TET2 exon 2 skipping is an independent favorable prognostic factor for cytogenetically normal acute myelogenous leukemia (AML): TET2 exon 2 skipping in AML.
In AML, approximately one-third of expressed genes are abnormally spliced, including aberrant TET2 exon 2 expression. In a discovery cohort (n=99), TET2 exon 2 skipping (TET2E2S) was found positively associated with a significant reduction in the cumulative incidence of relapse (CIR). Age, cytogenetics, and TET2E2S were independent prognostic factors for disease-free survival (DFS), and favorable effects on outcomes predominated in cytogenetic normal (CN)-AML and younger patients. Using the same cutoff in a validation cohort of 86 CN-AML patients, TET2E2Shighpatients were found to be younger than TET2lowpatients without a difference in the rate of complete remission. However, TET2E2Shighpatients exhibited a significantly lower CIR (p<10-4). TET2E2S and FLT3-ITD, but not age or NPM1 mutation status were independent prognostic factors for DFS and event-free survival (EFS), while TET2E2S was the sole prognostic factor that we identified for overall survival (OS). In both the intermediate-1 and favorable ELN genetic categories, TET2E2S remained significantly associated with prolonged survival. There was no correlation between TET2E2S status and outcomes in 34 additional AML patients who were unfit for IC. Therefore our results suggest that assessments of TET2 exon 2 splicing status might improve risk stratification in CN-AML patients treated with IC.
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France.
Aminetou Mint
AM
Mohamed
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France.
Marie
M
Balsat
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France.
Catherine
C
Koering
Service de Biostatistique, UMR 5558, Laboratoire Biostatistique Santé, Pierre-Bénite, France.
Delphine
D
Maucort-Boulch
Hopital Saint-Louis-University, Paris 7, France.
Nicolas
N
Boissel
INSERM, UMR-S1052, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon, Lyon, France.
Lea
L
Payen-Gay
Jean-Pierre Aubert Center, INSERM U837, Facteurs de persistance des cellules leucémiques, Institute for Cancer Research in Lille, Genomics Core, 1, Place de Verdun, 59045, Lille Cedex, France.
Meyling
M
Cheok
Centre de Recherche sur le Cancer de Lyon, Inserm, Epissage alternatif et progression tumorale, Lyon, France.
Hussein
H
Mortada
Centre de Recherche sur le Cancer de Lyon, Inserm, Epissage alternatif et progression tumorale, Lyon, France.
Didier
D
Auboeuf
Centre de Recherche sur le Cancer de Lyon, Inserm, Echappement aux systèmes de sauvegarde et plasticité cellulaire, Lyon, France.
Christiane
C
Pinatel
Université Lyon I, Service d'Hématologie, Pavillon Marcel Bérard, Centre Hospitalier Lyon-Sud, Pierre Bénite, France.
Mohamed
M
El-Hamri
Université Lyon I, Cytogénétique, Laboratoire d'Hématologie, Centre Hospitalier Lyon-Sud, Pierre Bénite, France.
Isabelle
I
Tigaud
Université Lyon I, Laboratoire d'Hématologie-Biologie Moléculaire, Centre Hospitalier Lyon-Sud, Pierre Bénite, France.
Sandrine
S
Hayette
Centre de Recherche sur le Cancer de Lyon, Inserm, Anticorps Anticancer, Lyon, France.
Charles
C
Dumontet
Centre de Recherche sur le Cancer de Lyon, Inserm, Anticorps Anticancer, Lyon, France.
Emeline
E
Cros
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France; Université de Saint Etienne, Laboratoire d'Hématologie, CHU de Saint-Etienne, France.
Pascale
P
Flandrin-Gresta
Jean-Pierre Aubert Center, INSERM U837, Facteurs de persistance des cellules leucémiques, Institute for Cancer Research in Lille, Genomics Core, 1, Place de Verdun, 59045, Lille Cedex, France.
Olivier
O
Nibourel
Jean-Pierre Aubert Center, INSERM U837, Facteurs de persistance des cellules leucémiques, Institute for Cancer Research in Lille, Genomics Core, 1, Place de Verdun, 59045, Lille Cedex, France.
Claude
C
Preudhomme
Université Lyon I, Service d'Hématologie, Pavillon Marcel Bérard, Centre Hospitalier Lyon-Sud, Pierre Bénite, France.
Xavier
X
Thomas
Université Lyon I, Service d'Hématologie, Pavillon Marcel Bérard, Centre Hospitalier Lyon-Sud, Pierre Bénite, France.
Franck-Emmanuel
FE
Nicolini
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France; Université de Saint Etienne, Laboratoire d'Hématologie, CHU de Saint-Etienne, France.
Françoise
F
Solly
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France; Institut de Cancérologie de la Loire, CHU de Saint-Etienne, Saint Priest en Jarez, France.
Denis
D
Guyotat
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France; Université de Saint Etienne, Laboratoire d'Hématologie, CHU de Saint-Etienne, France.
Lydia
L
Campos
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France; Université Lyon I, Service d'Hématologie, Pavillon Marcel Bérard, Centre Hospitalier Lyon-Sud, Pierre Bénite, France.
Mauricette
M
Michallet
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France.
Antony
A
Ceraulo
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France. Electronic address: franck.mortreux@ens-lyon.fr.
Franck
F
Mortreux
Université Lyon 1, CNRS UMR5239, Oncovirologie et Biothérapies, Faculté de Médecine Lyon Sud, ENS - HCL, Pierre Bénite, France; Université Lyon I, Service d'Hématologie, Pavillon Marcel Bérard, Centre Hospitalier Lyon-Sud, Pierre Bénite, France. Electronic address: eric.wattel@chu-lyon.fr.
Eric
E
Wattel
D000367:Age Factors; D003582:Cytogenetics; D004268:DNA-Binding Proteins / Q000235:genetics*; D049308:Dioxygenases; D018572:Disease-Free Survival; D005091:Exons; D005260:Female; D006801:Humans; D015470:Leukemia, Myeloid, Acute / Q000235:genetics* / Q000401:mortality; D008297:Male; D008875:Middle Aged; D000090243:Nucleophosmin; D011379:Prognosis; D011518:Proto-Oncogene Proteins / Q000235:genetics*; D018570:Risk Assessment; D051941:fms-Like Tyrosine Kinase 3 / Q000235:genetics
D004268:DNA-Binding Proteins; C000716967:NPM1 protein, human; D011518:Proto-Oncogene Proteins; D000090243:Nucleophosmin; D049308:Dioxygenases; C541081:TET2 protein, human; D051941:fms-Like Tyrosine Kinase 3
Acute myeloid leukemia mRNA splicing; Intensive chemotherapy TET2; Prognosic