title: Theoretical Investigation of the Geometries and UV-vis Spectra of Poly(l-glutamic acid) Featuring a Photochromic Azobenzene Side Chain.
abstract: The geometries and UV-vis spectra of azobenzene dyes grafted as a side chain on poly(l-glutamic acid) have been investigated using a combination of quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) and time-dependent density functional theory (TD-DFT) methods at the TD-PBE0/6-311+G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p):Amber ff99 level of theory. The influence of the secondary structure of the polypeptide on the electronic properties of both the trans and cis conformations of azobenzene dyes has been studied. It turns out that the grafted dyes exhibit a red-shift of the π → π* absorption energies mainly due to the auxochromic shift induced by the peptidic group used to link the chromophoric unit to the polypeptide and that specific interactions between the glutamic side chain and the azobenzene moiety lead to a large blue-shift of the n → π* transition.
authors.affiliation: Equipe de Chimie et Biochimie Théoriques, UMR 7565 CNRS-UHP, Institut Jean Barriol (FR CNRS 2843), Faculté des Sciences et Techniques, Nancy-Université, B.P. 239,54506 Vandoeuvre-les-Nancy Cedex, France, and Groupe de Chimie Physique Théorique et Structurale, Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix, rue de Bruxelles, 61, B-5000 Namur, Belgium.
authors.forename: Pierre-François
authors.initials: PF
authors.lastname: Loos
authors.affiliation: Equipe de Chimie et Biochimie Théoriques, UMR 7565 CNRS-UHP, Institut Jean Barriol (FR CNRS 2843), Faculté des Sciences et Techniques, Nancy-Université, B.P. 239,54506 Vandoeuvre-les-Nancy Cedex, France, and Groupe de Chimie Physique Théorique et Structurale, Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix, rue de Bruxelles, 61, B-5000 Namur, Belgium.
authors.forename: Julien
authors.initials: J
authors.lastname: Preat
authors.affiliation: Equipe de Chimie et Biochimie Théoriques, UMR 7565 CNRS-UHP, Institut Jean Barriol (FR CNRS 2843), Faculté des Sciences et Techniques, Nancy-Université, B.P. 239,54506 Vandoeuvre-les-Nancy Cedex, France, and Groupe de Chimie Physique Théorique et Structurale, Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix, rue de Bruxelles, 61, B-5000 Namur, Belgium.
authors.forename: Adèle D
authors.initials: AD
authors.lastname: Laurent
authors.affiliation: Equipe de Chimie et Biochimie Théoriques, UMR 7565 CNRS-UHP, Institut Jean Barriol (FR CNRS 2843), Faculté des Sciences et Techniques, Nancy-Université, B.P. 239,54506 Vandoeuvre-les-Nancy Cedex, France, and Groupe de Chimie Physique Théorique et Structurale, Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix, rue de Bruxelles, 61, B-5000 Namur, Belgium.
authors.forename: Catherine
authors.initials: C
authors.lastname: Michaux
authors.affiliation: Equipe de Chimie et Biochimie Théoriques, UMR 7565 CNRS-UHP, Institut Jean Barriol (FR CNRS 2843), Faculté des Sciences et Techniques, Nancy-Université, B.P. 239,54506 Vandoeuvre-les-Nancy Cedex, France, and Groupe de Chimie Physique Théorique et Structurale, Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix, rue de Bruxelles, 61, B-5000 Namur, Belgium.
authors.forename: Denis
authors.initials: D
authors.lastname: Jacquemin
authors.affiliation: Equipe de Chimie et Biochimie Théoriques, UMR 7565 CNRS-UHP, Institut Jean Barriol (FR CNRS 2843), Faculté des Sciences et Techniques, Nancy-Université, B.P. 239,54506 Vandoeuvre-les-Nancy Cedex, France, and Groupe de Chimie Physique Théorique et Structurale, Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix, rue de Bruxelles, 61, B-5000 Namur, Belgium.
authors.forename: Eric A
authors.initials: EA
authors.lastname: Perpète
authors.affiliation: Equipe de Chimie et Biochimie Théoriques, UMR 7565 CNRS-UHP, Institut Jean Barriol (FR CNRS 2843), Faculté des Sciences et Techniques, Nancy-Université, B.P. 239,54506 Vandoeuvre-les-Nancy Cedex, France, and Groupe de Chimie Physique Théorique et Structurale, Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix, rue de Bruxelles, 61, B-5000 Namur, Belgium.
authors.forename: Xavier
authors.initials: X
authors.lastname: Assfeld