title: A de novo microdeletion of SEMA5A in a boy with autism spectrum disorder and intellectual disability.
abstract: Semaphorins are a large family of secreted and membrane-associated proteins necessary for wiring of the brain. Semaphorin 5A (SEMA5A) acts as a bifunctional guidance cue, exerting both attractive and inhibitory effects on developing axons. Previous studies have suggested that SEMA5A could be a susceptibility gene for autism spectrum disorders (ASDs). We first identified a de novo translocation t(5;22)(p15.3;q11.21) in a patient with ASD and intellectual disability (ID). At the translocation breakpoint on chromosome 5, we observed a 861-kb deletion encompassing the end of the SEMA5A gene. We delineated the breakpoint by NGS and observed that no gene was disrupted on chromosome 22. We then used Sanger sequencing to search for deleterious variants affecting SEMA5A in 142 patients with ASD. We also identified two independent heterozygous variants located in a conserved functional domain of the protein. Both variants were maternally inherited and predicted as deleterious. Our genetic screens identified the first case of a de novo SEMA5A microdeletion in a patient with ASD and ID. Although our study alone cannot formally associate SEMA5A with susceptibility to ASD, it provides additional evidence that Semaphorin dysfunction could lead to ASD and ID. Further studies on Semaphorins are warranted to better understand the role of this family of genes in susceptibility to neurodevelopmental disorders.
authors.affiliation: Laboratoire de Cytogénétique, Plateau technique de Biologie, CHU Dijon, Dijon, France.|Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Anne-Laure
authors.initials: AL
authors.lastname: Mosca-Boidron
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Lucie
authors.initials: L
authors.lastname: Gueneau
authors.affiliation: Institut Pasteur, Human Genetics and Cognitive Functions Unit, Paris, France.|CNRS UMR 3571: Genes, Synapses and Cognition, Institut Pasteur, Paris, France.|Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris, France.
authors.forename: Guillaume
authors.initials: G
authors.lastname: Huguet
authors.affiliation: Centre de Génétique du CHU de Rouen, Rouen, France.
authors.forename: Alice
authors.initials: A
authors.lastname: Goldenberg
authors.affiliation: Centre Resource Autisme Bourgogne, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Céline
authors.initials: C
authors.lastname: Henry
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Nadège
authors.initials: N
authors.lastname: Gigot
authors.affiliation: Institut de Neurobiologie de la Méditerranée INSERM UMR901, Marseille, France.
authors.forename: Emilie
authors.initials: E
authors.lastname: Pallesi-Pocachard
authors.affiliation: Institut de Neurobiologie de la Méditerranée INSERM UMR901, Marseille, France.
authors.forename: Antonio
authors.initials: A
authors.lastname: Falace
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Laurence
authors.initials: L
authors.lastname: Duplomb
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.|Centre de Génétique et Centre de Référence «Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs», Hôpital d'Enfants, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Julien
authors.identifier: 0000-0001-9271-3961
authors.initials: J
authors.lastname: Thevenon
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Yannis
authors.initials: Y
authors.lastname: Duffourd
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.|Laboratoire de Génétique Moléculaire, Plateau Technique de Biologie, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Judith
authors.initials: J
authors.lastname: St-Onge
authors.affiliation: Centre de Génétique du CHU de Rouen, Rouen, France.
authors.forename: Pascal
authors.initials: P
authors.lastname: Chambon
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.|Laboratoire de Génétique Moléculaire, Plateau Technique de Biologie, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Jean-Baptiste
authors.initials: JB
authors.lastname: Rivière
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.|Centre de Génétique et Centre de Référence «Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs», Hôpital d'Enfants, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Christel
authors.initials: C
authors.lastname: Thauvin-Robinet
authors.affiliation: Laboratoire de Cytogénétique, Plateau technique de Biologie, CHU Dijon, Dijon, France.|Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Patrick
authors.initials: P
authors.lastname: Callier
authors.affiliation: Laboratoire de Cytogénétique, Plateau technique de Biologie, CHU Dijon, Dijon, France.|Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Nathalie
authors.initials: N
authors.lastname: Marle
authors.affiliation: Laboratoire de Cytogénétique, Plateau technique de Biologie, CHU Dijon, Dijon, France.|Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Muriel
authors.initials: M
authors.lastname: Payet
authors.affiliation: Laboratoire de Cytogénétique, Plateau technique de Biologie, CHU Dijon, Dijon, France.|Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.
