title: Recurrent AAV2-related insertional mutagenesis in human hepatocellular carcinomas.
abstract: Hepatocellular carcinomas (HCCs) are liver tumors related to various etiologies, including alcohol intake and infection with hepatitis B (HBV) or C (HCV) virus. Additional risk factors remain to be identified, particularly in patients who develop HCC without cirrhosis. We found clonal integration of adeno-associated virus type 2 (AAV2) in 11 of 193 HCCs. These AAV2 integrations occurred in known cancer driver genes, namely CCNA2 (cyclin A2; four cases), TERT (telomerase reverse transcriptase; one case), CCNE1 (cyclin E1; three cases), TNFSF10 (tumor necrosis factor superfamily member 10; two cases) and KMT2B (lysine-specific methyltransferase 2B; one case), leading to overexpression of the target genes. Tumors with viral integration mainly developed in non-cirrhotic liver (9 of 11 cases) and without known risk factors (6 of 11 cases), suggesting a pathogenic role for AAV2 in these patients. In conclusion, AAV2 is a DNA virus associated with oncogenic insertional mutagenesis in human HCC.
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.|Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP), Hôpitaux Universitaires Paris-Seine Saint-Denis, Site Jean Verdier, Pôle d'Activité Cancérologique Spécialisée, Service d'Hépatologie, Bondy, France.
authors: Jean-Charles
authors: JC
authors: Nault
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.
authors: Shalini
authors: S
authors: Datta
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.
authors: Sandrine
authors: S
authors: Imbeaud
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.
authors: Andrea
authors: A
authors: Franconi
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.
authors: Maxime
authors: M
authors: Mallet
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.
authors: Gabrielle
authors: G
authors: Couchy
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.
authors: Eric
authors: E
authors: Letouzé
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.
authors: Camilla
authors: C
authors: Pilati
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.
authors: Benjamin
authors: B
authors: Verret
authors: Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Bordeaux, Department of Hepatology, Hôpital Saint-André, Bordeaux, France.|INSERM, UMR 1053, Bordeaux, France.|Université de Bordeaux, Bordeaux, France.
authors: Jean-Frédéric
authors: JF
authors: Blanc
authors: INSERM, UMR 1053, Bordeaux, France.|Université de Bordeaux, Bordeaux, France.
authors: Charles
authors: C
authors: Balabaud
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.|AP-HP, Department of Pathology, CHU Henri Mondor, Créteil, France.
authors: Julien
authors: J
authors: Calderaro
authors: AP-HP, Department of Digestive and Hepatobiliary Surgery, CHU Henri Mondor, Créteil, France.|INSERM, U955, Créteil, France.
authors: Alexis
authors: A
authors: Laurent
authors: IntegraGen, Evry, France.
authors: Mélanie
authors: M
authors: Letexier
authors: INSERM, UMR 1053, Bordeaux, France.|Université de Bordeaux, Bordeaux, France.|CHU de Bordeaux, Pellegrin Hospital, Department of Pathology, Bordeaux, France.
authors: Paulette
authors: P
authors: Bioulac-Sage
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.|Institut Gustave Roussy, Core Europe, Villejuif, France.
authors: Fabien
authors: F
authors: Calvo
authors: INSERM, Unité Mixte de Recherche (UMR) 1162, Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, Paris, France.|Université Paris Descartes, Labex Immuno-Oncology, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.|Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Unité de Formation et de Recherche (UFR) Santé, Médecine, Biologie Humaine (SMBH), Bobigny, France.|Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie, Paris, France.|AP-HP, Hôpital Européen Georges Pompidou, Paris, France.
authors: Jessica
authors: http://orcid.org/0000-0002-5687-0334
authors: J
authors: Zucman-Rossi
mesh_terms: D006528:Carcinoma, Hepatocellular / Q000235:genetics*; D056751:Cyclin A2 / Q000235:genetics; D019927:Cyclin E / Q000235:genetics; D000229:Dependovirus / Q000235:genetics*; D006801:Humans; D008113:Liver Neoplasms / Q000235:genetics*; D008969:Molecular Sequence Data; D016254:Mutagenesis, Insertional; D015513:Oncogene Proteins / Q000235:genetics; D053221:TNF-Related Apoptosis-Inducing Ligand / Q000235:genetics; D019098:Telomerase / Q000235:genetics; D016662:Virus Integration
chemical_list: C475820:CCNE1 protein, human; D056751:Cyclin A2; D019927:Cyclin E; D015513:Oncogene Proteins; D053221:TNF-Related Apoptosis-Inducing Ligand; C505653:TNFSF10 protein, human; D019098:Telomerase