title: Chromatin, DNA structure and alternative splicing.
abstract: Coupling of transcription and alternative splicing via regulation of the transcriptional elongation rate is a well-studied phenomenon. Template features that act as roadblocks for the progression of RNA polymerase II comprise histone modifications and variants, DNA-interacting proteins and chromatin compaction. These may affect alternative splicing decisions by inducing pauses or decreasing elongation rate that change the time-window for splicing regulatory sequences to be recognized. Herein we discuss the evidence supporting the influence of template structural modifications on transcription and splicing, and provide insights about possible roles of non-B DNA conformations on the regulation of alternative splicing.
authors: Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE-UBA-CONICET) and Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Pabellón 2, C1428EHA Buenos Aires, Argentina.
authors: Nicolás
authors: N
authors: Nieto Moreno
authors: Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE-UBA-CONICET) and Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Pabellón 2, C1428EHA Buenos Aires, Argentina.
authors: Luciana E
authors: LE
authors: Giono
authors: Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE-UBA-CONICET) and Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Pabellón 2, C1428EHA Buenos Aires, Argentina.
authors: Adrián E
authors: AE
authors: Cambindo Botto
authors: Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE-UBA-CONICET) and Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Pabellón 2, C1428EHA Buenos Aires, Argentina.
authors: Manuel J
authors: MJ
authors: Muñoz
authors: Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE-UBA-CONICET) and Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Pabellón 2, C1428EHA Buenos Aires, Argentina. Electronic address: ark@fbmc.fcen.uba.ar.
authors: Alberto R
authors: AR
authors: Kornblihtt
mesh_terms: D017398:Alternative Splicing; D000818:Animals; D002843:Chromatin / Q000737:chemistry* / Q000235:genetics*; D004247:DNA / Q000737:chemistry* / Q000235:genetics*; D006801:Humans; D014158:Transcription, Genetic / Q000235:genetics
chemical_list: D002843:Chromatin; D004247:DNA
keywords: Alternative splicing; Chromatin structure; Non-B DNA; RNA polymerase II elongation