authors.forename: Clemence
authors.initials: C
authors.lastname: Ragon
authors.affiliation: Institut Pasteur, Human Genetics and Cognitive Functions Unit, Paris, France.|CNRS UMR 3571: Genes, Synapses and Cognition, Institut Pasteur, Paris, France.|Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris, France.
authors.forename: Hany
authors.initials: H
authors.lastname: Goubran Botros
authors.affiliation: Institut Pasteur, Human Genetics and Cognitive Functions Unit, Paris, France.|CNRS UMR 3571: Genes, Synapses and Cognition, Institut Pasteur, Paris, France.|Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris, France.|Fondation FondaMental, Créteil, France.
authors.forename: Julien
authors.initials: J
authors.lastname: Buratti
authors.affiliation: Institut Pasteur, Human Genetics and Cognitive Functions Unit, Paris, France.|CNRS UMR 3571: Genes, Synapses and Cognition, Institut Pasteur, Paris, France.|Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris, France.|Fondation FondaMental, Créteil, France.
authors.forename: Sophie
authors.initials: S
authors.lastname: Calderari
authors.affiliation: Institut Pasteur, Human Genetics and Cognitive Functions Unit, Paris, France.|CNRS UMR 3571: Genes, Synapses and Cognition, Institut Pasteur, Paris, France.|Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris, France.
authors.forename: Guillaume
authors.initials: G
authors.lastname: Dumas
authors.affiliation: Institut Pasteur, Human Genetics and Cognitive Functions Unit, Paris, France.|CNRS UMR 3571: Genes, Synapses and Cognition, Institut Pasteur, Paris, France.|Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris, France.|Psychiatrie de l'enfance et de l'adolescence - Hôpital Robert-Debré, Paris, France.
authors.forename: Richard
authors.initials: R
authors.lastname: Delorme
authors.affiliation: Centre Resource Autisme Bourgogne, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Nathalie
authors.initials: N
authors.lastname: Lagarde
authors.affiliation: Centre Resource Autisme Bourgogne, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Jean-Michel
authors.initials: JM
authors.lastname: Pinoit
authors.affiliation: Centre de Ressources Autisme de Haute Normandie, Saint Etienne du Rouvray, France.
authors.forename: Antoine
authors.initials: A
authors.lastname: Rosier
authors.affiliation: Centre de Génétique et Centre de Référence «Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs», Hôpital d'Enfants, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Alice
authors.initials: A
authors.lastname: Masurel-Paulet
authors.affiliation: Institut de Neurobiologie de la Méditerranée INSERM UMR901, Marseille, France.
authors.forename: Carlos
authors.identifier: 0000-0003-1914-9553
authors.initials: C
authors.lastname: Cardoso
authors.affiliation: Laboratoire de Cytogénétique, Plateau technique de Biologie, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Francine
authors.initials: F
authors.lastname: Mugneret
authors.affiliation: Inserm U 1079, IRIB, Rouen, France.
authors.forename: Pascale
authors.initials: P
authors.lastname: Saugier-Veber
authors.affiliation: Inserm U 1079, IRIB, Rouen, France.
authors.forename: Dominique
authors.initials: D
authors.lastname: Campion
authors.affiliation: Equipe Génétique et Anomalies du Développement, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, Dijon, France.|Centre de Génétique et Centre de Référence «Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs», Hôpital d'Enfants, CHU Dijon, Dijon, France.
authors.forename: Laurence
authors.initials: L
authors.lastname: Faivre
authors.affiliation: Institut Pasteur, Human Genetics and Cognitive Functions Unit, Paris, France.|CNRS UMR 3571: Genes, Synapses and Cognition, Institut Pasteur, Paris, France.|Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris, France.|Fondation FondaMental, Créteil, France.
authors.forename: Thomas
authors.initials: T
authors.lastname: Bourgeron
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