Distribution and genetic diversity of the human polyomaviruses JC and BK in surface water and sewage treatment plant during 2009 in Porto Alegre, Southern Brazil.
The human polyomaviruses JC and BK (JCPyV and BKPyV) are ubiquitous, species-specific viruses that belong to the family Polyomaviridae. These viruses are known to be excreted in human urine, and they are potential indicators of human wastewater contamination. In order to assess the distribution of both JCPyV and BKPyV in urban water samples collected from a sewage treatment plant (STP) and from a canalized water stream of Porto Alegre, Brazil, two nested-PCR assays were optimized and applied to the samples collected. The amplicons obtained were submitted to sequencing, and the sequences were analyzed with sequences of human polyomaviruses previously deposited in GenBank. Twelve out of 30 water samples (40%) were JCPyV positive, whereas six samples (20%) were BKPyV positive. The sequencing results confirmed the presence of JCPyV subtypes 1 and 3, whereas only BKPyV Ia and Ib were found. This study shows for the first time the presence of human polyomaviruses in surface water and in samples collected in a sewage treatment plant in southern Brazil.
Laboratório de Virologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto Básico de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS, Rua Sarmento Leite, 500, CEP 90050-170, Porto Alegre, RS, Brazil.
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Comerlato
Laboratório de Virologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto Básico de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS, Rua Sarmento Leite, 500, CEP 90050-170, Porto Alegre, RS, Brazil.
F
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Souza-Campos
Laboratório de Virologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto Básico de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS, Rua Sarmento Leite, 500, CEP 90050-170, Porto Alegre, RS, Brazil.
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Souza-Arantes
Laboratório de Virologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto Básico de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS, Rua Sarmento Leite, 500, CEP 90050-170, Porto Alegre, RS, Brazil.
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Roos-Kulmann
Laboratório de Virologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto Básico de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS, Rua Sarmento Leite, 500, CEP 90050-170, Porto Alegre, RS, Brazil.
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Trindade-Oliveira
Laboratório de Microbiologia Molecular, Universidade Feevale, Campus II, CEP 93352-000, Novo Hamburgo, RS, Brazil.
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Rosado-Spilki
Laboratório de Bacteriologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto Básico de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS, Rua Sarmento Leite, 500, CEP 90050-170, Porto Alegre, RS, Brazil.
A P
AP
Guedes-Frazzon
Laboratório de Virologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto Básico de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS, Rua Sarmento Leite, 500, CEP 90050-170, Porto Alegre, RS, Brazil.
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PM
Roehe
Laboratório de Virologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto Básico de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS, Rua Sarmento Leite, 500, CEP 90050-170, Porto Alegre, RS, Brazil.
A C
AC
Franco
D001739:BK Virus / Q000235:genetics* / Q000302:isolation & purification*; D001938:Brazil; D005618:Fresh Water / Q000821:virology*; D014644:Genetic Variation; D007577:JC Virus / Q000235:genetics* / Q000302:isolation & purification*; D016133:Polymerase Chain Reaction; D012722:Sewage / Q000821:virology*
D012722:Sewage