title: Noncontiguous finished genome sequence and description ofPrevotella phocaeensissp. nov., a new anaerobic species isolated from human gut infected byClostridium difficile.
abstract: Prevotella phocaeensissp. nov. strain SN19T(= DSM 103364) is a new species isolated from the gut microbiota of patient with colitis due toClostridium difficile. Strain SN19Tis Gram-negative rod-shaped bacteria, strictly anaerobic, nonmotile and non-endospore forming. The predominance fatty acid is hexadecanoic acid. Its 16S rRNA showed a 97.70% sequence identity with its phylogenetically closest species,Prevotella oralis. The genome is 2 922 117 bp long and contains 2486 predicted genes including 56 RNA genes.
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: P
authors.initials: P
authors.lastname: Afouda
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: S
authors.initials: S
authors.lastname: Ndongo
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: S
authors.initials: S
authors.lastname: Khelaifia
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: N
authors.initials: N
authors.lastname: Labas
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: F
authors.initials: F
authors.lastname: Cadoret
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: F
authors.initials: F
authors.lastname: Di Pinto
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: J
authors.initials: J
authors.lastname: Delerce
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France; Special Infectious Agents Unit, King Fahd Medical Research Center, King Abdulaziz University, Jeddah, Saudi Arabia.
authors.forename: D
authors.initials: D
authors.lastname: Raoult
authors.affiliation: Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
authors.forename: M
authors.initials: M
authors.lastname: Million
keywords: Clostridium difficile; Prevotella phocaeensis; culturomics; gut microbiota; taxonogenomics