title: A rare case of a boy with de novo microduplication at 5q35.2q35.3 from central Brazil.
abstract: Genomic disorders are genetic diseases that are caused by rearrangements of chromosomal material via deletions, duplications, and inversions of unique genomic segments at specific regions. Such rearrangements could result from recurrent non-allelic homologous recombination between low copy repeats. In cases where the breakpoints flank the low copy repeats, deletion of chromosomal segments is often followed by reciprocal duplication. Variations in genomic copy number manifest differently, with duplication and deletions of the same genomic region showing opposite phenotypes. Sotos syndrome is caused by alterations in the dosage of NSD1 on human chromosome 5 by either deletions or mutations, such as microdeletion of 5q35.2q35.3. In general, patients carrying reciprocal microduplication at 5q35.2q35.3 present no clinical phenotype or milder phenotype than do patients with microdeletion at the same locus. We report the first case of 5q35.2q35.3 microduplication encompassing NSD1 in a patient from central Brazil. We identified a genomic imbalance corresponding to a de novo 0.45 Mb microduplication at 5q35.2q35.3 by chromosomal microarray analysis and study of low-copy repeats. The proband had microduplication in the chromosomal region containing NSD1, which resulted in a Sotos syndrome reversed phenotype, and this duplication was associated with microcephaly, short stature, and developmental delay. Analysis of the genomic structure of the rearranged 5q35.2q35.3 chromosomal region revealed two major low-copy repeat families, which caused the recurrent rearrangements. Chromosomal microarray analysis is a potential tool to identify microrearrangements and guide medical diagnosis, which has to be followed by a non-directive genetic counseling approach to improve the quality of life of the patient.
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil fafireis28620@gmail.com.|Núcleo de Pesquisas Replicon, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil fafireis28620@gmail.com.
authors.forename: F G
authors.initials: FG
authors.lastname: Reis
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade, Rede Centro Oeste de Pós-Graduação, Pesquisa e Inovação, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Núcleo de Pesquisas Replicon, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.
authors.forename: I P
authors.initials: IP
authors.lastname: Pinto
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação Mestrado em Genética, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Núcleo de Pesquisas Replicon, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.
authors.forename: L B
authors.initials: LB
authors.lastname: Minasi
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade, Rede Centro Oeste de Pós-Graduação, Pesquisa e Inovação, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Núcleo de Pesquisas Replicon, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.
authors.forename: A V
authors.initials: AV
authors.lastname: Melo
authors.affiliation: Núcleo de Pesquisas Replicon, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.
authors.forename: D M da C
authors.initials: DM
authors.lastname: Cunha
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade, Rede Centro Oeste de Pós-Graduação, Pesquisa e Inovação, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Núcleo de Pesquisas Replicon, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.
authors.forename: C L
authors.initials: CL
authors.lastname: Ribeiro
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade, Rede Centro Oeste de Pós-Graduação, Pesquisa e Inovação, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Programa de Pós-Graduação Mestrado em Genética, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Núcleo de Pesquisas Replicon, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Laboratório de Citogenética Humana e Genética Molecular, Secretaria de Estado da Saúde de Goiás, Laboratório de Saúde Pública Dr. Giovanni Cysneiros (LAGENE/LACEN/SESGO), Goiânia, GO, Brasil.
authors.forename: C C
authors.initials: CC
authors.lastname: da Silva
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Programa de Pós-Graduação Mestrado em Genética, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.
authors.forename: D de M
authors.initials: DM
authors.lastname: Silva
authors.affiliation: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade, Rede Centro Oeste de Pós-Graduação, Pesquisa e Inovação, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Programa de Pós-Graduação Mestrado em Genética, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Núcleo de Pesquisas Replicon, Departamento de Biologia, Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.|Laboratório de Citogenética Humana e Genética Molecular, Secretaria de Estado da Saúde de Goiás, Laboratório de Saúde Pública Dr. Giovanni Cysneiros (LAGENE/LACEN/SESGO), Goiânia, GO, Brasil.
authors.forename: A D
authors.initials: AD
authors.lastname: da Cruz
mesh_terms: D001938:Brazil; D025063:Chromosome Disorders / Q000175:diagnosis* / Q000235:genetics*; D058674:Chromosome Duplication; D002895:Chromosomes, Human, Pair 5; D006801:Humans; D008297:Male; D010641:Phenotype