Generic sample from Zea mays
Zea mays
This sample is a Genotyping-by-sequencing library with pooled individuals as described in http://www.maizegenetics.net/Table/Genotyping-By-Sequencing/. The restriction enzyme used for this library is ApeKI. Mapping between GBS barcodes and samples: (CTCC,NSL30904;TGCA,PI595535;ACTA,Ames19010;CAGA,PI535914;AACT,PI601322-1;GCGT,Ames22060;TGCGA,PI644099;CGAT,PI543847-1;CGCTT,PI543850-3;TCACC,PI547086-2;CTAGC,PI537101-1;ACAAA,PI543842-3;TTCTC,PI595570;AGCCC,PI595551;GTATT,PI221806;CTGTA,PI510674;ACCGT,PI601322-2;GTAA,Ames23425;GGTTGT,Ames22036;CCAGCT,PI543847-2;TTCAGA,PI543849-4;TAGGAA,PI547086-3;GCTCTA,PI537101-2;CCACAA,PI543845-1;GCTTA,MR14(LongfellowFlint);CTTCCA,PI340877;GAGATA,PI415080;ATGCCT,PI433487;TATTTTT,Ames23452;CTTGCTT,PI340827;ATGAAAC,Ames22055;AAAAGTT,B73;GAATTCA,PI543849-5;GAACTTC,PI547088-1;GGACCTA,PI537101-3;GTCGATT,PI543845-2;AACGCCT,NSL28968;AATATGC,Ames26778;ACGACTAC,blank;GGTGT,A131;TAGCATGC,Ames23400;AGTGGA,Ames23439;TAGGCCAT,SA24;TGCAAGGA,PI543849-1;TGGTACGT,PI543849-6;TCTCAGTC,PI547088-2;CCGGATAT,PI543841-1;CGCCTTAT,PI543845-3;AGGC,PI593011;GATC,Ames28365;TCAC,NSL32733;AGGAT,PI548794;ATTGA,Ames23413;CATCT,Ames22054;CCTAC,PI520772;GAGGA,PI543849-2;GGAAC,PI543846-4;GTCAA,PI547088-3;TAATA,PI543841-2;TACAT,PI601008-1;TCGTT,Tx325;ACCTAA,NSL437905;ATATGT,PI538235;ATCGTA,Ames27032;CATCGT,Ames27067;CGCGGT,Ames23496;CTATTA,Ames23495;GCCAGT,PI543849-3;GGAAGA,PI543846-5;GTACTT,PI543840-1;GTTGAA,PI543841-3;TAACGA,PI601008-2;TGGCTA,PI406117;ACGTGTT,Ames2325;ATTAATT,PI607521;ATTGGAT,Ames27033;CATAAGT,Ames22755;CGCTGAT,PI595367;CGGTAGA,NSL34374;CTACGGA,PI543850-1;GCGGAAT,PI543846-6;TAGCGGA,PI543840-2;TCGAAGA,PI543842-1;TCTGTGA,PI601008-3;TGCTGGA,Ames23482;AACCGAGA,PI406127;ACAGGGAA,PI343953;ACGTGGTA,PI415078;CCATGGGT,PI587138;CGCGGAGA,NSL81599;CGTGTGGT,Ames24746;GCTGTGGA,PI543850-2;GGATTGGT,PI547086-1;GTGAGGGT,PI543840-3;TATCGGGA,PI543842-2;TTCCTGGA,NSL32722;CTCC,NSL30904;TGCA,PI595535;ACTA,Ames19010;CAGA,PI535914;AACT,PI601322-1;GCGT,Ames22060;TGCGA,PI644099;CGAT,PI543847-1;CGCTT,PI543850-3;TCACC,PI547086-2;CTAGC,PI537101-1;ACAAA,PI543842-3;TTCTC,PI595570;AGCCC,PI595551;GTATT,PI221806;CTGTA,PI510674;ACCGT,PI601322-2;GTAA,Ames23425;GGTTGT,Ames22036;CCAGCT,PI543847-2;TTCAGA,PI543849-4;TAGGAA,PI547086-3;GCTCTA,PI537101-2;CCACAA,PI543845-1;GCTTA,MR14(LongfellowFlint);CTTCCA,PI340877;GAGATA,PI415080;ATGCCT,PI433487;TATTTTT,Ames23452;CTTGCTT,PI340827;ATGAAAC,Ames22055;AAAAGTT,B73;GAATTCA,PI543849-5;GAACTTC,PI547088-1;GGACCTA,PI537101-3;GTCGATT,PI543845-2;AACGCCT,NSL28968;AATATGC,Ames26778;ACGACTAC,blank;GGTGT,A131;TAGCATGC,Ames23400;AGTGGA,Ames23439;TAGGCCAT,SA24;TGCAAGGA,PI543849-1;TGGTACGT,PI543849-6;TCTCAGTC,PI547088-2;CCGGATAT,PI543841-1;CGCCTTAT,PI543845-3;AGGC,PI593011;GATC,Ames28365;TCAC,NSL32733;AGGAT,PI548794;ATTGA,Ames23413;CATCT,Ames22054;CCTAC,PI520772;GAGGA,PI543849-2;GGAAC,PI543846-4;GTCAA,PI547088-3;TAATA,PI543841-2;TACAT,PI601008-1;TCGTT,Tx325;ACCTAA,NSL437905;ATATGT,PI538235;ATCGTA,Ames27032;CATCGT,Ames27067;CGCGGT,Ames23496;CTATTA,Ames23495;GCCAGT,PI543849-3;GGAAGA,PI543846-5;GTACTT,PI543840-1;GTTGAA,PI543841-3;TAACGA,PI601008-2;TGGCTA,PI406117;ACGTGTT,Ames2325;ATTAATT,PI607521;ATTGGAT,Ames27033;CATAAGT,Ames22755;CGCTGAT,PI595367;CGGTAGA,NSL34374;CTACGGA,PI543850-1;GCGGAAT,PI543846-6;TAGCGGA,PI543840-2;TCGAAGA,PI543842-1;TCTGTGA,PI601008-3;TGCTGGA,Ames23482;AACCGAGA,PI406127;ACAGGGAA,PI343953;ACGTGGTA,PI415078;CCATGGGT,PI587138;CGCGGAGA,NSL81599;CGTGTGGT,Ames24746;GCTGTGGA,PI543850-2;GGATTGGT,PI547086-1;GTGAGGGT,PI543840-3;TATCGGGA,PI543842-2;TTCCTGGA,NSL32722;CTCC,NSL30904;TGCA,PI595535;ACTA,Ames19010;CAGA,PI535914;AACT,PI601322-1;GCGT,Ames22060;TGCGA,PI644099;CGAT,PI543847-1;CGCTT,PI543850-3;TCACC,PI547086-2;CTAGC,PI537101-1;ACAAA,PI543842-3;TTCTC,PI595570;AGCCC,PI595551;GTATT,PI221806;CTGTA,PI510674;ACCGT,PI601322-2;GTAA,Ames23425;GGTTGT,Ames22036;CCAGCT,PI543847-2;TTCAGA,PI543849-4;TAGGAA,PI547086-3;GCTCTA,PI537101-2;CCACAA,PI543845-1;GCTTA,MR14(LongfellowFlint);CTTCCA,PI340877;GAGATA,PI415080;ATGCCT,PI433487;TATTTTT,Ames23452;CTTGCTT,PI340827;ATGAAAC,Ames22055;AAAAGTT,B73;GAATTCA,PI543849-5;GAACTTC,PI547088-1;GGACCTA,PI537101-3;GTCGATT,PI543845-2;AACGCCT,NSL28968;AATATGC,Ames26778;ACGACTAC,blank;GGTGT,A131;TAGCATGC,Ames23400;AGTGGA,Ames23439;TAGGCCAT,SA24;TGCAAGGA,PI543849-1;TGGTACGT,PI543849-6;TCTCAGTC,PI547088-2;CCGGATAT,PI543841-1;CGCCTTAT,PI543845-3;AGGC,PI593011;GATC,Ames28365;TCAC,NSL32733;AGGAT,PI548794;ATTGA,Ames23413;CATCT,Ames22054;CCTAC,PI520772;GAGGA,PI543849-2;GGAAC,PI543846-4;GTCAA,PI547088-3;TAATA,PI543841-2;TACAT,PI601008-1;TCGTT,Tx325;ACCTAA,NSL437905;ATATGT,PI538235;ATCGTA,Ames27032;CATCGT,Ames27067;CGCGGT,Ames23496;CTATTA,Ames23495;GCCAGT,PI543849-3;GGAAGA,PI543846-