Whole-Genome Sequence of Hafnia alvei HUMV-5920, a Human Isolate.
A clinical isolate of Hafnia alvei (strain HUMV-5920) was obtained from a urine sample from an adult patient. We report here its complete genome assembly using PacBio single-molecule real-time (SMRT) sequencing, which resulted in a chromosome with 4.5 Mb and a circular contig of 87 kb. About 4,146 protein-coding genes are predicted from this assembly.
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Santander, Cantabria, Spain Instituto de Investigación Sanitaria Valdecilla (IDIVAL), Santander, Cantabria, Spain Red Española de Investigación en Patología Infecciosa (REIPI), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain.
María
M
Lázaro-Díez
Instituto de Investigación en Ingeniería de Aragón (I3A), Universidad de Zaragoza, Zaragoza, Spain.
Santiago
S
Redondo-Salvo
Instituto de Investigación Sanitaria Valdecilla (IDIVAL), Santander, Cantabria, Spain.
Aroa
A
Arboleya-Agudo
Servicio de Inmunología, Hospital Universitario Marqués de Valdecilla-IDIVAL. Santander, Cantabria, Spain.
Javier Gonzalo
JG
Ocejo-Vinyals
Instituto de Investigación Sanitaria Valdecilla (IDIVAL), Santander, Cantabria, Spain.
Itziar
I
Chapartegui-González
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Santander, Cantabria, Spain Instituto de Investigación Sanitaria Valdecilla (IDIVAL), Santander, Cantabria, Spain Red Española de Investigación en Patología Infecciosa (REIPI), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain.
Alain A
AA
Ocampo-Sosa
Grupo de Investigación en Acuicultura, Universidad de Las Palmas de Gran Canaria, Arucas, Gran Canaria, Spain.
Felix
F
Acosta
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Santander, Cantabria, Spain Instituto de Investigación Sanitaria Valdecilla (IDIVAL), Santander, Cantabria, Spain Red Española de Investigación en Patología Infecciosa (REIPI), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain Departamento de Biología Molecular, Universidad de Cantabria, Santander, Spain.
Luis
L
Martínez-Martínez
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Santander, Cantabria, Spain Instituto de Investigación Sanitaria Valdecilla (IDIVAL), Santander, Cantabria, Spain Red Española de Investigación en Patología Infecciosa (REIPI), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain jvivas@idival.org.
José
J
Ramos-Vivas