al. Neurosci. Lett. 600 (2015) 115-120) [1].
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Alejandro
authors.initials: A
authors.lastname: Martínez-Herrera
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Jorge
authors.initials: J
authors.lastname: Aragón
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Rosa Ma
authors.initials: RM
authors.lastname: Bermúdez-Cruz
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Ma Luisa
authors.initials: ML
authors.lastname: Bazán
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Gabriela
authors.initials: G
authors.lastname: Soid-Raggi
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Víctor
authors.initials: V
authors.lastname: Ceja
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Andrea
authors.initials: A
authors.lastname: Santos Coy-Arechavaleta
authors.affiliation: Departamento de Fisiología, Biofísica y Neurociencias, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Víctor
authors.initials: V
authors.lastname: Alemán
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Francisco
authors.initials: F
authors.lastname: Depardón
authors.affiliation: Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México, D. F., Mexico.
authors.forename: Cecilia
authors.initials: C
authors.lastname: Montañez
keywords: Cellular distribution; Dystrophin Dp40; In silico