5;GTACTT,PI543840-1;GTTGAA,PI543841-3;TAACGA,PI601008-2;TGGCTA,PI406117;ACGTGTT,Ames2325;ATTAATT,PI607521;ATTGGAT,Ames27033;CATAAGT,Ames22755;CGCTGAT,PI595367;CGGTAGA,NSL34374;CTACGGA,PI543850-1;GCGGAAT,PI543846-6;TAGCGGA,PI543840-2;TCGAAGA,PI543842-1;TCTGTGA,PI601008-3;TGCTGGA,Ames23482;AACCGAGA,PI406127;ACAGGGAA,PI343953;ACGTGGTA,PI415078;CCATGGGT,PI587138;CGCGGAGA,NSL81599;CGTGTGGT,Ames24746;GCTGTGGA,PI543850-2;GGATTGGT,PI547086-1;GTGAGGGT,PI543840-3;TATCGGGA,PI543842-2;TTCCTGGA,NSL32722;CTCC,NSL30904;TGCA,PI595535;ACTA,Ames19010;CAGA,PI535914;AACT,PI601322-1;GCGT,Ames22060;TGCGA,PI644099;CGAT,PI543847-1;CGCTT,PI543850-3;TCACC,PI547086-2;CTAGC,PI537101-1;ACAAA,PI543842-3;TTCTC,PI595570;AGCCC,PI595551;GTATT,PI221806;CTGTA,PI510674;ACCGT,PI601322-2;GTAA,Ames23425;GGTTGT,Ames22036;CCAGCT,PI543847-2;TTCAGA,PI543849-4;TAGGAA,PI547086-3;GCTCTA,PI537101-2;CCACAA,PI543845-1;GCTTA,MR14(LongfellowFlint);CTTCCA,PI340877;GAGATA,PI415080;ATGCCT,PI433487;TATTTTT,Ames23452;CTTGCTT,PI340827;ATGAAAC,Ames22055;AAAAGTT,B73;GAATTCA,PI543849-5;GAACTTC,PI547088-1;GGACCTA,PI537101-3;GTCGATT,PI543845-2;AACGCCT,NSL28968;AATATGC,Ames26778;ACGACTAC,blank;GGTGT,A131;TAGCATGC,Ames23400;AGTGGA,Ames23439;TAGGCCAT,SA24;TGCAAGGA,PI543849-1;TGGTACGT,PI543849-6;TCTCAGTC,PI547088-2;CCGGATAT,PI543841-1;CGCCTTAT,PI543845-3;AGGC,PI593011;GATC,Ames28365;TCAC,NSL32733;AGGAT,PI548794;ATTGA,Ames23413;CATCT,Ames22054;CCTAC,PI520772;GAGGA,PI543849-2;GGAAC,PI543846-4;GTCAA,PI547088-3;TAATA,PI543841-2;TACAT,PI601008-1;TCGTT,Tx325;ACCTAA,NSL437905;ATATGT,PI538235;ATCGTA,Ames27032;CATCGT,Ames27067;CGCGGT,Ames23496;CTATTA,Ames23495;GCCAGT,PI543849-3;GGAAGA,PI543846-5;GTACTT,PI543840-1;GTTGAA,PI543841-3;TAACGA,PI601008-2;TGGCTA,PI406117;ACGTGTT,Ames2325;ATTAATT,PI607521;ATTGGAT,Ames27033;CATAAGT,Ames22755;CGCTGAT,PI595367;CGGTAGA,NSL34374;CTACGGA,PI543850-1;GCGGAAT,PI543846-6;TAGCGGA,PI543840-2;TCGAAGA,PI543842-1;TCTGTGA,PI601008-3;TGCTGGA,Ames23482;AACCGAGA,PI406127;ACAGGGAA,PI343953;ACGTGGTA,PI415078;CCATGGGT,PI587138;CGCGGAGA,NSL81599;CGTGTGGT,Ames24746;GCTGTGGA,PI543850-2;GGATTGGT,PI547086-1;GTGAGGGT,PI543840-3;TATCGGGA,PI543842-2;TTCCTGGA,NSL32722;CTCC,NSL30904;TGCA,PI595535;ACTA,Ames19010;CAGA,PI535914;AACT,PI601322-1;GCGT,Ames22060;TGCGA,PI644099;CGAT,PI543847-1;CGCTT,PI543850-3;TCACC,PI547086-2;CTAGC,PI537101-1;ACAAA,PI543842-3;TTCTC,PI595570;AGCCC,PI595551;GTATT,