title: Comparative Genomics Analysis of a NewExiguobacteriumStrain from Salar de Huasco Reveals a Repertoire of Stress-Related Genes and Arsenic Resistance.
abstract: The Atacama Desert hosts diverse ecosystems including salt flats and shallow Andean lakes. Several heavy metals are found in the Atacama Desert, and microorganisms growing in this environment show varying levels of resistance/tolerance to copper, tellurium, and arsenic, among others. Herein, we report the genome sequence and comparative genomic analysis of a newExiguobacteriumstrain, sp. SH31, isolated from an altiplanic shallow athalassohaline lake.Exiguobacteriumsp. SH31 belongs to the phylogenetic Group II and its closest relative isExiguobacteriumsp. S17, isolated from the Argentinian Altiplano (95% average nucleotide identity). Strain SH31 encodes a wide repertoire of proteins required for cadmium, copper, mercury, tellurium, chromium, and arsenic resistance. Of the 34Exiguobacteriumgenomes that were inspected, only isolates SH31 and S17 encode the arsenic efflux pump Acr3. Strain SH31 was able to grow in up to 10 mM arsenite and 100 mM arsenate, indicating that it is arsenic resistant. Further, expression of thearsoperon andacr3was strongly induced in response to both toxics, suggesting that the arsenic efflux pump Acr3 mediates arsenic resistance inExiguobacteriumsp. SH31.
authors.affiliation: Laboratorio de Microbiología Molecular, Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andres BelloSantiago, Chile; Centro de Bioinformática y Biología Integrativa, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andrés BelloSantiago, Chile.
authors.forename: Juan
authors.initials: J
authors.lastname: Castro-Severyn
authors.affiliation: Laboratorio de Tecnologías de Membranas, Biotecnología y Medio Ambiente, Departamento de Ingeniería Química, Facultad de Ingeniería y Ciencias Geológicas, Universidad Católica del Norte Antofagasta, Chile.
authors.forename: Francisco
authors.initials: F
authors.lastname: Remonsellez
authors.affiliation: Centro de Bioinformática y Biología Integrativa, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andrés Bello Santiago, Chile.
authors.forename: Sandro L
authors.initials: SL
authors.lastname: Valenzuela
authors.affiliation: Laboratorio de Microbiología Molecular, Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andres Bello Santiago, Chile.
authors.forename: Cesar
authors.initials: C
authors.lastname: Salinas
authors.affiliation: Laboratorio de Tecnologías de Membranas, Biotecnología y Medio Ambiente, Departamento de Ingeniería Química, Facultad de Ingeniería y Ciencias Geológicas, Universidad Católica del Norte Antofagasta, Chile.
authors.forename: Jonathan
authors.initials: J
authors.lastname: Fortt
authors.affiliation: Laboratorio de Tecnologías de Membranas, Biotecnología y Medio Ambiente, Departamento de Ingeniería Química, Facultad de Ingeniería y Ciencias Geológicas, Universidad Católica del NorteAntofagasta, Chile; Laboratorio de Complejidad Microbiana y Ecología Funcional, Instituto Antofagasta and Departamento de Biotecnología, Facultad de Ciencias del Mar y Recursos Biológicos, Universidad de AntofagastaAntofagasta, Chile.
authors.forename: Pablo
authors.initials: P
authors.lastname: Aguilar
authors.affiliation: Laboratorio de Microbiología Molecular, Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andres Bello Santiago, Chile.
authors.forename: Coral
authors.initials: C
authors.lastname: Pardo-Esté
authors.affiliation: Laboratorio de Complejidad Microbiana y Ecología Funcional, Instituto Antofagasta and Departamento de Biotecnología, Facultad de Ciencias del Mar y Recursos Biológicos, Universidad de AntofagastaAntofagasta, Chile; Centre for Biotechnology and BioengineeringAntofagasta, Chile.
authors.forename: Cristina
authors.initials: C
authors.lastname: Dorador
authors.affiliation: Laboratorio de Ecofisiología Microbiana, Fundación Ciencia and Vida Santiago, Chile.
authors.forename: Raquel
authors.initials: R
authors.lastname: Quatrini
authors.affiliation: Sys2Diag CNRS/Bio-Rad UMR3145 Montpellier, France.
authors.forename: Franck
authors.initials: F
authors.lastname: Molina
authors.affiliation: Centro de Bioinformática y Biología Integrativa, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andrés BelloSantiago, Chile; Centro Interdisciplinario de Neurociencia de Valparaíso, Facultad de Ciencias, Universidad de ValparaísoValparaíso, Chile.
authors.forename: Daniel
authors.initials: D
authors.lastname: Aguayo
authors.affiliation: Centro de Bioinformática y Biología Integrativa, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andrés Bello Santiago, Chile.
authors.forename: Eduardo
authors.initials: E
authors.lastname: Castro-Nallar
authors.affiliation: Laboratorio de Microbiología Molecular, Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andres Bello Santiago, Chile.
authors.forename: Claudia P
authors.initials: CP
authors.lastname: Saavedra
keywords: Chilean Altiplano; Exiguobacterium; comparative genomics; polyextremophile; stress