title: An eco-epidemiological study of Morbilli-related paramyxovirus infection in Madagascar bats reveals host-switching as the dominant macro-evolutionary mechanism.
abstract: An eco-epidemiological investigation was carried out on Madagascar bat communities to better understand the evolutionary mechanisms and environmental factors that affect virus transmission among bat species in closely related members of the genus Morbillivirus, currently referred to as Unclassified Morbilli-related paramyxoviruses (UMRVs). A total of 947 bats were investigated originating from 52 capture sites (22 caves, 18 buildings, and 12 outdoor sites) distributed over different bioclimatic zones of the island. Using RT-PCR targeting the L-polymerase gene of the Paramyxoviridae family, we found that 10.5% of sampled bats were infected, representing six out of seven families and 15 out of 31 species analyzed. Univariate analysis indicates that both abiotic and biotic factors may promote viral infection. Using generalized linear modeling of UMRV infection overlaid on biotic and abiotic variables, we demonstrate that sympatric occurrence of bats is a major factor for virus transmission. Phylogenetic analyses revealed that all paramyxoviruses infecting Malagasy bats are UMRVs and showed little host specificity. Analyses using the maximum parsimony reconciliation tool CoRe-PA, indicate that host-switching, rather than co-speciation, is the dominant macro-evolutionary mechanism of UMRVs among Malagasy bats.
authors.affiliation: Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Emergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), Plateforme de Recherche CYROI, 2 rue Maxime Rivière, 97490 Sainte Clotilde, La Réunion, France.|Université de La Réunion, UMR PIMIT "Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical", INSERM U1187, CNRS 9192, IRD 249, Plateforme de Recherche CYROI, Saint Denis, La Réunion, France.|Institut de Recherche pour le Développement (IRD), IRD - BP 50172, 97492 Sainte-Clotilde, La Réunion, France.
authors.forename: Julien
authors.initials: J
authors.lastname: Mélade
authors.affiliation: University of Leipzig, Department of Computer Science, Augustusplatz 10, D-04109 Leipzig, Germany.
authors.forename: Nicolas
authors.initials: N
authors.lastname: Wieseke
authors.affiliation: Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Emergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), Plateforme de Recherche CYROI, 2 rue Maxime Rivière, 97490 Sainte Clotilde, La Réunion, France.|Université de La Réunion, UMR PIMIT "Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical", INSERM U1187, CNRS 9192, IRD 249, Plateforme de Recherche CYROI, Saint Denis, La Réunion, France.|Institut de Recherche pour le Développement (IRD), IRD - BP 50172, 97492 Sainte-Clotilde, La Réunion, France.|Association Vahatra, BP 3972, Antananarivo 101, Madagascar.|Institut Pasteur de Madagascar, BP 1274 Ambohitrakely, Antananarivo 101, Madagascar.
authors.forename: Beza
authors.initials: B
authors.lastname: Ramasindrazana
authors.affiliation: UMR C53 CIRAD, Peuplements Végétaux et Bioagresseurs en Milieu Tropical, 7 chemin de l'IRAT, 97410 St Pierre, France.|Université de La Réunion, 15 Avenue René Cassin, 97400 Saint-Denis, France.
authors.forename: Olivier
authors.initials: O
authors.lastname: Flores
authors.affiliation: Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Emergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), Plateforme de Recherche CYROI, 2 rue Maxime Rivière, 97490 Sainte Clotilde, La Réunion, France.|Université de La Réunion, UMR PIMIT "Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical", INSERM U1187, CNRS 9192, IRD 249, Plateforme de Recherche CYROI, Saint Denis, La Réunion, France.|Institut de Recherche pour le Développement (IRD), IRD - BP 50172, 97492 Sainte-Clotilde, La Réunion, France.
authors.forename: Erwan
authors.initials: E
authors.lastname: Lagadec
authors.affiliation: Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Emergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), Plateforme de Recherche CYROI, 2 rue Maxime Rivière, 97490 Sainte Clotilde, La Réunion, France.|Université de La Réunion, UMR PIMIT "Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical", INSERM U1187, CNRS 9192, IRD 249, Plateforme de Recherche CYROI, Saint Denis, La Réunion, France.|Institut de Recherche pour le Développement (IRD), IRD - BP 50172, 97492 Sainte-Clotilde, La Réunion, France.
authors.forename: Yann
authors.initials: Y
authors.lastname: Gomard
authors.affiliation: Association Vahatra, BP 3972, Antananarivo 101, Madagascar.|Field Museum of Natural History, 1400 S. Lake Shore Dr, Chicago, IL 60605-2496, USA.
authors.forename: Steven M
authors.initials: SM
authors.lastname: Goodman
authors.affiliation: Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Emergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), Plateforme de Recherche CYROI, 2 rue Maxime Rivière, 97490 Sainte Clotilde, La Réunion, France.|Université de La Réunion, UMR PIMIT "Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical", INSERM U1187, CNRS 9192, IRD 249, Plateforme de Recherche CYROI, Saint Denis, La Réunion, France.|Institut de Recherche pour le Développement (IRD), IRD - BP 50172, 97492 Sainte-Clotilde, La Réunion, France.
authors.forename: Koussay
authors.initials: K
authors.lastname: Dellagi
authors.affiliation: Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Emergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), Plateforme de Recherche CYROI, 2 rue Maxime Rivière, 97490 Sainte Clotilde, La Réunion, France.|Université de La Réunion, UMR PIMIT "Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical", INSERM U1187, CNRS 9192, IRD 249, Plateforme de Recherche CYROI, Saint Denis, La Réunion, France.|Institut de Recherche pour le Développement (IRD), IRD - BP 50172, 97492 Sainte-Clotilde, La Réunion, France.
authors.forename: Hervé
authors.initials: H
authors.lastname: Pascalis
mesh_terms: D000818:Animals; D005075:Biological Evolution; D002685:Chiroptera; D016021:Epidemiologic Studies; D005838:Genotype; D058507:Host Specificity; D008270:Madagascar / Q000453:epidemiology; D010252:Paramyxoviridae / Q000145:classification* / Q000235:genetics / Q000302:isolation & purification / Q000502:physiology*; D018184:Paramyxoviridae Infections / Q000453:epidemiology / Q000662:veterinary* / Q000821:virology; D010802:Phylogeny; D015995:Prevalence; D012367:RNA, Viral / Q000235:genetics; D020133:Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction; D017422:Sequence Analysis, DNA; D056189:Viral Tropism
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