PI221806;CTGTA,PI510674;ACCGT,PI601322-2;GTAA,Ames23425;GGTTGT,Ames22036;CCAGCT,PI543847-2;TTCAGA,PI543849-4;TAGGAA,PI547086-3;GCTCTA,PI537101-2;CCACAA,PI543845-1;GCTTA,MR14(LongfellowFlint);CTTCCA,PI340877;GAGATA,PI415080;ATGCCT,PI433487;TATTTTT,Ames23452;CTTGCTT,PI340827;ATGAAAC,Ames22055;AAAAGTT,B73;GAATTCA,PI543849-5;GAACTTC,PI547088-1;GGACCTA,PI537101-3;GTCGATT,PI543845-2;AACGCCT,NSL28968;AATATGC,Ames26778;ACGACTAC,blank;GGTGT,A131;TAGCATGC,Ames23400;AGTGGA,Ames23439;TAGGCCAT,SA24;TGCAAGGA,PI543849-1;TGGTACGT,PI543849-6;TCTCAGTC,PI547088-2;CCGGATAT,PI543841-1;CGCCTTAT,PI543845-3;AGGC,PI593011;GATC,Ames28365;TCAC,NSL32733;AGGAT,PI548794;ATTGA,Ames23413;CATCT,Ames22054;CCTAC,PI520772;GAGGA,PI543849-2;GGAAC,PI543846-4;GTCAA,PI547088-3;TAATA,PI543841-2;TACAT,PI601008-1;TCGTT,Tx325;ACCTAA,NSL437905;ATATGT,PI538235;ATCGTA,Ames27032;CATCGT,Ames27067;CGCGGT,Ames23496;CTATTA,Ames23495;GCCAGT,PI543849-3;GGAAGA,PI543846-5;GTACTT,PI543840-1;GTTGAA,PI543841-3;TAACGA,PI601008-2;TGGCTA,PI406117;ACGTGTT,Ames2325;ATTAATT,PI607521;ATTGGAT,Ames27033;CATAAGT,Ames22755;CGCTGAT,PI595367;CGGTAGA,NSL34374;CTACGGA,PI543850-1;GCGGAAT,PI543846-6;TAGCGGA,PI543840-2;TCGAAGA,PI543842-1;TCTGTGA,PI601008-3;TGCTGGA,Ames23482;AACCGAGA,PI406127;ACAGGGAA,PI343953;ACGTGGTA,PI415078;CCATGGGT,PI587138;CGCGGAGA,NSL81599;CGTGTGGT,Ames24746;GCTGTGGA,PI543850-2;GGATTGGT,PI547086-1;GTGAGGGT,PI543840-3;TATCGGGA,PI543842-2;TTCCTGGA,NSL32722;CTCC,NSL30904;TGCA,PI595535;ACTA,Ames19010;CAGA,PI535914;AACT,PI601322-1;GCGT,Ames22060;TGCGA,PI644099;CGAT,PI543847-1;CGCTT,PI543850-3;TCACC,PI547086-2;CTAGC,PI537101-1;ACAAA,PI543842-3;TTCTC,PI595570;AGCCC,PI595551;GTATT,PI221806;CTGTA,PI510674;ACCGT,PI601322-2;GTAA,Ames23425;GGTTGT,Ames22036;CCAGCT,PI543847-2;TTCAGA,PI543849-4;TAGGAA,PI547086-3;GCTCTA,PI537101-2;CCACAA,PI543845-1;GCTTA,MR14(LongfellowFlint);CTTCCA,PI340877;GAGATA,PI415080;ATGCCT,PI433487;TATTTTT,Ames23452;CTTGCTT,PI340827;ATGAAAC,Ames22055;AAAAGTT,B73;GAATTCA,PI543849-5;GAACTTC,PI547088-1;GGACCTA,PI537101-3;GTCGATT,PI543845-2;AACGCCT,NSL28968;AATATGC,Ames26778;ACGACTAC,blank;GGTGT,A131;TAGCATGC,Ames23400;AGTGGA,Ames23439;TAGGCCAT,SA24;TGCAAGGA,PI543849-1;TGGTACGT,PI543849-6;TCTCAGTC,PI547088-2;CCGGATAT,PI543841-1;CGCCTTAT,PI543845-3;AGGC,PI593011;GATC,Ames28365;TCAC,NSL32733;AGGAT,PI548794;ATTGA,Ames23413;CATCT,Ames22054;CCTAC,PI520772;GAGGA,PI543849-2;GGAAC,PI543846-4;GTCAA,PI547088-3;TAATA,PI543841-2;TACAT,PI601008-1;TCGTT,Tx325;ACCTAA,NSL437905;ATATGT,PI538235;ATCGTA,Ames27032;CATCGT,Ames27067;CGCGGT,Ames23496;CTATTA,Ames23495;GCCAGT,PI543849-3;GGAAGA,PI543846-5;GTACTT,PI543840-1;GTTGAA,PI543841-3;TAACGA,PI601008-2;TGGCTA,PI406117;ACGTGTT,Ames2325;ATTAATT,PI607521;ATTGGAT,Ames27033;CATAAGT,Ames22755;CGCTGAT,PI595367;CGGTAGA,NSL34374;CTACGGA,PI543850-1;GCGGAAT,PI543846-6;TAGCGGA,PI543840-2;TCGAAGA,PI543842-1;TCTGTGA,PI601008-3;TGCTGGA,Ames23482;AACCGAGA,PI406127;ACAGGGAA,PI343953;ACGTGGTA,PI415078;CCATGGGT,PI587138;CGCGGAGA,NSL81599;CGTGTGGT,Ames24746;GCTGTGGA,PI543850-2;GGATTGGT,PI547086-1;GTGAGGGT,PI543840-3;TATCGGGA,PI543842-2;TTCCTGGA,NSL32722;CTCC,NSL30904;TGCA,PI595535;ACTA,Ames19010;CAGA,PI535914;AACT,PI601322-1;GCGT,Ames22060;TGCGA,PI644099;CGAT,PI543847-1;CGCTT,PI543850-3;TCACC,PI547086-2;CTAGC,PI537101-1;ACAAA,PI543842-3;TTCTC,PI595570;AGCCC,PI595551;GTATT,PI221806;CTGTA,PI510674;ACCGT,PI601322-2;GTAA,Ames23425;GGTTGT,Ames22036;CCAGCT,PI543847-2;TTCAGA,PI543849-4;TAGGAA,PI547086-3;GCTCTA,PI537101-2;CCACAA,PI543845-1;GCTTA,MR14(LongfellowFlint);CTTCCA,PI340877;GAGATA,PI415080;ATGCCT,PI433487;TATTTTT,Ames23452;CTTGCTT,PI340827;ATGAAAC,Ames22055;AAAAGTT,B73;GAATTCA,PI543849-5;GAACTTC,PI547088-1;GGACCTA,PI537101-3;GTCGATT,PI543845-2;AACGCCT,NSL28968;AATATGC,Ames26778;ACGACTAC,blank;GGTGT,A131;TAGCATGC,Ames23400;AGTGGA,Ames23439;TAGGCCAT,SA24;TGCAAGGA,PI543849-1;TGGTACGT,PI543849-6;TCTCAGTC,PI547088-2;CCGGATAT,PI543841-1;CGCCTTAT,PI543845-3;AGGC,PI593011;GATC,Ames28365;TCAC,NSL32733;AGGAT,PI548794;ATTGA,Ames23413;CATCT,Ames22054;CCTAC,PI520772;GAGGA,PI543849-2;GGAAC,PI543846-4;GTCAA,PI547088-3;TAATA,PI543841-2;TACAT,PI601008-1;TCGTT,Tx325;ACCTAA,NSL437905;ATATGT,PI538235;ATCGTA,Ames27032;CATCGT,Ames27067;CGCGGT,Ames23496;CTATTA,Ames23495;GCCAGT,PI543849-3;GGAAGA,PI543846-5;GTACTT,PI543840-1;GTTGAA,PI543841-3;TAACGA,PI601008-2;TGGCTA,PI406117;ACGTGTT,Ames2325;ATTAATT,PI607521;ATTGGAT,Ames27033;CATAAGT,Ames22755;CGCTGAT,PI595367;CGGTAGA,NSL34374;CTACGGA,PI543850-1;GCGGAAT,PI543846-6;TAGCGGA,PI543840-2;TCGAAGA,PI543842-1;TCTGTGA,PI601008-3;TGCTGGA,Ames23482;AACCGAGA,PI406127;ACAGGGAA,PI343953;ACGTGGTA,PI415078;CCATGGGT,PI587138;CGCGGAGA,NSL81599;CGTGTGGT,Ames24746;GCTGTGGA,PI543850-2;GGATTGGT,PI547086-1;GTGAGGGT,PI543840-3;TATCGGGA,PI543842-2;TTCCTGGA,NSL32722;)
strain
pooled