Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis.
Multiple-locus variable number-tandem repeat analysis (MLVA) of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) isolates may contribute to the knowledge of strain diversity in Argentina. Although the diversity of MAP has been previously investigated in Argentina using IS900-RFLP, a small number of isolates were employed, and a low discriminative power was reached. The aim of the present study was to test the genetic diversity among MAP isolates using an MLVA approach based on 8 repetitive loci. We studied 97 isolates from cattle, goat and sheep and could describe 7 different patterns: INMV1, INMV2, INMV11, INMV13, INMV16, INMV33 and one incomplete pattern. INMV1 and INMV2 were the most frequent patterns, grouping 76.3% of the isolates. We were also able to demonstrate the coexistence of genotypes in herds and co-infection at the organism level. This study shows that all the patterns described are common to those described in Europe, suggesting an epidemiological link between the continents.
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Instituto de Biotecnología, Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Buenos Aires, Argentina, Instituto de Biotecnología, Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Buenos Aires, Argentina.
Andrea
A
Gioffré
Universidad Autónoma de Baja California, Universidad Autónoma de Baja California, Mexicali, México, Universidad Autónoma de Baja California, Mexicali, México.
Magnolia
M
Correa Muñoz
Universidad Nacional de La Plata, Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias, Faculdad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de La Plata, Chascomús, Argentina, Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias, Faculdad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de La Plata, Chascomús, Argentina.
María F
MF
Alvarado Pinedo
Universidad Nacional de La Plata, Cátedra de Zootecnia Especial II, Faculdad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de La Plata, Buenos Aires, Argentina, Cátedra de Zootecnia Especial II, Faculdad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Roberto
R
Vaca
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Laboratorio de Bacteriología, Estación Experimental Agropecuaria, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Balcarce, Argentina, Laboratorio de Bacteriología, Estación Experimental Agropecuaria, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Balcarce, Argentina.
Claudia
C
Morsella
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Laboratorio de Bacteriología, Estación Experimental Agropecuaria, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Balcarce, Argentina, Laboratorio de Bacteriología, Estación Experimental Agropecuaria, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Balcarce, Argentina.
María Andrea
MA
Fiorentino
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Laboratorio de Bacteriología, Estación Experimental Agropecuaria, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Balcarce, Argentina, Laboratorio de Bacteriología, Estación Experimental Agropecuaria, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Balcarce, Argentina.
Fernando
F
Paolicchi
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Instituto de Biotecnología, Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Buenos Aires, Argentina, Instituto de Biotecnología, Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Buenos Aires, Argentina.
Paula
P
Ruybal
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Instituto de Biotecnología, Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Buenos Aires, Argentina, Instituto de Biotecnología, Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Buenos Aires, Argentina.
Martín
M
Zumárraga
Universidad Nacional de La Plata, Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias, Faculdad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de La Plata, Chascomús, Argentina, Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias, Faculdad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de La Plata, Chascomús, Argentina.
Gabriel E
GE
Travería
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Instituto de Biotecnología, Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Buenos Aires, Argentina, Instituto de Biotecnología, Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Buenos Aires, Argentina.
María Isabel
MI
Romano
D000818:Animals; D001118:Argentina / Q000453:epidemiology; D002417:Cattle; D002418:Cattle Diseases / Q000382:microbiology; D014644:Genetic Variation; D005838:Genotype; D015511:Goat Diseases / Q000382:microbiology; D006041:Goats; D018598:Minisatellite Repeats; D017720:Molecular Epidemiology; D058889:Molecular Typing / Q000379:methods*; D016927:Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis / Q000145:classification* / Q000235:genetics* / Q000302:isolation & purification; D010283:Paratuberculosis / Q000382:microbiology*; D012756:Sheep; D012757:Sheep Diseases / Q000382:microbiology
MIRU-VNTR; MLVA; molecular typing; paratuberculosis