title: A non-enteric adenovirus A12 gastroenteritis outbreak in Rio de Janeiro, Brazil.
abstract: A gastroenteritis outbreak that occurred in 2013 in a low-income community in Rio de Janeiro was investigated for the presence of enteric viruses, including species A rotavirus (RVA), norovirus (NoV), astrovirus (HAstV), bocavirus (HBoV), aichivirus (AiV), and adenovirus (HAdV). Five of nine stool samples (83%) from patients were positive for HAdV, and no other enteric viruses were detected. Polymerase chain reaction products were sequenced and subjected to phylogenetic analysis, which revealed four strains and one strain of non-enteric HAdV-A12 and HAdV-F41, respectively. The HAdV-A12 nucleotide sequences shared 100% nucleotide similarity. Viral load was assessed using a TaqMan real-time PCR assay. Stool samples that were positive for HAdV-A12 had high viral loads (mean 1.9 X 107 DNA copies/g stool). All four patients with HAdV-A12 were < 25 months of age and had symptoms of fever and diarrhoea. Evaluation of enteric virus outbreaks allows the characterisation of novel or unique diarrhoea-associated viruses in regions where RVA vaccination is routinely performed.
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: Silvana Augusta Rodrigues
authors.initials: SA
authors.lastname: Portes
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: Eduardo de Mello
authors.initials: Ede M
authors.lastname: Volotão
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: Monica Simões
authors.initials: MS
authors.lastname: Rocha
authors.affiliation: Laboratório Central de Saúde Pública, Laboratório Central de Saúde Pública, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Laboratório Central de Saúde Pública, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: Maria Cristina
authors.initials: MC
authors.lastname: Rebelo
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: Maria da Penha Trindade Pinheiro
authors.initials: Mda P
authors.lastname: Xavier
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: Rosane Maria de
authors.initials: RM
authors.lastname: Assis
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: Tatiana Lundgren
authors.initials: TL
authors.lastname: Rose
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: Marize Pereira
authors.initials: MP
authors.lastname: Miagostovich
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
authors.forename: José Paulo Gagliardi
authors.initials: JP
authors.lastname: Leite
authors.affiliation: Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro RJ , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.|Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Escritório Técnico Regional Fiocruz Piauí, Teresina PI , Brasil, Fundação Oswaldo Cruz, Escritório Técnico Regional Fiocruz Piauí, Teresina, PI, Brasil.
authors.forename: Filipe Anibal
authors.initials: FA
authors.lastname: Carvalho-Costa
mesh_terms: D000256:Adenoviridae / Q000235:genetics / Q000302:isolation & purification*; D000257:Adenoviridae Infections / Q000453:epidemiology* / Q000821:virology; D000328:Adult; D001938:Brazil / Q000453:epidemiology; D002675:Child, Preschool; D003967:Diarrhea / Q000453:epidemiology / Q000821:virology; D004196:Disease Outbreaks; D005243:Feces / Q000821:virology; D005260:Female; D005759:Gastroenteritis / Q000453:epidemiology / Q000821:virology*; D006801:Humans; D007223:Infant; D008297:Male; D008875:Middle Aged; D010802:Phylogeny; D012367:RNA, Viral / Q000235:genetics; D060888:Real-Time Polymerase Chain Reaction
chemical_list: D012367:RNA, Viral