title: Precision and prognostic value of clone-specific minimal residual disease in acute myeloid leukemia.
abstract: The genetic landscape of adult acute myeloid leukemias (AML) has been recently unraveled. However, due to their genetic heterogeneity, only a handful of markers are currently used for the evaluation of minimal residual disease (MRD). Recent studies using multi-target strategies indicate that detection of residual mutations in less than 5% of cells in complete remission is associated with a better survival. Here, in a series of 69 AMLs with known clonal architecture, we design a clone-specific strategy based on fluorescentin situhybridization and high-sensitivity next generation sequencing to detect chromosomal aberrations and mutations, respectively, in follow-up samples. The combination of these techniques allows tracking chromosomal and genomic lesions down to 0.5-0.4% of the cell population in remission samples. By testing all lesions in follow-up samples from 65 of 69 evaluable patients, we find that initiating events often persist and appear to be, on their own, inappropriate markers to predict short-term relapse. In contrast, the persistence of two or more lesions in more than 0.4% of the cells from remission samples is strongly associated with lower leukemia-free and overall survivals in univariate and multivariate analyses. Although larger prospective studies are needed to extend these results, our data show that a personalized, clone-specific, MRD follow up strategy is feasible in the vast majority of AML cases.
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Clinique et de Thérapie Cellulaire, Paris.
authors.forename: Pierre
authors.initials: P
authors.lastname: Hirsch
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Clinique et de Thérapie Cellulaire, Paris.
authors.forename: Ruoping
authors.initials: R
authors.lastname: Tang
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Biologique, Paris.
authors.forename: Nassera
authors.initials: N
authors.lastname: Abermil
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|Université de Saint Etienne, Laboratoire d'Hématologie, CHU de Saint-Etienne, Paris, France.
authors.forename: Pascale
authors.initials: P
authors.lastname: Flandrin
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.
authors.forename: Hannah
authors.initials: H
authors.lastname: Moatti
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Biologique, Paris.
authors.forename: Fabrizia
authors.initials: F
authors.lastname: Favale
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Biologique, Paris.
authors.forename: Ludovic
authors.initials: L
authors.lastname: Suner
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Laboratoire Commun de Biologie et Génétique Moléculaires, Paris, France.
authors.forename: Florence
authors.initials: F
authors.lastname: Lorre
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Biologique, Paris.
authors.forename: Christophe
authors.initials: C
authors.lastname: Marzac
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Clinique et de Thérapie Cellulaire, Paris.
authors.forename: Fanny
authors.initials: F
authors.lastname: Fava
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Clinique et de Thérapie Cellulaire, Paris.
authors.forename: Anne-Claire
authors.initials: AC
authors.lastname: Mamez
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Clinique et de Thérapie Cellulaire, Paris.
authors.forename: Simona
authors.initials: S
authors.lastname: Lapusan
authors.affiliation: AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Clinique et de Thérapie Cellulaire, Paris.
authors.forename: Françoise
authors.initials: F
authors.lastname: Isnard
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Clinique et de Thérapie Cellulaire, Paris.
authors.forename: Mohamad
authors.initials: M
authors.lastname: Mohty
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Clinique et de Thérapie Cellulaire, Paris.
authors.forename: Ollivier
authors.initials: O
authors.lastname: Legrand
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Biologique, Paris.
authors.forename: Luc
authors.initials: L
authors.lastname: Douay
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Biologique, Paris.
authors.forename: Chrystele
authors.initials: C
authors.lastname: Bilhou-Nabera
authors.affiliation: Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, APHP Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Paris francois.delhommeau@aphp.fr.|Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, GRC n°7, Groupe de Recherche Clinique sur les Myéloproliférations Aiguës et Chroniques MYPAC, Paris.|AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Service d'Hématologie Biologique, Paris.
authors.forename: François
authors.initials: F
authors.lastname: Delhommeau
mesh_terms: D000293:Adolescent; D000328:Adult; D000368:Aged; D000369:Aged, 80 and over; D000483:Alleles; D014408:Biomarkers, Tumor; D002869:Chromosome Aberrations; D060965:Clonal Evolution / Q000235:genetics*; D005260:Female; D059014:High-Throughput Nucleotide Sequencing; D006801:Humans; D017404:In Situ Hybridization, Fluorescence; D015470:Leukemia, Myeloid, Acute / Q000175:diagnosis* / Q000235:genetics* / Q000401:mortality; D008297:Male; D008875:Middle Aged; D009154:Mutation; D018365:Neoplasm, Residual / Q000175:diagnosis* / Q000235:genetics*; D057285:Precision Medicine; D011379:Prognosis; D055815:Young Adult
chemical_list: D014408:Biomarkers, Tumor