title: Protochlamydia phocaeensis sp. nov., a new Chlamydiales species with host dependent replication cycle.
abstract: Chlamydiae are pathogenic and symbiotic bacteria, which form an important part of amoeba-associated microorganisms. In this paper, we report the isolation, developmental cycle and genome analysis of Protochlamydia phocaeensis sp. nov., an obligate intracellular parasite with a large host spectrum, able to infect Acanthamoeba castellanii, Acanthamoeba polyphaga, and Vermamoeba vermiformis. The genome size is 3,424,182 bp with a GC content of 42%. This bacterium displayed a particular developmental cycle depending on the infected host. The P. phocaeensis showed typical inclusion vacuoles in A. castellanii, while these were absent in V. vermiformis. Since "Chlamydiae-amoebae" interactions are supposed to depend on the chlamydial species, our findings speculate that variations in the developmental cycle of certain Chlamydiae are also host dependent.
authors.affiliation: Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM U1095, Facultés de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France; Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) Méditerranée Infection, Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, Centre Hospitalo-Universitaire Timone, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille, Marseille, France.
authors.forename: Jacques Y
authors.initials: JY
authors.lastname: Bou Khalil
authors.affiliation: Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM U1095, Facultés de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.
authors.forename: Samia
authors.initials: S
authors.lastname: Benamar
authors.affiliation: Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) Méditerranée Infection, Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, Centre Hospitalo-Universitaire Timone, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille, Marseille, France.
authors.forename: Fabrizio
authors.initials: F
authors.lastname: Di Pinto
authors.affiliation: Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM U1095, Facultés de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.
authors.forename: Caroline
authors.initials: C
authors.lastname: Blanc-Tailleur
authors.affiliation: Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM U1095, Facultés de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France; Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) Méditerranée Infection, Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, Centre Hospitalo-Universitaire Timone, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille, Marseille, France.
authors.forename: Didier
authors.initials: D
authors.lastname: Raoult
authors.affiliation: Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM U1095, Facultés de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France; Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) Méditerranée Infection, Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, Centre Hospitalo-Universitaire Timone, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille, Marseille, France. Electronic address: bernard.la-scola@univ-amu.fr.
authors.forename: Bernard
authors.initials: B
authors.lastname: La Scola
mesh_terms: D000048:Acanthamoeba / Q000382:microbiology; D048248:Acanthamoeba castellanii / Q000382:microbiology; D002695:Chlamydiales / Q000145:classification / Q000235:genetics / Q000302:isolation & purification*; D004269:DNA, Bacterial / Q000235:genetics; D016680:Genome, Bacterial; D054884:Host-Pathogen Interactions; D017404:In Situ Hybridization, Fluorescence; D016840:Lobosea / Q000382:microbiology; D046529:Microscopy, Electron, Transmission; D012336:RNA, Ribosomal, 16S / Q000235:genetics; D012338:RNA, Ribosomal, 23S / Q000235:genetics
chemical_list: D004269:DNA, Bacterial; D012336:RNA, Ribosomal, 16S; D012338:RNA, Ribosomal, 23S
keywords: Chlamydiae; Host spectrum; Inclusion vacuoles; Protochlamydia phocaeensis; Vermamoeba vermiformis