Multiplex PCR designed to differentiate species within the Candida glabrata complex.
BACKGROUND
No phenotypic methods are available to unequivocally differentiate species within the Candida glabrata complex.


OBJECTIVE
To develop a new multiplex PCR method to differentiate between the three species of the C. glabrata species complex, as well as using it to study a C. glabrata collection to discover strains of the newly described species.


METHODS
The method was developed based on the Internal Transcribed Spacer (ITS) sequence differences between the species. It was validated by using a blinded collection of strains and, finally, the new molecular method was used to study a collection of 192 C. glabrata species complex strains. The obtained results were compared with ITS sequencing.


RESULTS
The proposed method showed 100% concordance with ITS sequencing and proved to be effective for clinical and epidemiological applications. Two Candida bracarensis and three Candida nivariensis were found out of the 192 studied strains (0.93% and 1.40% prevalence, respectively).


CONCLUSIONS
A fast, inexpensive, robust and highly reproducible multiplex PCR method is presented. Its usefulness is demonstrated by studying a large collection of C. glabrata sensu lato strains.
Laboratorio de Micología y Diagnóstico Molecular, Cátedra de Parasitología y Micología, Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas (CONICET), CCT-Santa Fe, Santa Fe, Argentina.
Catiana
C
Dudiuk
Laboratorio de Micología y Diagnóstico Molecular, Cátedra de Parasitología y Micología, Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina.
Soraya E
SE
Morales-López
Centro de Referencia de Micología (CEREMIC), Facultad Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Argentina.
Virginia
V
Podesta
Laboratorio de Micología y Diagnóstico Molecular, Cátedra de Parasitología y Micología, Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina.
Daiana
D
Macedo
Laboratorio de Micología y Diagnóstico Molecular, Cátedra de Parasitología y Micología, Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas (CONICET), CCT-Santa Fe, Santa Fe, Argentina.
Florencia
F
Leonardelli
Departamento de Micología, CONICET, Hospital JM Ramos Mejía, Buenos Aires, Argentina.
Roxana G
RG
Vitale
Centro de Referencia de Micología (CEREMIC), Facultad Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Argentina.
María E
ME
Tosello
Laboratorio de Micología y Diagnóstico Molecular, Cátedra de Parasitología y Micología, Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas (CONICET), CCT-Santa Fe, Santa Fe, Argentina.
Matías S
MS
Cabeza
Centro de Referencia de Micología (CEREMIC), Facultad Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Argentina.
Marisa
M
Biasoli
Laboratorio de Micología y Diagnóstico Molecular, Cátedra de Parasitología y Micología, Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina.
Soledad
S
Gamarra
Laboratorio de Micología y Diagnóstico Molecular, Cátedra de Parasitología y Micología, Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas (CONICET), CCT-Santa Fe, Santa Fe, Argentina. Electronic address: ggarcia@unl.edu.ar.
Guillermo
G
Garcia-Effron
D041221:Candida glabrata / Q000145:classification*; D060885:Multiplex Polymerase Chain Reaction
Candida bracarensis; Candida glabrata complex; Candida nivariensis; Complejo Candida glabrata; Identificación molecular; Molecular identification