Kinetic and X-ray crystallographic investigations of substituted 2-thio-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine-benzenesulfonamides acting as carbonic anhydrase inhibitors.
Herein we report an in vitro kinetic evaluation against the most relevant human carbonic anhydrase (hCA, EC 4.2.1.1) isoforms (I, II, IX and XII) of a small series of lactate dehydrogenase (LDH, EC 1.1.1.27) inhibitors. All compounds contain a primary sulfonamide zinc-binding group (ZBG) substituted with the 2-thio-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine scaffold. By means of X-ray crystallographic experiments we explored the ligand-enzyme binding modes, thus highlighting the contribution of the 2-thio-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine moiety to the stabilization of the complex.
Università degli Studi di Firenze, Dipartimento di Chimica, Laboratorio di Chimica Bioinorganica, Rm. 188, Via della Lastruccia 3, 50019 Sesto Fiorentino (Florence), Italy.
Daniela
D
Vullo
Università degli Studi di Firenze, Dipartimento di Chimica, Laboratorio di Chimica Bioinorganica, Rm. 188, Via della Lastruccia 3, 50019 Sesto Fiorentino (Florence), Italy; Università degli Studi di Firenze, Dipartimento Neurofarba, Sezione di Scienze Farmaceutiche e Nutraceutiche, Polo Scientifico, Via U. Schiff 6, 50019 Sesto Fiorentino, Florence, Italy.
Claudiu T
CT
Supuran
Università degli Studi di Firenze, Dipartimento di Chimica, Laboratorio di Chimica Bioinorganica, Rm. 188, Via della Lastruccia 3, 50019 Sesto Fiorentino (Florence), Italy.
Andrea
A
Scozzafava
Istituto di Biostrutture e Bioimmagini-CNR, via Mezzocannone 16, 80134 Naples, Italy.
Giuseppina
G
De Simone
Istituto di Biostrutture e Bioimmagini-CNR, via Mezzocannone 16, 80134 Naples, Italy.
Simona Maria
SM
Monti
Istituto di Biostrutture e Bioimmagini-CNR, via Mezzocannone 16, 80134 Naples, Italy. Electronic address: vincenzo.alterio@cnr.it.
Vincenzo
V
Alterio
Università degli Studi di Firenze, Dipartimento di Chimica, Laboratorio di Chimica Bioinorganica, Rm. 188, Via della Lastruccia 3, 50019 Sesto Fiorentino (Florence), Italy. Electronic address: fabrizio.carta@unifi.it.
Fabrizio
F
Carta
D000595:Amino Acid Sequence; D002257:Carbonic Anhydrase Inhibitors / Q000737:chemistry* / Q000494:pharmacology*; D002256:Carbonic Anhydrases / Q000737:chemistry; D018360:Crystallography, X-Ray; D007527:Isoenzymes / Q000737:chemistry; D007700:Kinetics; D015394:Molecular Structure; D017386:Sequence Homology, Amino Acid; D013449:Sulfonamides / Q000737:chemistry* / Q000494:pharmacology*
D002257:Carbonic Anhydrase Inhibitors; D007527:Isoenzymes; D013449:Sulfonamides; D002256:Carbonic Anhydrases
2-Thio-6-oxo-1,6-dihydropyrimidines; Carbonic anhydrase (CA); Sulfonamides; X-ray crystallography