Molecular characterization of Brazilian equid herpesvirus type 1 strains based on neuropathogenicity markers.
Partial nucleotide sequences of ORF72 (glycoprotein D, gD), ORF64 (infected cell protein 4, ICP4) and ORF30 (DNA polymerase) genes were compared with corresponding sequences of EHV-1 reference strains to characterize the molecular variability of Brazilian strains. Virus isolation assays were applied to 74 samples including visceral tissue, total blood, cerebrospinal fluid (CSF) and nasal swabs of specimens from a total of 64 animals. Only one CSF sample (Iso07/05 strain) was positive by virus isolation in cell culture. EHV-1 Iso07/05 neurologic strain and two abortion visceral tissues samples (Iso11/06 and Iso33/06) were PCR-positive for ORF33 (glycoprotein B, gB) gene of EHV-1. A sequence analysis of the ORF72, ORF64 and ORF30 genes from three EHV-1 archival strains (A3/97, A4/72, A9/92) and three clinical samples (Iso07/05, Iso11/06 and Iso33/06) suggested that among Brazilian EHV-1 strains, the amplified region of the gD gene sequence is highly conserved. Additionally, the analysis of ICP4 gene showed high nucleotide and amino acid identities when compared with genotype P strains, suggesting that the EHV-1 Brazilian strains belonged to the same group. All the EHV-1 Brazilian strains were classified as non-neuropathogenic variants (N752) based on the ORF30 analysis. These findings indicate a high conservation of the gD-, ICP4- and ORF30-encoding sequences. Different pathotypes of the EHV-1 strain might share identical genes with no specific markers, and tissue tropism is not completely dependent on the gD envelope, immediate-early ICP4 and DNA polymerase proteins.
Instituto Pasteur, São Paulo, SP, Brasil, Instituto Pasteur, São Paulo, SP, Brazil. ; Universidade de São Paulo, Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina Veterinária e Ciência Animal, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil, Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina Veterinária e Ciência Animal, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
Enio
E
Mori
Instituto Biológico, Instituto Biológico, São Paulo, SP, Brasil, Instituto Biológico, São Paulo, SP, Brazil.
Maria do Carmo C S H
Mdo C
Lara
Instituto Biológico, Instituto Biológico, São Paulo, SP, Brasil, Instituto Biológico, São Paulo, SP, Brazil.
Elenice M S
EM
Cunha
Instituto Biológico, Instituto Biológico, São Paulo, SP, Brasil, Instituto Biológico, São Paulo, SP, Brazil.
Eliana M C
EM
Villalobos
Universidade de São Paulo, Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina Veterinária e Ciência Animal, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil, Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina Veterinária e Ciência Animal, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
Claudia M C
CM
Mori
Universidade de São Paulo, Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil, Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
Rodrigo M
RM
Soares
Universidade de São Paulo, Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil, Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
Paulo E
PE
Brandão
Universidade de São Paulo, Departamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina Veterinária e Ciência Animal, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil, Departamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina Veterinária e Ciência Animal, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
Wilson R
WR
Fernandes
Universidade de São Paulo, Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil, Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
Leonardo J
LJ
Richtzenhain
D000818:Animals; D001938:Brazil; D016000:Cluster Analysis; D017124:Conserved Sequence; D004279:DNA, Viral / Q000737:chemistry / Q000235:genetics; D014644:Genetic Variation; D005838:Genotype; D006566:Herpesviridae Infections / Q000662:veterinary* / Q000821:virology; D004861:Herpesvirus 1, Equid / Q000145:classification* / Q000235:genetics*; D006734:Horse Diseases / Q000821:virology*; D006736:Horses; D008969:Molecular Sequence Data; D016366:Open Reading Frames; D010802:Phylogeny; D017422:Sequence Analysis, DNA; D017386:Sequence Homology, Amino Acid; D012689:Sequence Homology, Nucleic Acid
D004279:DNA, Viral
DNA polymerase gene (ORF30); ICP4 gene (ORF64); equid Brazilian herpesvirus; equid herpesvirus type 1; glycoprotein D gene (ORF72)