title: Data set of the protein expression profiles of Luminal A, Claudin-low and overexpressing HER2(+) breast cancer cell lines by iTRAQ labelling and tandem mass spectrometry.
abstract: Breast cancer is the most common and the leading cause of mortality in women worldwide. There is a dire necessity of the identification of novel molecules useful in diagnosis and prognosis. In this work we determined the differentially expression profiles of four breast cancer cell lines compared to a control cell line. We identified 1020 polypeptides labelled with iTRAQ with more than 95% in confidence. We analysed the common proteins in all breast cancer cell lines through IPA software (IPA core and Biomarkers). In addition, we selected the specific overexpressed and subexpressed proteins of the different molecular classes of breast cancer cell lines, and classified them according to protein class and biological process. Data in this article is related to the research article "Determination of the protein expression profiles of breast cancer cell lines by Quantitative Proteomics using iTRAQ Labelling and Tandem Mass Spectrometry" (Calderón-González et al. [1] in press).
authors.affiliation: Doctorado en Ciencias Biológicas y de la Salud, Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Iztapalapa, Av. San Rafael Atlixco No. 186, Col. Vicentina, Iztapalapa, C.P. 09340 México DF, Mexico.
authors.forename: Karla Grisel
authors.initials: KG
authors.lastname: Calderón-González
authors.affiliation: Unidad de Proteómica, Centro de Investigación Príncipe Felipe, C/Rambla del Saler 16, 46012 Valencia, Spain.
authors.forename: Ma Luz
authors.initials: ML
authors.lastname: Valero Rustarazo
authors.affiliation: Departamento de Biología Celular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav-IPN), Av. Instituto Politécnico Nacional 2508, Col. San Pedro Zacatenco, Gustavo A. Madero, C.P. 07360 México DF, Mexico.
authors.forename: Maria Luisa
authors.initials: ML
authors.lastname: Labra-Barrios
authors.affiliation: Departamento de Biología Celular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav-IPN), Av. Instituto Politécnico Nacional 2508, Col. San Pedro Zacatenco, Gustavo A. Madero, C.P. 07360 México DF, Mexico.
authors.forename: César Isaac
authors.initials: CI
authors.lastname: Bazán-Méndez
authors.affiliation: Departamento de Biología Celular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav-IPN), Av. Instituto Politécnico Nacional 2508, Col. San Pedro Zacatenco, Gustavo A. Madero, C.P. 07360 México DF, Mexico.
authors.forename: Alejandra
authors.initials: A
authors.lastname: Tavera-Tapia
authors.affiliation: Departamento de Biología Celular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav-IPN), Av. Instituto Politécnico Nacional 2508, Col. San Pedro Zacatenco, Gustavo A. Madero, C.P. 07360 México DF, Mexico.
authors.forename: Marí aEsther
authors.initials: Ma
authors.lastname: Herrera-Aguirre
authors.affiliation: Unidad de Proteómica, Centro de Investigación Príncipe Felipe, C/Rambla del Saler 16, 46012 Valencia, Spain.
authors.forename: Manuel M
authors.initials: MM
authors.lastname: Sánchez Del Pino
authors.affiliation: AB SCIEX, 500 Old Connecticut Path, Framingham, MA 01701, USA.
authors.forename: José Luis
authors.initials: JL
authors.lastname: Gallegos-Pérez
authors.affiliation: Instituto de Enfermedades de la Mama, Fundación del Cáncer de Mama (FUCAM A.C.), Av. Bordo No. 100, Col. Viejo Ejido de Santa Ursula Coapa, Coyoacán, C.P. 04980 México DF, Mexico.
authors.forename: Humberto
authors.initials: H
authors.lastname: González-Márquez
authors.affiliation: Departamento de Biología Celular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav-IPN), Av. Instituto Politécnico Nacional 2508, Col. San Pedro Zacatenco, Gustavo A. Madero, C.P. 07360 México DF, Mexico.
authors.forename: Jose Manuel
authors.initials: JM
authors.lastname: Hernández-Hernández
authors.affiliation: Departamento de Ciencias de la Salud, Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Iztapalapa, Av. San Rafael Atlixco No. 186, Col. Vicentina, Iztapalapa, C.P. 09340 México DF, Mexico.
authors.forename: Gloria
authors.initials: G
authors.lastname: León-Ávila
authors.affiliation: Instituto de Enfermedades de la Mama, Fundación del Cáncer de Mama (FUCAM A.C.), Av. Bordo No. 100, Col. Viejo Ejido de Santa Ursula Coapa, Coyoacán, C.P. 04980 México DF, Mexico.
authors.forename: Sergio
authors.initials: S
authors.lastname: Rodríguez-Cuevas
authors.affiliation: Departamento de Zoología, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, Prolongación de Carpio y Plan de Ayala s/n, Col. Santo Tomás, Miguel Hidalgo, C.P. 11340 México DF, Mexico ; Instituto de Enfermedades de la Mama, Fundación del Cáncer de Mama (FUCAM A.C.), Av. Bordo No. 100, Col. Viejo Ejido de Santa Ursula Coapa, Coyoacán, C.P. 04980 México DF, Mexico.
authors.forename: Fernando
authors.initials: F
authors.lastname: Guisa-Hohenstein
authors.affiliation: Departamento de Biología Celular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav-IPN), Av. Instituto Politécnico Nacional 2508, Col. San Pedro Zacatenco, Gustavo A. Madero, C.P. 07360 México DF, Mexico.
authors.forename: Juan Pedro
authors.initials: JP
authors.lastname: Luna-Arias