title: HD5 and HBD1 variants' solvation potential energy correlates with their antibacterial activity against Escherichia coli.
abstract: The structure-activity relationship of defensins is not clear. It is known that point mutations in HD5 and HBD1 could modify their activities; however, these mutations do not seem to alter their three-dimensional structures. Here, applying molecular dynamics simulations, this relationship was studied in depth. There are modifications in flexibility, solvent accessible surface area and radius of gyration, but these properties are not reflected in the activity. Only alterations in the solvation potential energy were correlated to antibacterial activity against Escherichia coli. Data here reported could lead to a better understanding of structural and functional aspects of α- and β-defensins.
authors.affiliation: Programa De Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.|Centro De Análises Proteômicas E Bioquímicas, Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.
authors.forename: William F
authors.initials: WF
authors.lastname: Porto
authors.affiliation: Programa De Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.|Curso De Física, Universidade Católica De Brasília, Brasília, DF, Brazil.
authors.forename: Diego O
authors.initials: DO
authors.lastname: Nolasco
authors.affiliation: Programa De Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.|Centro De Análises Proteômicas E Bioquímicas, Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.
authors.forename: Állan S
authors.initials: ÁS
authors.lastname: Pires
authors.affiliation: Programa De Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.
authors.forename: Gabriel R
authors.initials: GR
authors.lastname: Fernandes
authors.affiliation: Programa De Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.|Centro De Análises Proteômicas E Bioquímicas, Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.|S-Inova Biotech, Pos Graduação em Biotecnologia, Universidade Catolica Dom Bosco, Campo Grande, Campo Grande, Brazil.
authors.forename: Octávio L
authors.initials: OL
authors.lastname: Franco
authors.affiliation: Programa De Pós-Graduação Em Ciências Genômicas E Biotecnologia, Universidade Católica De Brasília, Brasília-, DF, Brazil.
authors.forename: Sérgio A
authors.initials: SA
authors.lastname: Alencar
mesh_terms: D000900:Anti-Bacterial Agents / Q000737:chemistry / Q000494:pharmacology*; D004926:Escherichia coli / Q000187:drug effects*; D007928:Lethal Dose 50; D008826:Microbial Sensitivity Tests; D056004:Molecular Dynamics Simulation; D012995:Solubility; D013329:Structure-Activity Relationship; D023084:alpha-Defensins / Q000737:chemistry / Q000494:pharmacology*
chemical_list: D000900:Anti-Bacterial Agents; C500225:DEFA5 protein, human; D023084:alpha-Defensins
keywords: LD50; molecular dynamics; point mutations; α-defensin; β-defensin