title: Noncontiguous finished genome sequence and description of Virgibacillus massiliensis sp. nov., a moderately halophilic bacterium isolated from human gut.
abstract: Strain Vm-5(T) was isolated from the stool specimen of a 10-year-old Amazonian boy. This bacterium is a Gram-positive, strictly aerobic rod, motile by a polar flagellum. Here we describe its phenotypic characteristics and complete genome sequence. The 4 353 177 bp long genome exhibits a G + C content of 36.87% and contains 4394 protein-coding and 125 predicted RNA genes. Phylogenetically and genetically, strain Vm-c is a member of the genus Virgibacillus but is distinct enough to be classified as a new species. We propose the creation of V. massiliensis sp. nov., whose type strain is strain Vm-5(T) (CSUR P971 = DSM 28587).
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: S
authors.initials: S
authors.lastname: Khelaifia
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: O
authors.initials: O
authors.lastname: Croce
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: J-C
authors.initials: JC
authors.lastname: Lagier
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: C
authors.initials: C
authors.lastname: Robert
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: C
authors.initials: C
authors.lastname: Couderc
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: F
authors.initials: F
authors.lastname: Di Pinto
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: B
authors.initials: B
authors.lastname: Davoust
authors.affiliation: Centre Hospitalier André Rosemon, Cayenne, French Guiana.
authors.forename: F
authors.initials: F
authors.lastname: Djossou
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France ; Special Infectious Agents Unit, King Fahd Medical Research Center, King Abdulaziz University, Jeddah, Saudi Arabia.
authors.forename: D
authors.initials: D
authors.lastname: Raoult
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: P-E
authors.initials: PE
authors.lastname: Fournier
keywords: Culturomics; Virgibacillus massiliensis; genome; human gut; moderately halophilic bacteria; taxonogenomics